患者和小鼠MI后PCSK5表达分析
验证PCSK5在MI后心脏和血浆中的表达变化及细胞来源。
分析公共RNA-seq数据集,检测MI患者左心室组织和血浆PCSK5水平,免疫荧光和Western blot检测小鼠MI后心脏不同区域和细胞类型中PCSK5表达。
PCSK5 promotes angiogenesis and cardiac repair after myocardial infarction.
含体外细胞、小鼠MI/HLI模型、患者样本及snRNA-seq,并有功能与机制验证
人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 人冠状动脉内皮细胞(HCAECs) 小鼠心肌梗死模型 小鼠后肢缺血模型
内皮特异性Pcsk5敲除小鼠(Pcsk5ECKO)与Pcsk5WT同窝对照,MI后28天检测心功能和毛细血管/小动脉密度 AAV-EC-Pcsk5(1×10^12 vg/只,尾静脉注射)与AAV-Ctrl小鼠,注射2周后诱导MI 司美格鲁肽60 μg/kg皮下注射每日给药,MI后28天评估心功能和血管密度 PCSK5催化残基Arg158和Asn164突变(PCSK5mut)或缺失(PCSK5Δ158–164aa)对VEGFA切割和内皮成管的影响 AMI患者血浆PCSK5水平(28例)与健康对照(30例)的ELISA检测及6个月随访心功能ROC分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证PCSK5在MI后心脏和血浆中的表达变化及细胞来源。
分析公共RNA-seq数据集,检测MI患者左心室组织和血浆PCSK5水平,免疫荧光和Western blot检测小鼠MI后心脏不同区域和细胞类型中PCSK5表达。
探究内皮细胞Pcsk5缺失对MI后血管生成和心脏功能的影响。
构建Pcsk5ECKO小鼠,诱导MI,检测心功能、梗死面积、心肌细胞凋亡和血管密度。
评估内皮细胞过表达PCSK5对MI后心脏修复的治疗潜力。
使用AAV-EC-Pcsk5或AAV-Ctrl尾静脉注射,2周后诱导MI,检测心功能、梗死面积、心肌细胞凋亡和血管密度。
验证PCSK5是否通过VEGFA信号通路促进血管生成。
检测MI后小鼠血浆VEGFA水平、心脏ERK1/2磷酸化水平,体外检测PCSK5对HUVECs成管、迁移、增殖和VEGFA切割的影响,并使用VEGFA中和抗体bevacizumab阻断实验。
确定PCSK5切割VEGFA的关键氨基酸残基。
构建PCSK5突变体(PCSK5mut和PCSK5Δ158–164aa),检测其切割VEGFA和激活ERK1/2的能力,以及对内皮细胞成管、迁移和增殖的影响。
探究MI后PCSK5上调的转录调控机制。
通过siRNA敲低ETS1、FOXK2、PBX2,检测对PCSK5表达的影响;荧光素酶报告基因和ChIP-qPCR验证ETS1结合PCSK5启动子;检测VEGFA对PCSK5表达的剂量和时间依赖性影响。
评估司美格鲁肽是否通过上调PCSK5增强血管生成。
体外检测司美格鲁肽对HUVECs中PCSK5表达和血管生成的影响,以及PCSK5敲低对司美格鲁肽效应的影响;体内给予司美格鲁肽治疗MI小鼠,检测心功能和血管密度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 小鼠基因型鉴定 | 他莫昔芬 | MCE | HY-13757A |
| 小鼠MI后药物治疗 | 司美格鲁肽 | MCE | HY-114118 |
| 组织染色 | Masson三色染色试剂盒 | Yeasen | 60532ES74 |
| 免疫荧光染色 | CD31抗体 | Abcam | ab28364 |
| α-SMA抗体 | Abcam | ab5694 | |
| PCSK5抗体 | Invitrogen | PA5-98039 | |
| VE-钙黏蛋白抗体 | R&D | AF1002 | |
| ETS1抗体 | Proteintech | 66598-1-Ig | |
| 生物素化Isolectin B4 | Vector Laboratories | B-1205 | |
| 细胞培养 | 内皮细胞培养基 | Sciencell | 1001 |
| DMEM培养基 | Invitrogen | 12800082 | |
| 胎牛血清 | Invitrogen | 10099-141 | |
| 青霉素和链霉素 | Invitrogen | 15140122 | |
| 内皮细胞分离 | Dynabeads羊抗大鼠IgG | Invitrogen | 11035 |
| 大鼠抗小鼠CD31抗体 | BD Pharmingen | 553370 | |
| IV型胶原酶 | Invitrogen | 17104019 | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Vazyme Biotech | R411-01 |
