纳武利尤单抗联合伊匹木单抗在肾髓质癌中诱导超进展:一项II期试验结果及临床前证据

Nivolumab plus ipilimumab induce hyper-progression in renal medullary carcinoma: results of a phase II trial and preclinical evidence.

作者信息Melinda Soeung, Xinmiao Yan, Ciro Zanca, Jing Qian, Menuka Karki, Fei Duan, Hania Khan, Li Zhang, David H Peng, Mariah Williams, Rong He, Ziheng Chen, Luigi Perelli, Jianfeng Chen, Rebecca S Tidwell, Pankaj K Chauhan, Courtney N Le, Truong N A Lam, Nirjar Bhattacharya, Rutvi Shah, I-Lin Ho, Jason P Gay, Caroline C Carrillo, Ningping Feng, Kang Le, Guang Gao, Teresa L Perry, Faika Mseeh, Yongying Jiang, Quanyun A Xu, Niki Marie Zacharias, Rahul A Sheth, Tharakeswara K Bathala, Priya Rao, Najat C Daw, Durga N Tripathi, Cheryl L Walker, Mohammad M Mohammad, Jianhua Zhang, Guangchun Han, Yanshuo Chu, Ruiping Wang, Minghao Dang, Enyu Dai, Fuduan Peng, Yunhe Liu, Akshaya Jadhav, Wenhua Lang, Claudio A Arrechedera, Leticia Campos Clemente, Edwin R Parra, Hsinyi Lu, Cara L Haymaker, Ignacio I Wistuba, Andrew Futreal, Andrea Viale, Michael J Soth, Philip Jones, Joseph R Marszalek, Timothy Heffernan, Giulio F Draetta, Nizar M Tannir, Jianjun Gao, Linghua Wang, Giannicola Genovese, Pavlos Msaouel
PMID41290625
发布时间2025-11
DOI10.1038/s41467-025-65462-z

实验完整度

高

含II期临床试验患者样本scRNA-seq、CyTOF、mIF,以及免疫健全SM-GEMM小鼠模型的功能与机制验证(IFNGR1敲除、p300抑制剂)

主要模型

RMC患者肿瘤组织及外周血样本 免疫健全体细胞嵌合基因工程小鼠RMC模型(SM-GEMM) MSRT1小鼠RMC细胞系(含IFNGR1敲除衍生物) DOHH2非霍奇金淋巴瘤细胞系

重点核对

临床试验:纳武利尤单抗3 mg/kg每3周联合伊匹木单抗1 mg/kg每3周,最多4剂,后续纳武利尤单抗480 mg每4周维持 小鼠体内实验:抗PD-1与抗CTLA-4各5 mg/kg腹腔注射,每3天一次共8剂;IACS-16898 50 mg/kg口服灌胃 IFNGR1敲除验证:CRISPR敲除MSRT1细胞IFNGR1,Western blot检测MEK/ERK及p300 超进展定义:治疗开始后8周内进展,可测病灶最小增加10 mm,靶病灶总和较基线增加≥40%和/或增加≥20%且至少两个不同器官出现新病灶 scRNA-seq样本:基线7例、治疗后2例RMC患者新鲜肿瘤活检组织

