运动诱导肝脏Cdo1表达的转录调控验证
验证运动是否通过cAMP/PKA/CREB通路诱导肝脏Cdo1表达。
对野生型C57BL/6小鼠进行8周跑台运动,检测肝脏Cdo1表达、cAMP水平和CREB磷酸化;ChIP验证CREB结合Cdo1启动子; luciferase报告基因验证CREB对Cdo1启动子的转录激活;Forskolin处理原代肝细胞和HepG2细胞检测Cdo1表达。
Cdo1-Camkk2-AMPK axis confers the protective effects of exercise against NAFLD in mice.
包含体内肝特异性敲除/过表达小鼠模型、体外原代肝细胞和HepG2细胞模型、RNA-seq、CoIP、细胞游离激酶实验及体内代谢表型验证。
肝细胞特异性Cdo1敲除(Cdo1LKO)小鼠 肝细胞特异性Cdo1过表达(Cdo1LTG)转基因小鼠 原代小鼠肝细胞 HepG2细胞
小鼠高脂饮食(HFD)16周诱导NAFLD模型,运动干预为最后8周 treadmill training 原代肝细胞和HepG2细胞使用0.6 mM游离脂肪酸(油酸:棕榈酸=2:1)处理24小时诱导脂肪变性 Forskolin处理原代肝细胞和HepG2细胞10 μM 12小时以验证cAMP/PKA/CREB通路 Cdo1LKO和Cdo1LTG小鼠每组n=6,Western blot每组n=3 腺病毒或shRNA敲低AMPKα、Camkk2或LKB1后检测Cdo1对AMPK磷酸化的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证运动是否通过cAMP/PKA/CREB通路诱导肝脏Cdo1表达。
对野生型C57BL/6小鼠进行8周跑台运动,检测肝脏Cdo1表达、cAMP水平和CREB磷酸化;ChIP验证CREB结合Cdo1启动子; luciferase报告基因验证CREB对Cdo1启动子的转录激活;Forskolin处理原代肝细胞和HepG2细胞检测Cdo1表达。
验证肝脏Cdo1在运动改善NAFLD中的作用。
构建肝细胞特异性Cdo1敲除(Cdo1LKO)小鼠,HFD喂养16周,最后8周进行跑台运动,检测肝脏脂质沉积、血糖耐量、胰岛素耐量、血清ALT/AST、能量代谢等指标。
探究Cdo1敲除影响的信号通路及代谢过程。
对HFD喂养的WT和Cdo1LKO小鼠肝脏进行RNA-seq,GO和KEGG分析;检测FAO和线粒体生物发生基因表达、线粒体DNA拷贝数、电镜观察线粒体形态;Western blot检测AMPKα Thr172和ACC1磷酸化。
在体外验证Cdo1缺失对肝细胞脂质沉积、AMPK信号和线粒体功能的影响。
原代肝细胞感染AD-Cre敲除Cdo1或AD-LacZ对照,HepG2细胞转染siCDO1敲低CDO1,然后用FFAs处理,检测脂滴积累、AMPK/ACC1磷酸化、FAO和线粒体生物发生基因、线粒体DNA、OCR和FAO水平。
在体外验证Cdo1过表达对肝细胞脂肪变性的保护作用及酶活性突变体的影响。
原代肝细胞和HepG2细胞过表达Cdo1WT或Cdo1Y157F,FFAs处理,检测脂滴、TG、AMPK信号、FAO和线粒体生物发生基因、线粒体DNA、OCR和FAO水平。
验证AMPK信号是否为Cdo1改善肝细胞脂肪变性所必需。
在原代肝细胞和HepG2细胞中敲低AMPKα,同时过表达Cdo1WT或Cdo1Y157F,FFAs处理,检测脂滴、TG、FAO和线粒体生物发生基因、线粒体DNA、OCR和FAO水平。
探究Cdo1如何促进AMPK磷酸化。
CoIP和pulldown实验检测Cdo1与Camkk2、AMPKα、LKB1的相互作用;confocal观察共定位;细胞游离激酶实验使用重组Cdo1、Camkk2和AMPK蛋白检测AMPKα Thr172磷酸化;敲低Camkk2或LKB1验证其对Cdo1促进AMPK磷酸化的影响。
验证Cdo1过表达与运动联合对NAFLD的改善作用。
构建肝细胞特异性Cdo1过表达(Cdo1LTG)小鼠,HFD喂养16周,最后8周运动,检测肝脏脂质、血糖耐量、胰岛素耐量、血清ALT/AST、AMPK活性、FAO和线粒体生物发生基因及线粒体DNA。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 高脂饲料 | Research Diets | -- |
| 普通饲料 | Xietong Shengwu | -- | |
| 跑台 | ZhengHuabiological | ZH-PT/5S | |
| 血清检测 | 丙氨酸氨基转移酶检测试剂盒 | Applygen | E2021 |
| 天冬氨酸氨基转移酶检测试剂盒 | Applygen | E2023 | |
| 原代肝细胞分离 | IV型胶原酶 | Sigma | C5138 |
| 70微米细胞筛网 | Falcon | 352350 | |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | Gibco | -- |
| Dulbecco改良Eagle培养基 | -- | -- | |
| 脂质积累模型 | 油酸和棕榈酸 | Sangon Biotech | -- |
| TG/TC检测 | 甘油三酯检测试剂盒 | Applygen | E1003 |
| 胆固醇检测试剂盒 | Applygen | E1005 | |
| 线粒体染色 | MitoScene绿色线粒体荧光探针 | US Everbright | M4064 |
| 半胱氨酸/牛磺酸检测 | 半胱氨酸检测试剂盒 | YITA | YT6089 |
| 牛磺酸检测试剂盒 | CIBO BIO | CB11346-mu | |
| 脂肪酸氧化检测 | FAOblue脂肪酸氧化检测探针 | Funakoshi | FDV-0033 |
| ChIP | ChIP级Protein A/G磁珠 | Thermo Fisher | 26162 |