| 逆转录 | Rever Tra Ace qPCR逆转录试剂盒 | Toyobo | FSQ-101 |
| qPCR | ChamQ Universal SYBR qPCR预混液 | Vazyme Biotech | Q711 |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | MCE | HY-K0010 | |
| PCSK5抗体 | Abcam | ab39873 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| 磷酸化ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| ETS1抗体 | Cell Signaling Technology | 14069 | |
| 磷酸化ETS1抗体 | Bioss | bs-13113R | |
| VEGFA抗体 | Proteintech | 19003-1-AP | |
| FLAG抗体 | GenScript | A00187 | |
| 山羊抗兔IgG | Invitrogen | 31460 | |
| 山羊抗小鼠IgG | Invitrogen | 31430 | |
| ChIP | Protein A/G PLUS琼脂糖珠 | Santa Cruz | sc-2003 |
| 蛋白酶K | Yeasen | 10401ES60 | |
| 核糖核酸酶A | Thermo Fisher | EN0531 | |
| 细胞迁移实验 | Transwell小室(8微米孔径) | Corning | 3422 |
| 结晶紫 | Yeasen | 60506ES60 | |
| 成管实验 | 基质胶 | Corning | 356234 |
| ELISA | 人VEGFA ELISA试剂盒 | ABclonal | RK00023 |
| 小鼠VEGFA ELISA试剂盒 | ABclonal | RK00028 | |
| 人GLP-1 ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology | E-EL-H6025 | |
| 未包被辅助试剂盒 | ABclonal | RK04587 | |
| PCSK5捕获抗体 | CUSABIO | CSB-PA017644LA01HU | |
| 荧光素酶实验 | 荧光素酶检测试剂盒 | Promega | E1500 |
| 蛋白纯化 | 抗FLAG G1亲和树脂 | GenScript | L00432 |
| FLAG肽 | Beyotime | P9801 | |
| snRNA-seq | Shbio细胞核分离试剂盒 | SHBIO | 52009-10 |
| Chromium单细胞3′文库和凝胶珠试剂盒v3 | 10× Genomics | -- | |
| TUNEL检测 | TUNEL BrightRed凋亡检测试剂盒 | Vazyme Biotech | A113-03 |
| EdU检测 | Click-it EdU 594成像试剂盒 | Beyotime | C0078 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠MI模型构建与分组 | 小鼠品系、周龄、性别、LAD结扎位置、假手术对照设置 阅读提示:Methods中Myocardial infarction小节及图2A、图8A |
| 内皮特异性Pcsk5敲除小鼠诱导 | 他莫昔芬剂量(100 mg/kg)、给药途径(尾静脉)、给药频率(隔天一次共4次)、诱导时周龄(6周) 阅读提示:Methods中Animals小节及图S3A、B |
| AAV-EC-Pcsk5过表达 | AAV血清型(AAV9)、启动子(Icam2)、病毒剂量(1×10^12 vg/只)、注射途径(尾静脉)、注射与MI间隔时间(2周) 阅读提示:Methods中Animals小节及图2G |
| 司美格鲁肽给药 | 剂量(60 μg/kg)、给药途径(皮下注射)、给药频率(每日)、给药起始时间(MI后) 阅读提示:Methods中Myocardial infarction小节及图8A |
| 体外PCSK5切割VEGFA实验 | 重组蛋白浓度(100 μg/mL)、孵育温度(37°C)、孵育时间(6小时) 阅读提示:Methods中In vitro digestions of VEGFA with PCSK5小节及图5E |
| 患者血浆PCSK5检测 | AMI患者样本量(28例)、健康对照样本量(30例)、采血时间点(PCI术前)、ELISA方法 阅读提示:Methods中Human samples小节及图1C |