患者肿瘤队列中MLH1亚细胞定位与预后分析
评估MLH1完全缺失与细胞质定位在乳腺癌患者中的频率及其与内分泌治疗结局的关联。
对IEO队列1022例乳腺癌肿瘤活检进行MLH1免疫组化,按细胞质、核、缺失分类,并与内分泌治疗后进展时间进行关联分析;对部分肿瘤进行微卫星不稳定性检测。
Aberrant cytoplasmic localization of MLH1 characterizes a cell population that seeds breast cancer recurrence.
包含患者肿瘤队列免疫组化、多组PDX及类器官、细胞系突变模型、体内移植瘤及亚克隆混合移植实验,并验证Chk2/CDK4/6机制。
ER+/HER2-乳腺癌患者肿瘤活检队列(IEO数据集) ER+/HER2-乳腺癌PDX及其类器官(HCI、BCM、ST) MCF7与T47D细胞系MLH1突变/敲低模型 裸鼠乳腺脂肪垫MCF7移植瘤模型
MLH1亚细胞定位分组标准:核定位为>5%细胞核阳性;细胞质定位为<5%核阳性且>10%细胞质阳性 内分泌治疗药物浓度:fulvestrant与tamoxifen在细胞实验中使用100 nM MLH1G55V与MLH1WT细胞按1:9比例混合用于亚克隆实验 小鼠移植瘤:每只注射5–7×10⁶ MCF7细胞,肿瘤达约100–150 mm³时随机分组 fulvestrant体内给药剂量为250 mg/kg体重;palbociclib为70 mg/kg/day饲料给药
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估MLH1完全缺失与细胞质定位在乳腺癌患者中的频率及其与内分泌治疗结局的关联。
对IEO队列1022例乳腺癌肿瘤活检进行MLH1免疫组化,按细胞质、核、缺失分类,并与内分泌治疗后进展时间进行关联分析;对部分肿瘤进行微卫星不稳定性检测。
验证细胞质MLH1在实验模型中的频率及其与内分泌治疗敏感性的关系。
对来自HCI、BCM和ST三个独立PDX队列进行MLH1免疫荧光筛选,并建立PDX来源类器官,在fulvestrant或tamoxifen处理下进行离体生长实验。
建立可操控的细胞质MLH1模型,并确定其定位改变与MLH1-PMS2结合的关系。
在稳定表达shMLH1的MCF7和T47D细胞中回补sh抗性MLH1突变体或野生型,通过免疫荧光和细胞核质分离western blot评估MLH1定位;通过免疫共沉淀评估MLH1与PMS2结合;用siRNA敲低PMS2验证其对MLH1定位的影响。
检验细胞质MLH1是否因果性导致内分泌治疗抵抗及雌激素非依赖生长。
在2D生长、3D球体和裸鼠乳腺脂肪垫移植瘤模型中,比较MLH1WT与MLH1G55V细胞对fulvestrant、tamoxifen及雌激素剥夺的反应。
模拟患者肿瘤中的亚克隆结构,检验细胞质MLH1细胞是否在内分泌干预下选择性扩增。
将GFP标记的MLH1G55V细胞与未标记MLH1WT细胞按1:9混合,进行流式细胞术、2D/3D生长及裸鼠移植瘤实验,追踪GFP+细胞比例变化。
确定细胞质MLH1是否通过削弱Chk2激活导致G1/S阻滞失败,并产生CDK4/6依赖。
在细胞和移植瘤中检测pChk2与PCNA;使用Chk2激活剂DIM验证功能 rescue;用siRNA敲低CDK6并检测CDK4/6抑制剂palbociclib和abemaciclib的敏感性;在PDX及类器官中验证细胞质MLH1与pChk2的相关性及CDK4/6抑制剂反应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Lonza Mycoalert Plus支原体检测试剂盒 | Lonza | LT07-710 |
| 转染 | JetPrime PolyPlus转染试剂 | PolyPlus | -- |
| 药物处理 | 4-羟基他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | H7904 |
| 氟维司群 | Sigma-Aldrich | I4409 | |
| β-雌二醇 | Sigma-Aldrich | E8875 | |
| 动物实验 | 17β-雌二醇 | Sigma | E2758 |
| Chk2激活 | 3,3'-二吲哚甲烷 | Santa Cruz Biotechnology | sc-204624 |
| 药物处理 | 阿贝西利 | SelleckChem | S7158 |
| 哌柏西利 | SelleckChem | S1116 | |
| 免疫荧光 | MLH1抗体 | Millipore sigma | M8320 |
| 磷酸化Chk2抗体 | Cell Signaling Technology | 2197 | |
| PCNA抗体 | Cell Signaling Technology | 2586 | |
| Ki67抗体 | Cell Signaling Technology | 9027 | |
| 含DAPI封片剂 | -- | P36935 | |
| 免疫组化 | Dako Omnis自动染色系统 | Agilent | -- |
| 微卫星不稳定性检测 | Idylla MSI检测 | Biocartis NV | -- |
| RNA提取 | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green | Roche | -- |
| Western blot | CDK6抗体 | Cell Signaling Technology | D48S8 |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2175 | |
| PMS2抗体 | abcam | ab110638 | |
| MLH1多克隆抗体 | proteintech | 11697-1-AP | |
| 流式分析 | Aurora 5激光全光谱分析仪 | -- | -- |
| 3D培养 | 基质胶 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者肿瘤MLH1分型 | 细胞质MLH1判定标准(<5%核阳性且>10%细胞质阳性)及核MLH1判定标准(>5%核阳性) 阅读提示:Methods“Categorization of cytoplasmic vs nuclear MLH1 in PDXs and patient tumors”及Fig. 1B图注 |
| PDX与类器官内分泌治疗反应 | PDX来源、类器官接种数量及fulvestrant/tamoxifen处理浓度(文中未明确说明具体浓度) 阅读提示:Methods“PDxO establishment and treatments”及Fig. 1E、F图注 |
| 细胞系突变模型构建 | shMLH1稳定株背景、回补突变体种类及转染/筛选条件 阅读提示:Methods“Cell lines, mice, si/shRNA transfection and growth assays”及Fig. 2、Fig. 3图注 |
| 亚克隆混合实验 | GFP标记G55V与未标记WT细胞1:9混合比例、检测时间点(D0和D7)及流式设门策略 阅读提示:Methods“Flow cytometry, immunostaining and microscopy”及Fig. 5C、D图注与Supplementary Figs. |
| 体内移植瘤实验 | 小鼠品系与周龄、细胞接种数量、随机分组肿瘤体积、fulvestrant剂量与给药途径、雌激素饮水浓度 阅读提示:Methods“Cell lines, mice, si/shRNA transfection and growth assays”与“Inhibitors and agonists”及Fig. 4A、Fig. 5F图注 |
| CDK4/6抑制剂敏感性检测 | palbociclib/abemaciclib体外浓度及体内饲料给药剂量 阅读提示:Methods“Inhibitors and agonists”及Fig. 7E–K图注 |