人声带损伤单细胞图谱构建与氧化应激靶点识别
解析声带损伤的细胞类型特异性病理机制并寻找治疗靶点。
对2例正常和4例炎症人声带组织进行10× Genomics scRNA-seq,注释细胞类型,进行ROS通路评分和GO富集分析,并用免疫荧光检测MMP3。
Redox-regulated in situ-forming hydrogel informed by single-cell transcriptomics for functional restoration of injured vocal folds.
含人声带scRNA-seq、体外细胞氧化应激模型、离体兔喉振动模型及兔在体损伤模型,并进行功能与机制验证
人正常与炎症声带组织(scRNA-seq) 16HBE人支气管上皮细胞及原代人声带上皮细胞 兔声带电灼伤模型 离体兔喉发声振动平台
人声带样本:正常2例、炎症(Reinke水肿)4例,伦理批号2022-800 16HBE氧化应激模型:100 μM H2O2处理24 h,设Control、H2O2、SO+TA4、SO+TA8组 水凝胶配方:SIS-ADH与OHA体积比7:1,TA浓度上限8 μM,室温2秒内成胶 兔声带损伤:电灼30 W、每侧5 s,伤后1、4、8周取样评估 RNA-seq:伤后7天取Sham、Control、SO+TA8组组织,每组n=3
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
解析声带损伤的细胞类型特异性病理机制并寻找治疗靶点。
对2例正常和4例炎症人声带组织进行10× Genomics scRNA-seq,注释细胞类型,进行ROS通路评分和GO富集分析,并用免疫荧光检测MMP3。
构建可在声带表面快速原位成胶并具备抗氧化和黏附性能的材料。
通过SIS-ADH与OHA的席夫碱交联并引入TA制备水凝胶,表征成胶时间、孔隙率、流变学、自愈合、XPS、Zeta电位和FTIR。
验证材料在声带动态振动和高湿环境下的适用性及药物释放行为。
进行搭接剪切黏附测试、猪皮形变黏附测试、流变频率扫描、离体兔喉振动保留测试,以及体外和体内TA释放检测。
评估材料安全性及其对氧化应激下上皮细胞存活、增殖和迁移的保护作用。
在16HBE细胞和原代声带上皮细胞中进行活/死染色、CCK-8、Transwell和划痕实验,并检测DPPH、ABTS、超氧阴离子清除和过氧化氢酶活性。
明确水凝胶是否通过线粒体途径和NRF2抗氧化通路发挥抗凋亡作用。
采用DCFH-DA、Annexin V-FITC/7-AAD、JC-1、MitoSOX、8-OHdG、TOM70/细胞色素c共定位、TEM和Western blot检测ROS、凋亡、线粒体功能和凋亡/抗氧化蛋白表达。
验证水凝胶在体内促进上皮再生、抑制纤维化和恢复声带功能的效果。
建立兔声带电灼伤模型,局部应用水凝胶,于1、4、8周进行喉镜、H&E、PCNA、TUNEL、Masson、COL-1和α-SMA染色,并检测肺组织安全性。
确认结构修复是否转化为功能恢复,并阐明水凝胶在体分子机制。
采用离体兔喉振动平台结合高速成像和声学分析评估声门面积、振动振幅、jitter和shimmer;对伤后7天组织进行RNA-seq、GSEA和RT-qPCR验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 单细胞测序 | 10x Genomics平台 | -- | -- |
| Illumina HiSeq 2500测序仪 | Illumina | -- | |
| DNA提取 | 动物组织/细胞基因组DNA提取试剂盒 | Solarbio | D1700 |
| SIS-ADH制备 | 己二酸二酰肼 | Aladdin | A109760 |
| 1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐 | Aladdin | E106172 | |
| 透析袋(截留分子量3500 Da) | Solarbio | YA1078 | |
| 游离氨基含量检测试剂盒 | Beyotime | S0584S | |
| OHA制备 | 透明质酸 | Macklin | H909935 |
| 材料表征 | S-800扫描电子显微镜 | Hitachi | -- |
| Nicolet 6700傅里叶变换红外光谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 流变学分析 | Physica MCR302旋转流变仪 | Anton Paar | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Yeasen | 40203ES80 |
| 活/死细胞染色 | 活/死细胞染色试剂盒 | Yeasen | 40747ES76 |
| 细胞内ROS检测 | DCFH-DA探针 | Solarbio | CA410 |
| 8-OHdG免疫荧光 | 抗8-OHdG抗体 | Abcam | ab62623 |
| 凋亡检测 | FITC Annexin V凋亡检测试剂盒(含7-AAD) | BioLegend | 640922 |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1线粒体膜电位检测试剂盒 | Yeasen | 40706ES60 |
| 线粒体ROS检测 | MitoSOX红色线粒体超氧化物指示剂 | Thermo Fisher Scientific | M36008 |
| 免疫荧光 | 抗TOM70抗体 | Proteintech | 14528-1-AP |
| 抗细胞色素c抗体 | Proteintech | 66264-1-Ig | |
| Western blot | 抗BCL-2抗体 | ABclonal | A0208 |
| 抗BAX抗体 | ABclonal | A0207 | |
| 抗Caspase-3抗体 | Abcam | ab32351 | |
| 抗Cleaved caspase-3抗体 | Abcam | ab2302 | |
| 抗NRF2抗体 | Cell Signaling Technology | 12721 T | |
| 抗HO-1抗体 | ABclonal | A1346 | |
| 抗NQO1抗体 | ABclonal | A1518 | |
| 免疫组织化学 | 抗PCNA单克隆抗体 | Abcam | ab29 |
| TUNEL检测 | 一步法TUNEL原位凋亡检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A320 |
| 免疫组织化学 | 抗I型胶原抗体 | Servicebio | GB11022-3 |
| 抗α-SMA抗体 | HUABIO | SY02-64 | |
| RNA提取 | 总RNA提取试剂盒 | Yeason | 19221ES50 |
| 逆转录 | 逆转录试剂盒 | TAKARA | RR092A |
| RT-qPCR | TB Green(无ROX) | TaKaRa | RR820A |
| 流式细胞术 | BD FACS Aria III流式细胞仪 | BD | -- |
| 荧光成像 | Nikon Ti2倒置荧光显微镜 | Nikon | -- |
| Nikon TiA1-N-STORM超分辨显微镜 | Nikon | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人声带scRNA-seq样本 | 正常2例、炎症4例的来源与纳入标准;伦理批号2022-800 阅读提示:Methods患者与样本信息及Supplementary Data 1 |
| 水凝胶配方与成胶 | SIS-ADH/OHA体积比7:1;TA浓度4或8 μM;室温成胶<2 s;ADH与SIS质量比1:1 阅读提示:Methods水凝胶制备及Supplementary Fig. 4–7 |
| 细胞氧化应激模型 | 16HBE培养条件;H2O2终浓度100 μM、处理24 h;分组与提取液处理方式 阅读提示:Methods细胞相容性及16HBE氧化应激模型建立 |
| 兔声带损伤与分组 | 电灼30 W、每侧5 s;Sham、Control、Sinus®、SO、SO+TA8分组;1、4、8周取样 阅读提示:Methods兔声带损伤模型构建及Fig. 8a |
| 功能评估与RNA-seq | 伤后8周高速成像与声学分析参数;RNA-seq伤后7天取样、每组n=3、RIN>7.0 阅读提示:Methods高速视频成像及RNA测序与数据分析 |