临床样本与动物模型中asprosin表达检测
明确asprosin是否参与病理性心肌肥大
检测高血压心衰患者与非心衰患者血浆asprosin水平及其与NT-proBNP、EF的相关性;检测TAC和ISO小鼠心脏及血浆asprosin表达。
YY1/Asprosin/PFKP axis regulates glycolytic metabolic and exacerbates pathological cardiac hypertrophy.
含患者血浆样本、NMCMs及HEK-293T体外模型、TAC与Ang II动物模型,并有Co-IP、泛素化、ChIP等机制验证
高血压心衰患者血浆样本 原代新生小鼠心肌细胞(NMCMs) TAC及Ang II诱导的小鼠心肌肥大模型 HEK-293T细胞
AAV9尾静脉注射剂量2×10^11 v.g./只,TAC术前3周给予 Ang II处理NMCMs终浓度2μM,处理48h MG132浓度50μM处理6h用于泛素化检测 CHX浓度100ng/mL用于PFKP半衰期检测 TAC术后4周行超声心动图检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确asprosin是否参与病理性心肌肥大
检测高血压心衰患者与非心衰患者血浆asprosin水平及其与NT-proBNP、EF的相关性;检测TAC和ISO小鼠心脏及血浆asprosin表达。
验证asprosin对病理性心肌肥大的因果作用
尾静脉注射AAV9-cTnT-Asprosin或AAV9-cTnT-shFBN1,行TAC手术,检测心功能、心重比、组织学和标志基因。
验证asprosin对心肌细胞糖酵解通量和线粒体呼吸的影响
在Ang II诱导的NMCMs肥大模型中过表达或敲低asprosin,检测ECAR、OCR、葡萄糖摄取、乳酸分泌、ATP含量和线粒体膜电位。
寻找asprosin调控糖酵解的下游靶蛋白
Co-IP联合质谱筛选asprosin互作蛋白,通过Co-IP、免疫荧光共定位、His-pulldown及结构域截短和突变验证asprosin与PFKP直接结合。
阐明asprosin上调PFKP蛋白的翻译后修饰机制
检测asprosin对PFKP蛋白和mRNA水平的影响,CHX和MG132处理检测PFKP稳定性与泛素化,鉴定DTX3L为PFKP的E3泛素连接酶并验证asprosin竞争性抑制DTX3L-PFKP结合。
验证PFKP是asprosin促心肌肥大的下游关键节点
心肌细胞特异性敲低PFKP观察TAC小鼠表型;在shFBN1基础上过表达PFKP,检测心功能、纤维化、糖酵解及PDK4-PDH轴变化。
阐明病理性刺激下asprosin表达上调的上游机制
数据库预测FBN1启动子转录因子,ChIP和双荧光素酶报告基因验证YY1结合FBN1启动子−1022至−1011bp并调控asprosin表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 心肌细胞分离 | EDTA | Meilunbio | MA0232 |
| 免疫荧光鉴定心肌细胞 | 抗α-actinin抗体 | Genetex | GTX11007 |
| H&E染色 | H&E染色试剂盒 | Solarbio | G1120 |
| Masson染色 | Masson染色试剂盒 | Solarbio | G1340 |
| WGA染色 | 小麦胚芽凝集素 | Invitrogen | W11261 |
| 内源性过氧化物酶封闭液 | Elabscience | E-IR-R115 | |
| 柠檬酸钠抗原修复液 | Solarbio | C1032 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Beyotime | P0011 | |
| SDS-PAGE蛋白上样缓冲液(5X) | Beyotime | P0015 | |
| 硝酸纤维素膜 | LABSELECT | TM-NC-R-22 | |
| 抗Asprosin抗体 | Finetest | FNab09797 | |
| 抗β-MHC抗体 | Proteintech | 22280-1-AP | |
| 抗ANP抗体 | Affinity | DF6497 | |
| 抗PFKP抗体 | Proteintech | 13389-1-AP | |
| 抗PFKP抗体 | Proteintech | 68129-1-Ig | |
| 抗DTX3L抗体 | Abclonal | A18551 | |
| 抗HA抗体 | Proteintech | 81290-1-RR | |
| 抗Flag抗体 | Proteintech | 66008-4-Ig | |
| 抗Myc抗体 | Proteintech | 16286-1-AP | |
| PDK4抗体 | Proteintech | 12949-1-AP | |
| 磷酸化PDH抗体 | Abcam | ab177461 | |
| PDH抗体 | Proteintech | 18068-1-AP | |
| PFKL抗体 | Genetex | GTX105697 | |
| PFKM抗体 | Proteintech | 55028-1-AP | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| 抗α-Tubulin抗体 | Finetest | FNab0033 | |
| 抗His抗体 | Proteintech | 66005-1-Ig | |
| 抗FBN1抗体 | Immunoway | YT1684 | |
| 抗泛素抗体 | Abcam | Ab134953 | |
| 荧光标记抗兔IgG二抗 | LI-COR Bio-Science | 926-32211 | |
| 荧光标记抗鼠IgG二抗 | LI-COR Bio-Science | 926-32210 | |
| Odyssey红外成像系统 | LI-COR | Odyssey CLx 9140 | |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596018CN |
