delB小鼠窦房结异位PITX2表达的时空定位
确定delB缺失后PITX2在窦房结起搏细胞中的异位表达起始时间与细胞类型
对E10.5、E12.5、E17.5的野生型、delB/+和delB/delB胚胎心脏进行Pitx2c原位杂交及ISL1/PITX2免疫染色,检测窦房结区域表达
PITX2 dosage-dependent changes in pacemaker cell state underlie sinus node dysfunction and atrial arrhythmias.
含delB小鼠胚胎与成体、空间转录组、AAV过表达、人iPSC-PCs单细胞测序及膜片钳多层级验证
delB/+与delB/delB小鼠胚胎及成体心脏 野生型小鼠AAV9-PITX2c过表达模型 人iPSC来源起搏心肌细胞(hiPSC-PCs)
delB/+与delB/delB基因型小鼠比较,含野生型对照 胚胎期E10.5、E12.5、E14.5、E17.5及成体时间点检测 AAV6在hiPSC-PCs转导PITX2c或mCherry对照,转导后7天scRNA-seq与膜片钳 空间转录组按HCN4/TNNI3信号划分ROI,野生型n=3、delB/delB n=6 成体ECG经食管起搏检测SNRT120与AA诱发性,atropine 0.5 mg/kg与propranolol 1 mg/kg腹腔注射阻断ANS
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定delB缺失后PITX2在窦房结起搏细胞中的异位表达起始时间与细胞类型
对E10.5、E12.5、E17.5的野生型、delB/+和delB/delB胚胎心脏进行Pitx2c原位杂交及ISL1/PITX2免疫染色,检测窦房结区域表达
验证异位PITX2是否导致起搏细胞身份基因进行性丢失并出现心房工作心肌特征
对E12.5、E14.5、E17.5窦房结进行ISL1、TBX3、SHOX2、HCN4、NKX2-5、CX40、TNNI3免疫染色及Hcn4/Gja5原位杂交,并进行3D体积重建
明确PITX2表达水平与ISL1抑制及HCN4high/HCN4low亚区比例的关系
对野生型、delB/+和delB/delB E17.5窦房结头域单核进行PITX2和ISL1信号强度定量,并统计HCN4high/HCN4low核比例
定义HCN4high与HCN4low亚区及成体窦房结的转录组特征
对E17.5野生型、delB/+、delB/delB及成体心脏FFPE切片进行GeoMx数字空间转录组,按HCN4和TNNI3信号划分ROI
检验PITX2能否在已分化的出生后起搏细胞中抑制起搏基因表达
出生后2天野生型小鼠经AAV9-Myo4A过表达PITX2c或mCherry,免疫染色检测PITX2、GFP、PCM-1、HCN4和ISL1
验证PITX2剂量依赖性起搏细胞状态改变在人类细胞模型中的保守性
hiPSC-PCs经AAV6-TNNT2-PITX2c-p2a-H2B-EGFP或mCherry对照转导,7天后进行流式检测转导效率和scRNA-seq
评估PITX2c诱导的转录状态改变对起搏细胞电生理功能的影响
对AAV6-mCherry和AAV6-PITX2c hiPSC-PCs进行穿孔膜片钳记录自发AP,并在动态钳注入Kir2.1电流条件下以1 Hz起搏记录AP参数
将起搏细胞状态改变与整体心脏节律和心律失常易感性关联
对成体野生型、delB/+和delB/delB小鼠进行体表ECG记录及经食管电极起搏,测定SNRT120、WBCL和AA诱发性,并用atropine和propranolol进行ANS阻断
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物麻醉 | 异氟烷 | Pharmachemie B.V. | 061756 |
| 免疫组织化学 | 抗原修复液 | Vector | H3300-250 |
| 兔抗HCN4抗体 | Merck Millipore | AB5805 | |
| 羊抗PITX2抗体 | Bio-Techne | AF7388 | |
| 兔抗ISL1抗体 | GeneTex | GTX102807 | |
| 羊抗TBX3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC 31656 | |
| 鼠抗SHOX2抗体 | Abcam | AB55740 | |
| 羊抗CX40抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC 20466 | |
| 羊抗NKX2-5抗体 | LabNed | LN2027081 | |
| 羊抗TNNI3抗体 | Hytest | 4T21/2 | |
| 鼠抗TNNI3抗体 | Merck Millipore | MAB1691 | |
| 鸡抗GFP抗体 | AvesLabs | GFP1020 | |
| 兔抗PCM-1抗体 | Atlas Antibodies/Bio-connect | HPA023370 | |
| DAPI | Sigma | D9542 | |
| 空间转录组 | GeoMx全转录组小鼠RNA探针 | Bruker Spatial Biology | -- |
| Sytox Green核酸染料 | Thermo Fisher Scientific | S7020 | |
| AAV6制备 | DMEM-GlutaMax培养基 | ThermoFisher Scientific | 31966-047 |
| 胎牛血清 | Sigma | F7524 | |
| 青霉素-链霉素 | ThermoFisher Scientific | 15140-122 | |
| 线性聚乙烯亚胺-Max | Polysciences Inc | 24765-1 | |
| Opti-MEM培养基 | ThermoFisher Scientific | 11058-021 | |
| Amicon Ultra-15离心过滤单元 | Millipore/Merck | UFC910024 | |
| AAV9制备 | Benzonase核酸酶 | Merck | 1016950001 |
| Pluronic F68 | ThermoFisher Scientific | 24040032 | |
| Amicon Ultra-15 100 kDa离心过滤单元 | Millipore/Merck | UFC910024 | |
| 流式细胞术 | 1x TrypLE Select解离液 | Thermo Fisher Scientific | 12563011 |
| EDTA | Thermo Fisher Scientific | 15575020 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | A8022 | |
| FACSSymphony A1细胞分析仪 | Beckton Dickinson | -- | |
| 单细胞RNA测序 | Chromium单细胞5′ v2试剂盒 | 10x Genomics | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| delB小鼠模型 | 遗传背景FVB/NJ,缺失区域mm10: chr3:128,329,001-128,346,349,野生型、delB/+与delB/delB分组 阅读提示:Methods-Transgenic mice |
| 胚胎期采样与基因分型 | E10.5、E12.5、E14.5、E17.5时间点,卵黄囊与尾部PCR基因分型,4%多聚甲醛固定 阅读提示:Methods-Embryo isolation |
| 成体在体电生理 | 12-33周龄,1.5%异氟烷,起搏1.5×心房捕获阈值,SNRT120为4 s、120 msec周期,WBCL起始100 msec每轮减2 msec,AA诱发起始60 msec减至10 msec 阅读提示:Methods-In vivo electrophysiology及Fig. 7图注 |
| 自主神经阻断 | atropine 0.5 mg/kg与propranolol 1 mg/kg腹腔注射,给药后10 min重复ECG与起搏 阅读提示:Methods-In vivo electrophysiology;Supplementary Fig. 9 |
| 空间转录组ROI划分 | 依据HCN4与TNNI3信号强度阈值划分HCN4high/HCN4low及RA区域,ROI核数下限与质控阈值 阅读提示:Methods-Spatial transcriptomics与Spatial transcriptomics data analysis;Supplementary Data 14 |
| hiPSC-PCs过表达与电生理 | AAV6转导时机(day 18)与转导后7天检测,PITX2c或mCherry对照,动态钳注入2 pA/pF Kir2.1,1 Hz起搏 阅读提示:Methods-Flow cytometry、Single-cell RNA sequencing、Cellular electrophysiology |