脂肪细胞特异性Zeb1基因修饰小鼠的建立与乳腺脂肪发育表型分析
验证Zeb1在乳腺脂肪生成和脂肪细胞分化中的作用。
将Zeb1fl/fl小鼠与Fabp4-Cre小鼠杂交获得Zeb1adiKO小鼠,将B6-CAG-LSL-Zeb1与Fabp4-Cre杂交获得Zeb1adiTG小鼠;通过RT-PCR和免疫组化验证Zeb1表达,检测乳腺脂肪垫重量、HE染色、Perilipin-1免疫染色及Pref1、Ppar-γ、C/ebpα表达。
Adipocyte-specific Zeb1 downregulation remodels the tumor-associated adipose microenvironment to facilitate female breast cancer progression.
包含脂肪细胞特异性基因敲除/敲入小鼠、细胞共培养、单核RNA测序、脂质组学、代谢组学及体内移植瘤和肺转移模型,并有功能与机制验证。
Zeb1adiKO与Zeb1adiTG脂肪细胞特异性基因修饰小鼠 EO771小鼠乳腺癌细胞与MDA-MB-231人乳腺癌细胞 3T3-L1分化脂肪细胞及与癌细胞共培养建立的CAAs MMTV-PyMT自发乳腺癌小鼠及40例乳腺癌患者组织样本
Zeb1adiKO小鼠中脂肪组织Zeb1表达下调,乳腺脂肪垫重量减轻,脂肪细胞变小且多房脂滴 CAAZeb1-off与CAAZeb1-on条件培养基处理EO771细胞后检测EdU增殖、transwell侵袭和高内涵迁移 CAAZeb1-on细胞中Atgl、Hsl、Mgl、Scd的mRNA和蛋白水平降低,Scd启动子E2-box依赖的Zeb1结合 POA(5 μM)和OA(15 μM)处理EO771细胞48 h后检测增殖、侵袭和迁移 EO771同种移植瘤模型中A939572(30 mg/kg,每2天一次)与AMA(5 μg/天)单用或联用的肿瘤体积和重量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Zeb1在乳腺脂肪生成和脂肪细胞分化中的作用。
将Zeb1fl/fl小鼠与Fabp4-Cre小鼠杂交获得Zeb1adiKO小鼠,将B6-CAG-LSL-Zeb1与Fabp4-Cre杂交获得Zeb1adiTG小鼠;通过RT-PCR和免疫组化验证Zeb1表达,检测乳腺脂肪垫重量、HE染色、Perilipin-1免疫染色及Pref1、Ppar-γ、C/ebpα表达。
解析脂肪细胞Zeb1缺失对乳腺细胞组成、脂肪细胞亚群和脂质代谢基因表达的影响。
对Zeb1fl/fl和Zeb1adiKO小鼠乳腺组织进行单核RNA测序,t-SNE聚类注释细胞类型和脂肪细胞亚群,分析拟时序轨迹、通路富集和脂质代谢相关基因表达。
验证乳腺癌相关脂肪细胞中Zeb1表达变化,并建立可调控Zeb1表达的CAAs共培养体系。
对MMTV-PyMT小鼠肿瘤浸润前沿CAAs和40例乳腺癌患者CAAs进行Zeb1免疫组化;将3T3-L1分化脂肪细胞与EO771细胞共培养获得3T3CAA细胞;利用Tet-on系统构建DOX诱导Zeb1表达的3T3Zeb1-Tet细胞,与EO771共培养建立CAAZeb1-off和CAAZeb1-on细胞。
验证CAAs中Zeb1表达变化对脂解和乳腺癌细胞增殖、侵袭、迁移及EMT的影响。
对CAAZeb1-off和CAAZeb1-on细胞进行Oil Red O和Bodipy-C16染色;收集条件培养基处理EO771和MDA-MB-231细胞,检测EdU增殖、transwell侵袭、高内涵迁移及Snail、Vimentin蛋白表达。
在体内验证脂肪细胞Zeb1表达变化对乳腺癌原发瘤生长、CAAs脂解和肺转移的作用。
将EO771或PyMT细胞注射到Zeb1TG和Zeb1adiTG小鼠第四乳腺脂肪垫建立同种移植瘤模型,检测肿瘤体积、重量、HE和Perilipin-1染色、Ki67和Vimentin免疫组化;用CAAZeb1-off/on条件培养基预处理的EO771或PyMT细胞经尾静脉注射建立实验性肺转移模型。
鉴定Zeb1调控CAAs脂质代谢的关键酶和直接转录靶点。
对CAAZeb1-off和CAAZeb1-on细胞进行非靶向脂质组学、中长链脂肪酸靶向代谢组学和RNA测序;检测Atgl、Hsl、Mgl、Scd的mRNA、蛋白和酶活性;构建Atgl、Hsl、Mgl、Scd启动子荧光素酶报告基因,进行Scd启动子E2-box突变和ChIP-qPCR。
验证POA进入乳腺癌细胞后通过膜磷脂sn-2位置换ARA并促进PGD2产生。
用POA和OA处理EO771和MDA-MB-231细胞,检测增殖、侵袭、迁移;进行靶向脂质组学分析含C16:1或C20:4的膜磷脂;RNA测序和GSEA分析ARA代谢;靶向代谢组学检测ARA及其代谢物;用AT-56抑制Ptgds。