| 抗CREB抗体 | Proteintech | 2208-1-AP | |
| 对照IgG | Abcam | ab46540 | |
| PCR纯化试剂盒 | Qiagen | -- | |
| OCR检测 | 高分辨率呼吸测定仪 | Oroboros | -- |
| 寡霉素 | Selleck | S1478 | |
| FCCP | Selleck | S8276 | |
| 鱼藤酮 | Santa Cruz | sc-203242 | |
| Luciferase报告基因 | Lipofectamine 6000转染试剂 | Beyotime | C0526 |
| 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Beyotime | RG027 | |
| Western blot | 抗Cdo1抗体 | Proteintech | 12509-1-AP |
| 抗AMPKα抗体 | Proteintech | 10929-2-AP | |
| 抗磷酸化AMPKα抗体 | Beyotime | AA393-1 | |
| 抗CREB1抗体 | Proteintech | 12208-1-AP | |
| 抗磷酸化CREB抗体 | Proteintech | 28792-1-AP | |
| 抗ACC1抗体 | Proteintech | 67373-1-IG | |
| 抗磷酸化ACC1抗体 | Santa Cruz | sc-271965 | |
| 抗Camkk2抗体 | Proteintech | 11549-1-AP | |
| 抗磷酸化Camkk2抗体 | Affinity | AF4487 | |
| 抗LKB1抗体 | Santa Cruz | sc-32245 | |
| 抗磷酸化Akt (S473)抗体 | CST | 9272S | |
| 抗总AKT抗体 | CST | 4060T | |
| 抗HA抗体 | Proteintech | 51064-2-AP | |
| 抗Flag抗体 | Proteintech | 66008-4-Ig | |
| 抗GAPDH抗体 | CST | D16H11 | |
| 抗HSP90α/β抗体 | Santa Cruz | sc-13119 | |
| 过氧化物酶标记山羊抗小鼠IgG二抗 | Jackon | 111-035-003 | |
| 过氧化物酶标记山羊抗兔IgG二抗 | Jackon | 111-035-003 | |
| Tanon-5200S化学发光成像仪 | BIO-RAD | -- | |
| RNA干扰 | RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | 13778-100 |
| 免疫荧光 | 山羊抗小鼠IgG/Alex Fluor 555 | Beyotime | A0460 |
| 山羊抗兔IgG/Alex Fluor 488 | Beyotime | A0562 | |
| 抗淬灭封片剂(含DAPI) | Solarbio | S2110 | |
| DNA提取 | DNease血液和组织DNA提取试剂盒 | Qiagen | -- |
| 细胞游离激酶实验 | AMPK重组蛋白复合物 | SinoBiological | CT005-H0907B |
| Camkk2重组蛋白 | Thermofisher | PR7777A | |
| Cdo1重组蛋白 | MedChemExpress | HY-P70066 | |
| 血糖检测 | 血糖仪 | Roche | -- |
| 胰岛素耐量试验 | 人胰岛素 | Eli Lilly | -- |
| 代谢笼 | TSE代谢笼系统 | Germany Instruments | XYZ, 6M/R |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 运动干预模型 | 跑台运动方案:1周适应+7周训练(每周6天),具体速度和时间需核对图1a和Methods;力竭测试方案:起始5 m/min 3 min,每3 min增加5 m/min至28 m/min 阅读提示:Methods 'Treadmill training and time to exhaustion'及图1a |
| NAFLD小鼠模型 | 6周龄小鼠HFD(D12492)喂养16周;运动组在最后8周进行跑台训练;Cdo1LKO和Cdo1LTG小鼠每组n=6 阅读提示:图2d和Methods 'Animals' |
| 体外脂肪变性模型 | 原代肝细胞或HepG2细胞使用0.6 mM FFAs(油酸:棕榈酸=2:1)处理24小时;腺病毒感染24小时后加FFAs;shRNA敲低后48小时检测 阅读提示:图4、图5、图6图注及Methods 'Lipid analysis' |
| Forskolin处理 | 原代肝细胞和HepG2细胞使用10 μM Forskolin处理12小时 阅读提示:图1j-o图注 |
| AMPK/Camkk2/LKB1敲低实验 | shRNA序列见Methods;腺病毒感染48小时后检测;敲低效率需验证 阅读提示:Methods 'Generation of recombinant adenoviruses and RNA interference'及图6、图7 |
| 细胞游离激酶实验 | AMPK 200 ng、Camkk2 300 ng、Cdo1 125 ng,30°C孵育30分钟,激酶缓冲液成分见Methods 阅读提示:Methods 'Cell-free kinase assay' |
| 代谢表型检测 | GTT:禁食18小时,腹腔注射D-葡萄糖2 mg/g体重;ITT:禁食6小时,腹腔注射人胰岛素0.8 mU/g体重;血糖检测时间点0、15、30、60、90、120分钟 阅读提示:Methods 'Mouse metabolic and liver function assays' |