建立血管内损伤模型并监测免疫细胞动态
确认血管内损伤后动脉免疫细胞的时空募集特征
采用导丝损伤小鼠股动脉模型,在损伤后0-28天收集动脉组织,通过H&E染色、免疫荧光和流式细胞术分析CD45+免疫细胞浸润;在D0、D2、D7进行scRNA-seq和多色流式细胞术
Perivascular mesenchymal cells instruct ST2+ reparative macrophages to promote endovascular injury-induced neointimal hyperplasia in mice.
包含scRNA-seq、流式细胞术、多种基因敲除小鼠模型、体外细胞实验、人体样本验证及功能与机制验证
小鼠股动脉导丝损伤模型 Cx3cr1GFP、Cx3cr1CreER等基因工程小鼠 原代MSC与BMDM MOVAS平滑肌细胞系 HUVEC和bEND.3内皮细胞系 临床患者血浆样本
小鼠品系与基因型:C57BL/6雄性7-8周龄;Cx3cr1GFP、Cx3cr1CreER、Rosa26-iDTR、PdgfrbCreER、Il33flox/flox-eGFP、Lyz2Cre、Il1rl1flox/flox 股动脉损伤模型:0.25 mm导丝插入5-10 mm,留置3分钟 Ki20227给药:40 mg/kg口服,D0-D2或D4-D6连续给药 他莫昔芬给药:50 mg/kg腹腔注射,PdgfrbCreER连续5天;Cx3cr1CreER术前2天及术后1、7、14天 水凝胶siRNA递送:20% Pluronic F127,30 μg siRNA/50 μL,术后局部给药
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认血管内损伤后动脉免疫细胞的时空募集特征
采用导丝损伤小鼠股动脉模型,在损伤后0-28天收集动脉组织,通过H&E染色、免疫荧光和流式细胞术分析CD45+免疫细胞浸润;在D0、D2、D7进行scRNA-seq和多色流式细胞术
确定CX3CR1+动脉巨噬细胞对损伤诱导新内膜形成的作用
使用Cx3cr1GFP报告小鼠和抗CX3CR1抗体鉴定巨噬细胞来源;构建Cx3cr1CreER;Rosa26-iDTR(MacΔ)小鼠,通过他莫昔芬和DT清除CX3CR1+细胞,评估D28新内膜形成
区分损伤后炎症性和修复性巨噬细胞亚群,并验证其对VSMC增殖的作用
scRNA-seq聚类鉴定4个巨噬细胞亚群,通过流式细胞术验证LY6C+(InfMAC)和LY6C-CD63+CD72+(RepMAC)亚群;使用CSF1R抑制剂Ki20227在D0-D3或D4-D7分阶段清除巨噬细胞,检测炎症基因和增殖相关基因表达、EdU+ VSMC及新内膜形成
鉴定损伤后动脉MSC亚群及其与免疫细胞的相互作用
scRNA-seq鉴定MSC1和MSC2亚群,分析Pdpn表达和通路富集;流式分选PDGFRβ+PDPN+ MSC进行bulk RNA-seq;CellChat分析配体-受体互作
确定损伤后MSC中IL-33上调的分子机制
bulk RNA-seq鉴定Il33为MSC中上调最显著的分泌因子;使用损伤内皮细胞条件培养基(CM_Inj)处理MSC,通过煮沸和10 kDa过滤分级、JSH23抑制p65、siRela敲低及ChIP-qPCR验证NFκB对Il33的转录调控
确定MSC特异性IL-33缺失对动脉免疫重塑和新内膜形成的影响
构建PdgfrbCreER;Il33loxp/loxp(Pb-Il33KO)小鼠,他莫昔芬诱导敲除,D7流式分析免疫细胞组成和RepMAC数量,D28评估新内膜;局部水凝胶递送siIl33验证
确定ST2+巨噬细胞介导IL-33促VSMC增殖和新内膜形成
检测动脉Il1rl1表达和ST2+免疫细胞;构建Lyz2Cre;Il1rl1loxP/loxP(Mac-Il1rl1KO)小鼠,评估D28新内膜和D7 VSMC增殖;体外用IL-33处理BMDM条件培养基刺激VSMC
确定OPN是IL-33激活的ST2+巨噬细胞促进VSMC增殖的关键效应因子
CellChat分析巨噬细胞-VSMC配体受体互作;检测Spp1/OPN在动脉巨噬细胞中的表达;siSpp1敲低巨噬细胞后制备条件培养基刺激VSMC;水凝胶递送siSpp1体内验证
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 阿佛丁 | Sigma | 75-80-9 |
| 股动脉损伤模型 | CROSS-IT 200XT导丝 | Abbott Laboratories | 1003313H |
| 巨噬细胞清除 | Ki20227 | Selleck | 7688 |
| 基因敲除诱导 | 他莫昔芬 | Sigma | 10540-29-1 |
