建立并表征Trp53缺失TNBC同基因模型
确认模型免疫微环境特征,筛选富含TAM的模型用于后续治疗研究
使用T12、2151R、T11、2336R和2208L同基因模型,通过IMC分析肿瘤细胞、CD8+T细胞、F4/80+TAM和S100A8/9+中性粒细胞等标志物
Anti-CSF-1R therapy with combined immuno-chemotherapy coordinate an adaptive immune response to eliminate macrophage enriched triple negative breast cancers.
包含多种Trp53缺失TNBC同基因小鼠模型、体外TAM实验、scRNA-seq、IMC、流式及患者队列数据分析,并含功能与机制验证
Trp53缺失TNBC同基因小鼠模型T12、2151R、T11、2336R和2208L BALB/c雌性小鼠尾静脉注射肺转移模型 BALB/c雌性小鼠门静脉注射肝转移模型 AURORA临床TNBC患者原发灶与肺、肝转移灶转录组数据集
SNDX-ms6352初始剂量40 mg/kg、后续20 mg/kg,每周腹腔注射一次,共4周 环磷酰胺100 mg/kg,每周腹腔注射一次,最多4周 抗PD-1抗体200 µg/只,每3天腹腔注射一次 尾静脉注射30,000个T12细胞建立肺转移;门静脉注射3,000-5,000个T12细胞建立肝转移 第28天停止治疗,第56天评估复发;维持剂量组持续给予抗PD-1
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认模型免疫微环境特征,筛选富含TAM的模型用于后续治疗研究
使用T12、2151R、T11、2336R和2208L同基因模型,通过IMC分析肿瘤细胞、CD8+T细胞、F4/80+TAM和S100A8/9+中性粒细胞等标志物
验证CSF-1R抑制联合低剂量CTX能否延长生存并诱导完全缓解
在多个同基因模型中原位移植肿瘤,给予IgG对照、SNDX-ms6352、CTX或联合治疗,监测肿瘤体积和生存;对完全缓解小鼠进行肿瘤细胞再挑战
明确联合治疗引起的免疫细胞组成和细胞因子变化
对治疗后T12和2151R原发肿瘤进行scRNA-seq(CellPlex多重标记),分析免疫细胞亚群和基因表达;检测血浆及肿瘤裂解液细胞因子
验证联合治疗对已建立肺转移的长期疗效及免疫微环境改变
尾静脉注射T12细胞建立肺转移,BrdU标记确认转移灶;给予单药、双药或三联治疗,监测生存和体重;IMC分析转移灶免疫微环境
验证三联方案联合抗PD-1维持剂量对已建立肝转移的长期疗效
门静脉注射T12细胞建立肝转移,PET/CT确认转移灶;给予单药、双药或三联治疗,监测生存和体重;IMC和IHC分析免疫微环境
确认治疗诱导的系统性适应性抗肿瘤免疫
对完全缓解小鼠进行乳腺肿瘤细胞再挑战;分离脾脏CD3+T细胞进行过继性T细胞转移(ACT)至T12荷瘤小鼠,联合或不联合单剂抗PD-1
验证小鼠模型转移灶免疫特征与患者转移灶的一致性
分析AURORA临床研究(GSE209998)TNBC原发灶、肺转移和肝转移转录组数据,比较免疫细胞特征和巨噬细胞标志物表达
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | SNDX-ms6352 | Syndax Pharmaceuticals, Inc. | -- |
| 环磷酰胺 | Sigma-Aldrich | PHR1404-1G | |
| InVivoMab小鼠IgG1同型对照 | Bio X Cell | BE0083 | |
| RecombiMab抗小鼠PD1 | BioXcell | CP151 | |
| RecombiMAb抗小鼠IgG2a同型对照 | BioXcell | CP150 | |
| 肿瘤消化 | I型胶原酶 | Sigma-Aldrich | 11088793001 |
| DNase | Sigma-Aldrich | 11284932001 | |
| BrdU标记 | 溴脱氧尿苷 | Sigma-Aldrich | B-5002 |
| 细胞培养 | DMEM/F-12培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11330032 |
| 胎牛血清 | GenDEPOT | F0900-050 | |
| 胰岛素 | Sigma-Aldrich | I-5500 | |
| 氢化可的松 | Sigma-Aldrich | H0888 | |
| 表皮生长因子 | Sigma-Aldrich | SRP3196 | |
| 抗生素-抗真菌剂 | Thermo Fisher Scientific | 15240062 | |
| 通用支原体检测试剂盒 | ATCC | 30-1012 K | |
| TAM分离 | 小鼠CD11b阳性选择磁珠 | STEMCELL Technologies | 18970 |
| EasySep磁铁 | STEMCELL Technologies | 18000 | |
| TAM培养 | 无谷氨酰胺RPMI-1640 | Thermo Fisher Scientific | 21870076 |
