建立肿瘤模型并验证PD-1/PD-L1轴完整性
验证肿瘤模型具有完整的PD-1/PD-L1信号轴,以评估PD-1阻断的效应。
生成表达mKate2和OVA或gp33的B16F10、EL4、MC38、MOC2肿瘤细胞系,皮下接种C57BL/6J小鼠,通过流式检测肿瘤浸润OT-I T细胞PD-1表达和肿瘤PD-L1表达,确认PD-1/PD-L1轴完整。
Non-synergy of PD-1 blockade with T-cell therapy in solid tumors
研究包含体外杀伤实验、体内肿瘤模型(多种肿瘤细胞系和基因敲除小鼠)、单细胞RNA/TCR测序及TCR功能验证,多个独立证据层级,并明确功能验证和机制验证。
C57BL/6J小鼠B16F10黑色素瘤模型(表达OVA或gp33抗原) T细胞缺陷小鼠模型(Rag1-KO、Trac-KO、P14 TCR转基因小鼠) OT-I TCR转基因T细胞和P14 TCR转基因T细胞
肿瘤细胞系表达的具体抗原(OVA、gp33、mKate2) 宿主小鼠的遗传背景(野生型、Rag1-KO、Trac-KO、P14) T细胞转移剂量(1×10^6至1×10^7) 抗PD-1抗体(克隆RMP1-14)的给药方案(200 μg/只,共4次,第0、2、4、6天或第6、8、10、12天) 体内实验肿瘤收获时间(治疗后第7天)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证肿瘤模型具有完整的PD-1/PD-L1信号轴,以评估PD-1阻断的效应。
生成表达mKate2和OVA或gp33的B16F10、EL4、MC38、MOC2肿瘤细胞系,皮下接种C57BL/6J小鼠,通过流式检测肿瘤浸润OT-I T细胞PD-1表达和肿瘤PD-L1表达,确认PD-1/PD-L1轴完整。
确定PD-1阻断是否增强过继性T细胞治疗的肿瘤消退效果。
对荷瘤小鼠进行亚致死性全身照射(5.5 Gy),第0天通过腹腔注射转移OT-I或P14 T细胞(1×10^6-1×10^7),同时或延迟给予抗PD-1抗体(RMP1-14)或同型对照,每2天一次共4次,测量肿瘤大小。
确定PD-1阻断对转移T细胞和内源性T细胞肿瘤浸润的影响。
治疗第7天,从肿瘤中分离TIL,通过流式细胞术检测转移T细胞(CD45.1+)和内源性CD8/CD4 T细胞(CD45.2+)的数量和比例。
直接检测PD-1阻断是否增强OT-I T细胞的杀伤、效应分子产生和增殖能力。
用xCELLigence实时杀伤实验评估OT-I T细胞对B16-K-OVA的杀伤;通过流式检测Granzyme B、IFN-γ、TNF-α表达;CellTrace Violet和Ki67染色评估增殖,均在有无抗PD-1抗体(10 μg/mL)条件下进行。
明确PD-1阻断的作用对象是内源性T细胞还是转移T细胞。
使用Pdcd1-KO OT-I细胞、Rag1-KO、Trac-KO和P14转基因宿主小鼠,重复体内治疗实验,比较肿瘤生长曲线。
检验内源性T细胞依赖性是否在不同肿瘤、抗原、TCR和给药方案下一致。
改变肿瘤细胞系(EL4-OVA、MOC2-OVA、MC38-OVA)、抗原(OVA vs gp33)、TCR(OT-I vs P14)、PD-L1表达水平(B16-K-OVA-PD-L1)及抗体给药时机(标准 vs 延迟),在野生型或Rag1-KO宿主中评估治疗反应。
验证肿瘤抗原性是否影响PD-1阻断增强细胞治疗的效果。
比较低免疫原性肿瘤(B16-U-OVA)和高免疫原性肿瘤(B16-K-OVA、B16-U-OVA-gp33)对PD-1阻断和细胞治疗的响应。
揭示PD-1阻断对转移T细胞和内源性肿瘤抗原特异性T细胞细胞状态的影响。
治疗第7天,从B16-K-OVA-gp33肿瘤中分离TIL,进行单细胞RNA测序和单细胞TCR测序,通过UMAP聚类和TCR特异性分组分析比较OT-I细胞与内源性gp33特异性T细胞的细胞状态。
确认TIL中发现的TCR的抗原特异性,以推断各特异性群频率。
从单细胞数据中选出主要TCR克隆型,构建MSGV反转录病毒载体,在C57BL/6J脾细胞上表达,用B16F10、B16-K、B16-U-OVA、B16-U-gp33等肿瘤细胞进行体外杀伤实验,验证其反应性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | GE Healthcare | -- | |
| HEPES缓冲液 | Gibco | -- | |
| GlutaMAX | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | -- | |
| 非必需氨基酸 | Gibco | -- | |
| 庆大霉素 | Gibco | -- | |
| RPMI培养基 | Gibco | -- | |
| 细胞刺激 | SIINFEKL肽 | GenScript | -- |
| KAVYNFATM肽 | GenScript | -- | |
| 细胞培养 | 白细胞介素-2(阿地白介素) | Prometheus | -- |
| T细胞激活 | 抗CD3ε抗体 | Bio X Cell | 145-2C11 |
| 抗CD28抗体 | Bio X Cell | 37.51 | |
| T细胞转导 | Retronectin | Takara | -- |
| 抗体处理 | 抗PD-1抗体(InVivoPlus RMP1-14) | Bio X Cell | BP0273 |
| 同型对照抗体(anti-2A3) | Bio X Cell | BP0089 | |
| TIL分离 | 肿瘤细胞分离试剂盒 | Miltenyi | 130-110-187 |
| gentleMACS组织处理器 | Miltenyi | 130-093-235 | |
| MACSmix管旋转器 | Miltenyi | 130-090-753 | |
| 抗Ter119-生物素 | Miltenyi | 130-109-559 | |
| 抗CD105-生物素 | Miltenyi | 130-118-107 | |
| 抗生物素磁珠 | Miltenyi | 130-097-046 | |
| 碎片去除液 | Miltenyi | 130-109-398 | |