验证POA通过PGD2-cAMP/PKA-Creb1促进AM分泌,AM通过AMR下调脂肪细胞Zeb1并诱导脂解。
用POA和AT-56处理EO771细胞,收集条件培养基处理3T3Adi细胞;检测AM表达和分泌;用PGD2、SQ22536、Creb1敲低验证cAMP/PKA/Creb1通路;用AM、AMA和CRLR敲低处理3T3Adi细胞,检测脂解和Zeb1表达;利用癌细胞-脂肪细胞共培养模型验证。
验证联合抑制Scd和AMR或联合抑制AMR和Ptgds对乳腺癌同种移植瘤的治疗效果。
建立EO771乳腺脂肪垫同种移植瘤模型,腹腔注射A939572与AMA单用或联用,或AT-56与AMA单用或联用;检测肿瘤体积、重量、HE染色、Zeb1、Ki67、Vimentin免疫组化及小鼠体重。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | Servicebio | G4515 |
| 胎牛血清 | VivaCell | C04001-500 | |
| 青霉素/链霉素 | Servicebio | G4003 | |
| 脂肪细胞分化 | 胰岛素 | Sigma-Aldrich | I2643 |
| 地塞米松 | Sigma-Aldrich | D4902 | |
| 罗格列酮 | Sigma-Aldrich | R2408 | |
| 3-异丁基-1-甲基黄嘌呤 | Macklin | I811775 | |
| 油红O染色 | 油红O染色试剂盒 | Beyotime | C0158s |
| 小鼠乳腺全组织染色 | 卡红明矾溶液 | Sigma-Aldrich | 1390-65-4 |
| BODIPY-C16摄取 | BODIPY-C16荧光探针 | Thermofisher | D3821 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | YEASEN | 10606ES60 |
| RT-qPCR | 逆转录酶 | Yeasen | 11300ES92 |
| SYBR Green定量PCR预混试剂盒 | Yeasen | 11201ES03 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Yeasen | 20115ES60 |
| BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Yeasen | 20201ES76 | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| ECL化学发光试剂盒 | Yeasen | 36208ES76 | |
| 药物处理 | 棕榈油酸 | Glpbio | GC31253 |
| 油酸 | Glpbio | GC30110 | |
| 乙莫克舍 | TargetMol | T4535 | |
| A939572 | TargetMol | T4515 | |
| SQ22536 | TargetMol | 17318-31-9 | |
| AT-56 | Macklin | A872100 | |
| 前列腺素D2 | Macklin | P923874 | |
| 人重组肾上腺髓质素 | Glpbio | GC35258 | |
| 肾上腺髓质素受体拮抗剂 | Glpbio | GC32615 | |
| ChIP | EZ-ChIP试剂盒 | Millipore | 17-371FR |
| 荧光素酶实验 | 双荧光素酶报告分析系统 | Promega | J3082 |
| EdU增殖检测 | EdU | RiboBio | C10310-1 |
| 细胞活力检测 | CCK8细胞活力检测试剂盒 | Yeasen | 40203ES88 |
| Transwell侵袭实验 | 基质胶 | Yeasen | 40183ES08 |
| Transwell小室 | Falcon | 3464 | |
| 肺转移检测 | 印度墨汁 | Solarbio | I8060 |
| 细胞核分离 | GEXSCOPE®细胞核分离液 | Singleron Biotechnologies | -- |
| 单核RNA测序 | GEXSCOPE®单核RNA测序试剂盒 | Singleron Biotechnologies | -- |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488标记二抗 | zSBG-BIO | ZF-0511 |
| Alexa Fluor 594标记二抗 | zSBG-BIO | ZF-0516 | |
| DAPI | Beyotime | C1002 | |