| 逆转录试剂盒 | Toyobo | FSQ-101 | |
| SYBR qPCR预混液 | Toyobo | QPX-201 | |
| NanoDrop 8000分光光度计 | ThermoFisher | -- | |
| Quant Studio™ 6 Flex实时PCR系统 | ABI | -- | |
| ChIP | ChIP检测试剂盒 | Beyotime | P2078 |
| 37%甲醛 | Sigma-Aldrich | F8775 | |
| 甘氨酸 | Solarbio | 56-40-6 | |
| PMSF | Beyotime | ST505 | |
| 抗YY1抗体 | CST | 46395 | |
| 抗KLF4抗体 | Proteintech | 11880-1-Ap | |
| DNA纯化试剂盒 | Beyotime | D0033 | |
| DEPC水 | Solarbio | R1600 | |
| ELISA | asprosin酶联免疫吸附检测试剂盒 | Finetest | EM1707 |
| 代谢物检测 | 乙酰辅酶A检测试剂盒 | Elabscience | E-EL-0125 |
| ATP检测试剂盒 | Abbkine | KTB1016 | |
| PDH活性检测 | PDH活性微孔板检测试剂盒 | Abbkine | KTB1270 |
| NMCMs分离培养 | 0.25%胰酶-EDTA | Beyotime | C0201 |
| II型胶原酶 | Gibco | 17101015 | |
| DMEM培养基 | Gibco | C11885500BT | |
| 胎牛血清 | Gibco | A5256701 | |
| 青霉素-链霉素 | Seven | SC118 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine™ 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668030 |
| 免疫荧光染色 | Triton-X100 | Sigma-Aldrich | T8787 |
| 山羊血清 | Boster | AR0009 | |
| Alexa-Fluor 594/488标记抗兔/鼠IgG抗体 | Abbkine | A23410, A23420, A23220, A23210 | |
| DAPI | Beyotime | C1005 | |
| 荧光显微镜 | Olympus | FV300 | |
| RNA-seq | NEBNext® Ultra™ RNA文库构建试剂盒 | NEB | -- |
| Agilent Bioanalyzer 2100系统 | Agilent | -- | |
| Co-IP | Pierce™免疫沉淀试剂盒 | Thermo Scientific | 26149 |
| 泛素化检测 | MG132 | MCE | HY-13259 |
| Protein A/G磁珠 | MCE | HY-K0202 | |
| LC-MS/MS | RIPA裂解液 | ThermoFisher | 89901 |
| 考马斯亮蓝快速染色液 | Beyotime | P0017 | |
| 乳酸和葡萄糖检测 | 乳酸检测试剂盒 | Abbkine | KTB1100 |
| 葡萄糖检测 | 葡萄糖检测试剂盒 | Beyotime | S0201S |
| 葡萄糖摄取检测 | 葡萄糖摄取检测试剂盒 | Dojindo | UP02 |
| 线粒体膜电位检测 | TMRE染色试剂 | Beyotime | C2001S |
| Seahorse代谢检测 | Seahorse XFe 96细胞能量代谢分析系统 | Agilent | -- |
| Seahorse XF细胞线粒体压力测试试剂盒 | Agilent Technologies | 103015-100 | |
| Seahorse XF糖酵解压力测试试剂盒 | Agilent Technologies | 103020-100 | |
| 双荧光素酶报告基因检测 | 双荧光素酶系统试剂盒 | Promega | E1910 |
| His-pulldown | Pierce™ PolyHis蛋白下拉试剂盒 | Thermo Scientific | 21277 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 患者分组依据(高血压心衰伴心肌肥厚vs正常成人)、样本量(n=20、27)、纳入排除标准 阅读提示:Methods中Human clinical samples小节及Table S1 |
| 动物TAC模型 | 小鼠品系、周龄、性别、麻醉剂量(戊巴比妥钠60mg/kg)、TAC术后4周检测时间点 阅读提示:Methods中Mouse TAC model and echocardiography小节 |
| AAV9体内干预 | 病毒血清型、剂量(2×10^11 v.g./只)、注射途径、TAC术前3周给药时间点 阅读提示:Methods中Animal adeno-associated virus (AAV)-treatment小节 |
| NMCMs体外处理 | Ang II终浓度2μM、处理48h、转染质粒量2000ng或siRNA 50μM 阅读提示:Methods中Isolation and culture of primary neonatal mouse cardiomyocytes及Cell culture and treatment小节 |
| 泛素化与蛋白稳定性检测 | MG132 50μM处理6h、CHX 100ng/mL、免疫沉淀用抗体 阅读提示:Methods中Ubiquitylation assays小节及Fig. 5图注 |
| Seahorse代谢检测 | ECAR与OCR检测试剂盒货号、加药顺序(葡萄糖、oligomycin、2-DG、FCCP、Rot&AA) 阅读提示:Methods中Seahorse小节及Fig. 3图注 |