| 死细胞去除试剂盒 | Miltenyi | 130-090-101 | |
| Pan T细胞分离试剂盒II | Miltenyi | 130-095-130 | |
| 杀伤实验 | xCELLigence实时细胞分析仪 | Agilent | -- |
| 细胞处理 | 干扰素-γ | Peprotech | 315-05 |
| 流式 | 可固定活性染料eFluor 506 | eBioscience | 65-0866-18 |
| PE标记抗Va2 TCR抗体 | BD | 553289 | |
| PE-Cy7标记抗PD-1抗体 | Invitrogen | 25-9985-82 | |
| CellTrace Violet染料 | Invitrogen | C34557 | |
| PE标记抗CD45抗体 | Miltenyi | 130-110-797 | |
| Live-Dead NIR染料 | Invitrogen | L10119 | |
| eFluor660标记抗颗粒酶B抗体 | Invitrogen | 50-8898-82 | |
| BUV395标记抗CD45抗体 | BD | 564279 | |
| BUV737标记抗IFN-γ抗体 | BD | 612769 | |
| VioBright515标记抗Ki67抗体 | Miltenyi | 130-120-421 | |
| PE标记抗TNF-α抗体 | Invitrogen | 12-7321-82 | |
| PerCP-e710标记抗4-1BB抗体 | Invitrogen | 46-1371-82 | |
| BD Cytofix/Cytoperm试剂盒 | BD | 554714 | |
| PE-Cy7标记抗PD-L1抗体 | Invitrogen | 25-5982-82 | |
| BV421标记抗H-2Kb抗体 | BD | 562942 | |
| VioBright515标记抗CD45.1抗体 | Miltenyi | 130-121-222 | |
| BUV395标记抗CD45.2抗体 | BD | 564616 | |
| BV421标记抗CX3CR1抗体 | BD | 149023 | |
| BV650标记抗4-1BB抗体 | BD | 740499 | |
| APC标记抗TIM3抗体 | Miltenyi | 130-119-756 | |
| SuperBright 702标记抗LAG3抗体 | Thermo | 67-2231-82 | |
| PE-Vio770标记抗CD69抗体 | Miltenyi | 130-115-577 | |
| PE-CF594标记抗CD103抗体 | BD | 565849 | |
| APC-Vio770标记抗CD3ε抗体 | Miltenyi | 130-117-676 | |
| BUV737标记抗CD8α抗体 | BD | 564297 | |
| PerCP-Vio700标记抗CD4抗体 | Miltenyi | 130-118-794 | |
| PE标记抗PD-1抗体 | BD | 551892 | |
| SuperBright 600标记抗PD-L1抗体 | Thermo | 63-5982-82 | |
| 可固定活性染料eFluor 455UV | eBioscience | 65-0868-18 | |
| CountBright绝对计数微球 | Invitrogen | C36950 | |
| 免疫荧光 | 抗PD-L1一抗 | Cell Signaling Technology | 13684 |
| 山羊抗兔FITC二抗 | Invitrogen | F-2765 | |
| 苏丹黑 | -- | -- | |
| 单细胞测序 | 5' Total-seq细胞哈希抗体 | BioLegend | 155861, |
| 10x Genomics Chromium平台和试剂 | 10x Genomics | PN-1000165, | |
| LunaFL荧光细胞计数器 | Logos Biosystem | -- | |
| Illumina 550测序系统 | Illumina | -- | |
| TCR功能验证 | MSGV逆转录病毒载体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 肿瘤模型建立 | 肿瘤细胞系(B16-K-OVA等)的构建、注射细胞数(1×10^6)、注射部位(皮下)、肿瘤生长时间(-7天) 阅读提示:Methods: Tumor cell lines 和 In vivo tumor inoculation, adoptive T-cell transfer and treatment |
| T细胞制备 | OT-I或P14 T细胞的来源(B6.OTI等)、刺激肽浓度(0.5 μM)、IL-2浓度(60 IU/mL)、培养时间(第6天使用) 阅读提示:Methods: Mouse lymphocyte isolation, activation and expansion |
| 过继T细胞转移 | T细胞剂量(1×10^6-1×10^7)、注射方式(腹腔注射)、体积(200 μL HBSS) 阅读提示:Methods: In vivo tumor inoculation, adoptive T-cell transfer and treatment |
| PD-1阻断 | 抗PD-1抗体克隆(RMP1-14)、剂量(200 μg/只)、注射途径(腹腔)、时间(第0,2,4,6天或第6,8,10,12天) 阅读提示:Methods: In vivo tumor inoculation, adoptive T-cell transfer and treatment |
| 宿主预处理 | 全身照射剂量(5.5 Gy)和时间(-1天) 阅读提示:Methods: In vivo tumor inoculation, adoptive T-cell transfer and treatment |
| TIL分析 | 肿瘤收获时间(第7天)、TIL分离方法(Miltenyi试剂盒)、流式抗体组合 阅读提示:Methods: Mouse TIL isolation 和 Flow cytometry of mouse cells |