摘要

肾髓质癌(RMC)患者的治疗选择有限。本文报告一项抗PD1药物纳武利尤单抗联合抗CTLA4药物伊匹木单抗治疗RMC患者的II期临床试验(NCT03274258)结果,主要终点为客观缓解率。由于全部10例接受治疗的患者均出现快速疾病进展,试验在预设中期分析时因无效而停止入组。10例患者中5例符合影像学超进展标准,中位无进展生存期(次要终点)为1.38个月(95%置信区间:1.28,1.60)。在一项事后单细胞RNA测序分析中,来自RMC患者接受纳武利尤单抗联合伊匹木单抗治疗前后的数据表明,免疫检查点治疗(ICT)触发了干扰素-γ反应,在肿瘤细胞中诱导了由CEBPB/p300轴调控的“髓系模拟”程序,该程序与增殖和超进展相关。在使用免疫健全的体细胞嵌合基因工程小鼠RMC模型的临床前实验中,联合ICT加速了肿瘤生长,同时激活了髓系相关的转录回路。选择性药理学抑制p300可抑制该程序并恢复对ICT的敏感性。这些发现揭示了RMC对ICT耐药的适应性机制,并支持靶向主要髓系调控因子以实现治疗获益。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
纳武利尤单抗联合伊匹木单抗在肾髓质癌患者中的疗效如何,以及RMC对免疫检查点治疗耐药或超进展的机制是什么。
核心机制
ICT触发的IFNγ反应通过肿瘤细胞上调的IFNGR1信号激活CEBPB/p300轴,诱导肿瘤细胞“髓系模拟”转录程序,促进增殖和超进展;药理学抑制p300可抑制该程序并恢复对ICT的敏感性。
主要证据
II期临床试验中10例RMC患者全部快速进展,5例符合超进展标准,中位PFS 1.38个月;患者肿瘤scRNA-seq、CyTOF和多色免疫荧光显示ICT后肿瘤细胞S100A9、IFNGR1、CEBPB、EP300上调及髓系相似性增加;免疫健全小鼠RMC模型中ICT加速肿瘤生长并增加髓系标志物,IFNGR1敲除或p300抑制剂IACS-16898可逆转超进展并恢复ICT敏感性。
研究意义
揭示RMC对ICT耐药的适应性机制,支持靶向主要髓系调控因子p300以使免疫治疗获益,并为未来联合p300抑制与ICT的临床试验提供依据。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

II期临床试验评估纳武利尤单抗联合伊匹木单抗疗效

评估纳武利尤单抗联合伊匹木单抗在局部晚期或转移性RMC患者中的客观缓解率及安全性。

入组10例RMC患者,接受纳武利尤单抗3 mg/kg每3周联合伊匹木单抗1 mg/kg每3周最多4剂,后续纳武利尤单抗480 mg每4周维持,直至疾病进展或不可耐受毒性;评估ORR、PFS、OS及不良事件。

2

患者肿瘤样本单细胞转录组分析

探究ICT后RMC肿瘤细胞的转录重编程及与超进展相关的分子特征。

对基线7例和治疗后2例RMC患者新鲜肿瘤活检组织进行scRNA-seq,分析细胞类型、差异表达基因、通路富集、肿瘤细胞熵及与髓系细胞的转录相似性。

3

患者外周血和肿瘤组织免疫分析

验证ICT后免疫微环境变化及肿瘤细胞髓系标志物表达。

对基线和治疗后PBMC进行CyTOF分析;对肿瘤组织进行多重免疫荧光检测CD8、IFNγ、S100A9、IFNGR1等;对纵向肿瘤组织进行bulk RNA-seq。

4

免疫健全小鼠RMC模型验证ICT超进展

在可控实验条件下验证ICT诱导的超进展和髓系模拟。

将MSRT1细胞原位注射至C57BL/6J小鼠右肾,给予抗PD-1联合抗CTLA-4或IgG对照,评估原发肿瘤质量、转移负荷、增殖和髓系标志物。

5

IFNGR1敲除验证机制

验证IFNGR1在介导ICT诱导的髓系模拟和超进展中的作用。

用CRISPR敲除MSRT1细胞IFNGR1,体外IFNγ刺激检测MEK/ERK和F4/80;将IFNGR1KO细胞原位移植至小鼠,给予ICT或IgG对照,评估肿瘤生长和p300蛋白。