| ELISA | 小鼠肾上腺髓质素ELISA试剂盒 | Senbeijia | SBJ-M0203 |
| Western blot | 抗Zeb1抗体 | Proteintech | 21544-1-AP |
| 免疫组化 | 抗Zeb1抗体 | abcam | ab87280 |
| Western blot | 抗Crlr抗体 | SAB | 37509 |
| 抗Creb1抗体 | Proteintech | 12208-1-AP | |
| 免疫组化和Western blot | 抗Scd抗体 | SAB | 37896 |
| 抗Ptgds抗体 | SAB | 31107 | |
| 免疫荧光 | 抗Perilipin-1抗体 | Genetex | GTX634406 |
| 免疫组化和Western blot | 抗Vimentin抗体 | Cell Signaling Technology | 5741 |
| Western blot | 抗Snail抗体 | Proteintech | 13099-1-AP |
| 免疫组化 | 抗Ki67抗体 | Servicebio | GB151142 |
| Western blot | 抗actin抗体 | Santa Cruz | sc-47778 |
| 抗Atgl抗体 | Santa Cruz | sc-365278 | |
| 抗Hsl抗体 | SAB | 41039 | |
| 抗Mgl抗体 | Santa Cruz | sc-398942 | |
| 脂质组学 | CSH C18色谱柱 | Waters | -- |
| 靶向脂质组学 | Nexera LC-30A超高效液相色谱系统 | Shimadzu | -- |
| QTRAP 6500+质谱仪 | Sciex | -- | |
| 中长链脂肪酸靶向代谢组学 | 5977B MSD质谱仪 | Agilent | -- |
| ARA靶向代谢组学 | 5500 QTRAP质谱仪 | SCIEX | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 脂肪细胞特异性Zeb1基因修饰小鼠 | 基因型Fabp4-Cre+; Zeb1fl/fl或Fabp4-Cre+; Zeb1+/+,小鼠性别和周龄,每组样本量n=5 阅读提示:Methods: Mice and mice housing;Fig. 1a和图注 |
| 3T3-L1脂肪细胞分化 | 分化诱导液含5 μg/mL胰岛素、1 μM地塞米松、1 mM罗格列酮、0.5 mM 3-异丁基-1-甲基黄嘌呤处理2天,之后5 μg/mL胰岛素维持 阅读提示:Methods: Mature adipocyte generation in vitro and Oil Red O staining |
| 癌细胞与脂肪细胞共培养及条件培养基 | transwell孔径0.4 μm,共培养6天;条件培养基用0.2% FBS DMEM收集24 h并经0.22 μm过滤 阅读提示:Methods: Cell co-culture and conditioned medium (CM) production |
| CAAs中Zeb1调控的脂解与Scd靶点验证 | DOX诱导Tet-on Zeb1表达的浓度和时间;A939572使用100 nM处理6天;启动子片段位置Atgl −2960/+99、Hsl −3000/+8、Mgl −2997/+103、Scd −2746/+300 阅读提示:Fig. 2c–e、Fig. 5i–l及图注;Methods: Plasmid construction |
| POA和OA处理乳腺癌细胞 | POA 5 μM、OA 15 μM处理48 h;AT-56 50 μM;检测增殖、侵袭和迁移的终点 阅读提示:Fig. 6a–c、Fig. 6k–m图注 |
| EO771乳腺脂肪垫同种移植瘤及药物处理 | 8周龄雌性C57BL/6小鼠,每只注射50 μL 1000万细胞/mL细胞悬液加25 μL Matrigel;A939572 30 mg/kg每2天一次,AMA 5 μg/天,AT-56 50 mg/kg每2天一次,处理3周;每组n=6 阅读提示:Methods: Tumor cell implantation;Fig. 8a和图注;Supplementary Fig. 14a |
| 实验性肺转移模型 | EO771或PyMT细胞经条件培养基预处理4天,尾静脉注射50 μL 1000万细胞/mL,30天后检测肺转移;每组n=5 阅读提示:Methods: Experimental lung metastasis model of breast cancer;Fig. 4a、f图注 |