| L-谷氨酰胺 | Thermo Fisher Scientific | 25030081 | |
| 小鼠M-CSF | Biolegend | 576406 | |
| MEM非必需氨基酸溶液 | Thermo Fisher Scientific | 11140050 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| Immobilon PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| 抗CSF-1R抗体 | Cell Signaling Technology | 43390 | |
| 抗CD206/MRC1抗体 | Cell Signaling Technology | 24595 | |
| 山羊抗兔IgG HRP | Invitrogen | 31460 | |
| 免疫组化 | 抗F4/80抗体 | Cell Signaling Technology | 70076 |
| 抗S100A8抗体 | R&D Systems | MAB3059 | |
| 抗CD8α抗体 | Cell Signaling Technology | 98941 | |
| 抗CD4抗体 | Abcam | ab183685 | |
| 免疫荧光 | 抗BrdU抗体 | Abcam | ab6326 |
| 抗Cleaved Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| 抗CD20抗体 | Cell Signaling Technology | 70168 | |
| 抗CSF-1R/M-CSF-R抗体 | Cell Signaling Technology | 43390 | |
| DAPI | Invitrogen | R37606 | |
| 细胞因子检测 | 小鼠细胞因子/趋化因子44重检测阵列 | Eve Technologies Corp. | MD44 |
| IMC | Interculator-Ir | Standard Biotools | -- |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD16/CD32抗体 | BioLegend | 101320 |
| Live/Dead可固定黄色染料 | Invitrogen | L34968 | |
| F4/80-APC抗体 | BioLegend | 123115 | |
| scRNA-seq | Ghost Dye UV 450 | Tonbo Biosciences | 13-0868 |
| 3’ CellPlex条形码寡核苷酸 | 10X Genomics | PN-1000262 | |
| ACT | 脾脏解离培养基 | STEMCELL Technologies | 07915 |
| EasySEP小鼠T细胞分离试剂盒 | STEMCELL Technologies | 19851 | |
| PET/CT | 氟-18标记氟脱氧葡萄糖 | Sofie | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 原发肿瘤联合治疗 | SNDX-ms6352剂量方案(首剂40 mg/kg,后续20 mg/kg,每周一次共4周)、CTX 100 mg/kg每周一次共4周、第28天停止治疗 阅读提示:Methods中In vivo treatments小节及Fig. 1C治疗示意图 |
| 肺转移模型建立与治疗 | 尾静脉注射30,000个T12细胞、注射后12天分组、抗PD-1 200 µg/只每3天一次、维持剂量给药方案 阅读提示:Methods中Tail vein injection and portal vein injection小节、In vivo treatments小节及Fig. 2A、Fig. 3A、Fig. 4A |
| 肝转移模型建立与治疗 | 门静脉注射3,000-5,000个T12细胞、注射后15天分组、PET/CT确认转移、抗PD-1维持剂量至第56天 阅读提示:Methods中Portal vein injection小节及Fig. 5A、Fig. 6A |
| scRNA-seq | 每治疗组3只小鼠、治疗10天后取样、CellPlex多重标记、测序平台NovaSeq 6000 阅读提示:Methods中Single-cell RNA-sequencing小节及Fig. 1G |
| IMC分析 | 抗体面板组成(Pan-CK、CD44、F4/80、S100A8/9、PD-L1、Ki67、CD4、CD8a、Vimentin、PD-1)、聚类参数maxK=20 阅读提示:Methods中Imaging mass cytometry小节及Supplementary table 4 |
| ACT实验 | 供体小鼠为经56天治疗并排斥再挑战的T12肝转移荷瘤小鼠、T细胞经尾静脉转移、联合抗PD-1 200 µg/只 阅读提示:Methods中Adoptive T cell transfer小节及Fig. 6I |