AAD中VSMC CSE表达检测
验证AAD中VSMCs的CSE表达是否改变
对人AAD主动脉组织、AngII诱导Apoe-/-小鼠主动脉进行免疫荧光,对HASMCs和mASMCs给予AngII处理后检测CSE mRNA与蛋白
Chromobox 3 assembles an epigenetic complex contributing to cystathionine γ-lyase-mediated protection against aortic aneurysm/dissection.
涵盖人AAD样本、两种AngII小鼠模型、VSMC体外实验及机制验证,含功能与机制验证
人AAD患者主动脉组织 AngII诱导的Apoe-/-小鼠AAD模型 CseSMCKO小鼠两种AngII诱导AAD模型 原代小鼠主动脉平滑肌细胞及HASMCs
VSMC特异性Cse敲除小鼠在两种AngII模型中的AAD发生率、死亡率、主动脉直径与弹性蛋白降解 Cse敲除VSMCs中ADAMTS4表达与versican裂解产物V1水平 Cbx3敲低/过表达对ADAMTS4和versican裂解的调控 CBX3与SUV39H1、KDM2A、HDAC1、RING1的Co-IP相互作用 CBX3 C69、C160、C177硫化位点突变对蛋白稳定性及H3K9me3/ac的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证AAD中VSMCs的CSE表达是否改变
对人AAD主动脉组织、AngII诱导Apoe-/-小鼠主动脉进行免疫荧光,对HASMCs和mASMCs给予AngII处理后检测CSE mRNA与蛋白
确定VSMC中Cse缺失对AAD发生的功能作用
在AAV8-Pcsk9+Paigen饮食+AngII模型和BAPN+AngII模型中比较CseSMCKO与CseLOXP小鼠的AAD发生率、死亡率、主动脉直径和弹性蛋白降解
明确CSE对ECM蛋白酶及versican降解的调控
对AngII刺激的Cse敲除VSMCs进行RNA-seq和qRT-PCR,Western blot检测ADAMTS4与versican裂解,并在小鼠模型及人AAD组织中验证
确定CBX3是否为Adamts4的转录抑制因子
在VSMCs中用siRNA敲低Cbx3或Ezh2、过表达Cbx3,检测Adamts4表达与versican裂解,并在体内验证CBX3表达
验证恢复Cbx3能否减轻Cse缺失导致的AAD
将负载AAV9-sm22α-Cbx3的胶原海绵血管外载体植入肾动脉上方,1周后以BAPN+AngII诱导AAD,检测AAD发生率、主动脉扩张、弹性蛋白、versican、ADAMTS4、凋亡与巨噬细胞浸润
解析CBX3介导的组蛋白修饰及复合物组成
Western blot和免疫荧光检测H3K9me3/ac、H3K4me3/ac、H3K27me3;ChIP-seq与ChIP-qPCR定位靶基因;IP-质谱及Co-IP验证CBX3相互作用蛋白
阐明CSE/H₂S稳定CBX3的翻译后修饰机制
双硫键转换实验检测CBX3硫化,定点突变C69/C160/C177,环己酰亚胺追踪降解,MG-132及泛素化检测
评估局部过表达Cse或Cbx3对AAD的疗效
Apoe-/-小鼠植入负载AAV9-sm22α-Cse或AAV9-sm22α-Cbx3的胶原海绵载体,1周后AngII输注4周,检测AAD表型与分子指标
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | Paigen饮食 | Research Diets | D12109C |
| 标准实验室饲料 | Jiangsu Xietong Pharmaceutical Bio-engineering | XT93G | |
| 血管紧张素II | Sigma | A9525 | |
| 微型渗透泵 | Alzet, Durect Corporation | Model 2004 | |
| 重组腺相关病毒8型 | WZ Biosciences Inc. | -- | |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | Gibco | 10099141 C |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| 平滑肌细胞专用培养基 | ScienCell Research Laboratories | 1101 | |
| 蛋白提取与Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | R0010 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 | |
| 硝酸纤维素膜 | Millipore | HATF00010 | |
| 抗CBX3抗体 | Abcam | ab217999 | |
| 抗ADAMTS4抗体 | Abcam | ab185722 | |
| 抗versican抗体 | Abcam | ab19345 | |
| 抗CSE抗体 | Abcam | ab151769 | |
| 抗H3K9me3抗体 | abcam | ab8898 | |