6

p300抑制剂IACS-16898药理学验证

验证药理学抑制p300能否抑制髓系模拟并恢复RMC对ICT的敏感性。

开发口服CBP/p300溴结构域抑制剂IACS-16898,体外检测其结合活性和选择性;在小鼠RMC模型中联合ICT给药,评估肿瘤质量、H3K27乙酰化和F4/80表达。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
NORGEN总RNA纯化试剂盒NORGEN BIOTEK CORP37500
AMPure XP磁珠Beckman Coulter Life Sciences--
Quant-iT RiboGreen RNA检测试剂盒ThermoFisher Scientific--
Agilent RNA 6000 Nano试剂盒Agilent Technologies--
2100生物分析仪Agilent Technologies--
Ovation RNA-Seq System V2NuGEN--
Quant-iT PicoGreen dsDNA检测试剂盒ThermoFisher Scientific--
Covaris E220聚焦超声仪Covaris--
SureSelect XT低起始量试剂盒Agilent Technologies--
Sciclone G3 NGSx工作站PerkinElmer, Inc.--
Herculase II Fusion DNA聚合酶Agilent Technologies--
TapeStation 4200Agilent Technologies--
Agilent SureSelect人全外显子v4探针Agilent Technologies--
Illumina NovaSeq 6000测序平台Illumina--
Liberase TMMilliporeSigma--
DNase IMilliporeSigma--
ACK裂解缓冲液ThermoFisherA1049201
Chromium iX仪器10x Genomics--
Maxpar X8抗体标记试剂盒Standard BioTools--
Cell-ID顺铂198PtStandard BioTools--
Human TruStain FcXBiolegend--
20重CD45活细胞条形码试剂盒Standard BioTools--
Foxp3/转录因子染色缓冲液套装eBioscience--
Helios质谱流式细胞仪Standard BioTools--
RIPA裂解缓冲液----
PVDF膜----
Opal 7免疫组化试剂盒Akoya BiosciencesNEL797001KT
Opal Polaris 480Akoya BiosciencesFP1500001KT
Opal Polaris 780试剂盒Akoya BiosciencesFP1501001KT
Vectra Polaris 1.0.13Akoya Biosciences--
Opal 3重手动检测试剂盒Akoya BiosciencesNEL810001KT
兔F4/80抗体Cell Signaling Technology70076
大鼠Ly6c抗体BioRadMCA2389GA
兔CD11b抗体Abcamab133357
兔CD11c抗体Cell Signaling Technology97585
DAPI----
鬼笔环肽----
磷酸化p44/42 MAPK (Erk1/2) (Thr202/Tyr204)抗体Cell Signaling Technology9101
磷酸化MEK1/2 (Ser217/221)抗体Cell Signaling Technology9121
Ki-67 (D2H10)抗体Cell Signaling Technology9027
GFP (D5.1)抗体Cell Signaling Technology2956
NovaRED过氧化物酶底物Vector LabSK-4800
InVivoPlus多克隆叙利亚仓鼠IgGBio X CellBP0087
InVivoPlus抗小鼠CTLA-4 (CD152)克隆9H10Bio X CellBP0131
InVivoPlus抗小鼠PD-1 (CD279)克隆RMP1-14Bio X CellBP0146
组蛋白提取试剂盒Abcamab113476
GST标签CBP(1081–1197残基)BPS Bioscience--
GST标签BRD4(49–170残基)BPS Bioscience--
生物素化四乙酰化H4(1–21)肽AnaSpec64989
谷胱甘肽AlphaLISA受体珠PerkinElmerAL109
链霉亲和素供体珠PerkinElmer676002
Cell Titer GLO检测Promega--
RNeasy迷你RNA提取试剂盒Qiagen74106
BCL6 Taqman探针Thermo FisherHs00153368_m1
人RPLPO内参Thermo Fisher4326314E
总H3抗体Cell Signaling Technologies4499
乙酰化H3K27抗体Cell Signaling Technologies8173

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
II期临床试验
纳武利尤单抗3 mg/kg每3周联合伊匹木单抗1 mg/kg每3周最多4剂,后续纳武利尤单抗480 mg每4周维持;主要终点ORR;超进展定义
阅读提示:Methods中Clinical trial design、Clinical trial endpoints and assessments及Definition of hyperprogression小节
患者scRNA-seq
基线7例、ICT后2例;样本来源器官部位;细胞质控标准(>200基因、<20%线粒体 reads、<6500基因)
阅读提示:Methods中ScRNA-seq data processing and analysis小节及Supplementary Table S3
小鼠RMC模型ICT实验
MSRT1细胞500,000个原位注射右肾;抗PD-1和抗CTLA-4各5 mg/kg腹腔注射每3天一次共8剂;每组n=6;第30天MRI
阅读提示:Methods中In vivo treatment study with combination immune checkpoint therapy小节及Figure 4 legend
IFNGR1敲除实验
CRISPR sgRNA序列AAAAAGAATCTGACTATGCA;IFNγ 100 ng/mL处理48 h;IFNGR1KO与WT细胞对比;小鼠分组样本量
阅读提示:Methods中Single-guide RNA design and validation、Immunofluorescence in vitro experiment小节及Figure 6、7 legends
IACS-16898联合ICT实验
IACS-16898 50 mg/kg口服灌胃每日两次,周末停药两天;ICT抗PD-1/抗CTLA-4各5 mg/kg;每组n=5-6;第30天评估
阅读提示:Methods中In vivo treatment study with combination immune checkpoint therapy小节及Figure 8 legend