| 玉米油 | Aladdin | 8001-30-7 | |
| 巨噬细胞清除 | 白喉毒素 | Aladdin | D381867 |
| 水凝胶siRNA递送 | Pluronic F127 | Sigma | P2443 |
| VSMC增殖检测 | EdU | Beyotime | ST067 |
| EdU检测 | BeyoClick EdU细胞增殖检测试剂盒 | Beyotime | C0075 |
| 动脉细胞消化 | I型胶原酶 | Gibco | 17018029 |
| 牛血清白蛋白 | Solarbio | A8020 | |
| Hank平衡盐溶液 | Biosharp | BL559A | |
| 红细胞裂解 | 红细胞裂解液 | Biolegend | 420301 |
| 流式分析 | CD45-BV510抗体 | Biolegend | 103138 |
| CD3-AF488抗体 | Biolegend | 100210 | |
| CD4-eF450抗体 | Invitrogen | 48-0041-82 | |
| CD8a-AF700抗体 | BD Biosciences | 557959 | |
| B220-BV605抗体 | Biolegend | 103244 | |
| NK1.1-APC抗体 | Biolegend | 108710 | |
| CD11b-PerCP/Cyanine5.5抗体 | Biolegend | 101228 | |
| F4/80-APC/Cy7抗体 | Biolegend | 123118 | |
| CD11c-Dazzle594抗体 | Biolegend | 117348 | |
| I-A/I-E-BV711抗体 | Biolegend | 107643 | |
| LY6C-PE抗体 | Biolegend | 128008 | |
| LY6G-PerCP抗体 | Biolegend | 127653 | |
| ST2-PE-Cyanine7抗体 | Invitrogen | 25-9335-80 | |
| CD117-BV785抗体 | Biolegend | 105841 | |
| CD127-BV650抗体 | Biolegend | 135043 | |
| CD206-BV421抗体 | Biolegend | 141717 | |
| CD11b-BV421抗体 | Biolegend | 101236 | |
| F4/80-APC抗体 | Biolegend | 123116 | |
| CX3CR1-PerCP/Cyanine5.5抗体 | Biolegend | 19010 | |
| CD45-PerCP/Cyanine5.5抗体 | Biolegend | 103132 | |
| CD31-PerCP/Cyanine5.5抗体 | Biolegend | 102420 | |
| PDGFRβ-PE抗体 | Biolegend | 13600 | |
| PDGFRβ-PE-Cyanine7抗体 | Invitrogen | 25-1402-8 | |
| SCA1-PE-Cyanine7抗体 | Biolegend | 108113 | |
| OPN-PE抗体 | R&D | IC808P | |
| Ki67-FITC抗体 | Biolegend | 652410 | |
| 细胞内染色 | Foxp3染色试剂盒 | eBioscience | 00-5523-00 |
| 细胞内脂质检测 | BODIPY 493/503 | Thermo Fisher | D3922 |
| 细胞内OPN染色 | 布雷菲德菌素A | MCE | HY-16592 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher | 15596018CN |
| cDNA合成 | PrimeScript RT试剂盒(含gDNA Eraser) | Takara | RR047A |
| qPCR | TB Green PCR试剂 | Takara | RR420A |
| 蛋白质提取 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma | P8340 |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 |
| SuperSignal West Pico化学发光底物 | Thermo Fisher | 34580 | |
| Immobilon Western化学发光HRP底物 | Millipore | WBKLS0100 | |
| P65抗体 | Aclonal | A22676 | |