| 抗H3K9ac抗体 | Abcam | ab32129 | |
| 抗H3K4me3抗体 | Abcam | ab8580 | |
| 抗H3K4ac抗体 | Abcam | ab176799 | |
| 抗H3K27me3抗体 | Abcam | ab6002 | |
| 抗SUV39H1抗体 | CST | D11B6 | |
| 抗RING1抗体 | Abcam | ab180170 | |
| 抗KDM2A抗体 | Abcam | ab191387 | |
| 抗HDAC1抗体 | Abcam | ab280198 | |
| 抗GAPDH抗体 | Beyotime | Af2823 | |
| RNA提取与RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026CN |
| 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Thermo Scientific | K1622 | |
| SYBR Green PCR预混液试剂盒 | Yeasen Biotechnology | 11201ES08 | |
| siRNA与质粒转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | L3000075 |
| 免疫荧光染色 | Triton X-100 | Sigma | X100 |
| 4′,6-二脒基-2-苯基吲哚 | Sigma | D9542 | |
| 抗α-SMA抗体 | Abcam | ab7817 | |
| 组织学分析 | 醛品红染色液试剂盒 | Solarbio | G1594 |
| Masson三色染色试剂盒 | Sigma-Aldrich | HT15-1KT | |
| 一步法TUNEL原位凋亡检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A321 | |
| ChIP-seq与ChIP-qPCR | Diagenode Bioruptor超声破碎仪 | Diagenode | -- |
| Illumina NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- | |
| Co-IP | Dynabeads蛋白G磁珠 | Invitrogen | 10004D |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| 生物素转换实验 | 二硫苏糖醇 | Thermo Fisher Scientific | R0861 |
| 甲基硫代甲磺酸甲酯 | Sigma | 64306 | |
| 生物素-HPDP | Thermo Fisher Scientific | 21341 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| VSMC特异性Cse敲除AAD模型 | 小鼠品系(CseLOXP×Tagln-Cre、Apoe-/-)、性别与周龄(雄性8–10周)、两种模型诱导方式(AAV8-Pcsk9+Paigen+AngII;BAPN+AngII)、AngII剂量1000 ng/kg/min、BAPN 150 mg/kg/day、建模4周、样本量 阅读提示:Methods的Animal study and AAD models小节及Fig. 2图注 |
| AAV9载体局部递送 | 载体(AAV9-sm22α-Cse/Cbx3/GFP)、剂量5×10¹¹基因组拷贝/50 μl、植入部位(膈肌与右肾动脉之间腹主动脉)、植入后1周开始AngII输注、分组与样本量 阅读提示:Methods的Extravascular stent implantation小节及Fig. 5、Fig. 10图注 |
| VSMC体外处理与转染 | 细胞来源(原代野生型与Cse-/- mASMCs、HASMCs、HEK293T)、代次(3–8代)、AngII浓度1 μM与时间24 h、siRNA 200 nM、质粒2 μg、转染后48 h检测 阅读提示:Methods的Primary culture、HASMCs培养及siRNA与质粒转染小节,Fig. 1、Fig. 3图注 |
| CBX3硫化与稳定性检测 | NaHS 1 mM、DTT浓度(细胞2 mM、组织100 mM)、处理时间(细胞24 h、组织37 °C 1 h)、双硫键转换实验步骤、C69/C160/C177突变位点 阅读提示:Methods的Biotin switch assay小节及Fig. 9图注 |
| ChIP-seq与ChIP-qPCR | AngII 1 μM预处理、交联条件(1%甲醛10 min)、染色质片段200–500 bp、抗体用量5 μg/反应、测序平台与数据编号GSE296864 阅读提示:Methods的ChIP-seq and ChIP-qPCR小节及Fig. 7图注 |
| 组织学与免疫荧光检测 | 弹性蛋白降解分级(1–4分)、抗体稀释比例、TUNEL与CD68/MMP2/MMP9检测终点 阅读提示:Methods的Histological and immunohistochemical analyses小节及相关图注 |