| 磷酸化P65抗体 | Aclonal | AP1294 | |
| β-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2128S | |
| IKKα/β抗体 | Cell Signaling Technology | 96794 | |
| 磷酸化IKKα/β抗体 | Cell Signaling Technology | 2697 | |
| 免疫荧光 | 抗原修复液Tris-EDTA | Servicebio | G1206 |
| 山羊血清 | Thermo Fisher | 16210064 | |
| Triton X-100 | Solarbio | 9002-93-1 | |
| 含DAPI的抗荧光淬灭封片剂 | Solarbio | S2110 | |
| αSMA抗体 | Abcam | ab7817 | |
| CD45抗体 | Abcam | ab208022 | |
| IL-33抗体 | Abcam | ab187060 | |
| MAC2抗体 | Cedarlane | CL8942AP | |
| BMDM制备 | Ficoll-Paque PLUS介质 | Cytiva | 17144003 |
| BMDM培养 | 巨噬细胞集落刺激因子 | PeproTech | 315-02 |
| 细菌培养皿 | Corning | 351029 | |
| MSC分离 | D型胶原酶 | Roche | 11088882001 |
| MSC分选 | PDGFRβ-PE抗体 | Biolegend | 136006 |
| 条件培养基制备 | Vivaspin蛋白浓缩离心柱 | Cytiva | 11668019 |
| ChIP | Protein G Sepharose 4 Fast Flow | GE Healthcare Bio-sciences | 17-0618-01 |
| 抗p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| RNase | Roche | 11119915001 | |
| 蛋白酶K | ThermoFisher Scientific | EO0491 | |
| bulk RNA-seq | SMARTer超低RNA试剂盒 | Takara | 634936 |
| TruePrep DNA文库构建试剂盒V2 | Vazyme | TD503-02 | |
| scRNA-seq | DAPI | Biosharp | BL105A |
| ELISA | 人IL33 ELISA试剂盒 | Multi sciences | EK133 |
| 人OPN ELISA试剂盒 | Multi Sciences | EK1135 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 股动脉损伤模型 | 小鼠品系、周龄、性别;导丝型号和直径;插入深度和留置时间;麻醉剂及剂量 阅读提示:Methods中Mouse studies小节及Fig. 1a图注 |
| 巨噬细胞清除 | Ki20227剂量、给药途径、给药时间窗口(D0-D2或D4-D6);DT剂量和给药时间点;他莫昔芬剂量和给药方案 阅读提示:Methods中Mouse studies小节及Fig. 2k,m、Fig. 1m图注 |
| 流式细胞术分析 | 各抗体克隆号、荧光标记和稀释比例;门控策略;细胞活力门 阅读提示:Methods中流式细胞术小节、Supplementary Fig. 9及Supplementary Table 5 |
| scRNA-seq | 每个时间点混合小鼠数量;细胞活力阈值;测序平台和试剂盒版本;数据分析参数 阅读提示:Methods中Single-cell RNA sequencing and analyses小节及Fig. 1c图注 |
| 水凝胶siRNA递送 | Pluronic F127浓度;siRNA用量和体积;给药部位和时机;siRNA序列 阅读提示:Methods中Mouse studies小节及Fig. 5n、Fig. 7o图注 |
| 条件培养基实验 | IL-33处理浓度和时间;内皮细胞损伤方式;CM收集和稀释比例;煮沸和过滤条件 阅读提示:Methods中Cellular assays小节及Fig. 4h、Fig. 7a图注 |
| ChIP-qPCR | 交联条件;超声片段大小;抗体用量;引物序列 阅读提示:Methods中Cellular assays小节及Fig. 4r图注 |
| 人体样本研究 | 患者纳入和排除标准;ISR定义;样本量和分组;伦理批号 阅读提示:Methods中Human study小节及Supplementary Table 3 |