建立可诱导同步铁死亡模型
获得同步、完全的铁死亡细胞,区分死亡阶段并避免残留活细胞干扰疫苗实验
构建多西环素诱导GPX4敲低的MCA205(iGPX4KD)细胞,在Fer1存在下诱导,去除Fer1后同步死亡;通过活细胞成像、ROS检测、DAMP释放等划分初始、中间和终末阶段。
Cancer cells dying from ferroptosis impede dendritic cell-mediated anti-tumor immunity.
包含体外细胞模型、DC共培养、转录组分析和多种体内预防性及治疗性疫苗模型,并有功能验证。
MCA205纤维肉瘤细胞 iGPX4KD MCA205细胞(多西环素诱导GPX4敲低) 骨髓来源树突状细胞(BMDC) C57BL/6J小鼠预防性及治疗性疫苗模型
铁死亡诱导条件:ML162 0.5 µM 14 h、RSL-3 0.5 µM 14 h、Erastin 2.0 µM,以及iGPX4KD多西环素1 µg/ml诱导48 h后去除Fer1同步化 预防性疫苗模型:MCA205 3×10^5细胞左侧皮下接种,7天后右侧挑战3×10^4活细胞,观察30天 DC成熟与吞噬:BMDC与MCA205比例1:1、1:5、1:10,共培养过夜或2 h,流式检测CD86、CD40、MHCII、PD-L1 抗原交叉呈递:BMDC与OVA及铁死亡细胞共培养18 h,洗去后与OT-I CD8+ T细胞共培养72 h,CFSE稀释检测增殖 转录组分析:ML162诱导的Jurkat铁死亡细胞与BMDC共培养4 h,分选BMDC-fer进行RNA-seq(n=4)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得同步、完全的铁死亡细胞,区分死亡阶段并避免残留活细胞干扰疫苗实验
构建多西环素诱导GPX4敲低的MCA205(iGPX4KD)细胞,在Fer1存在下诱导,去除Fer1后同步死亡;通过活细胞成像、ROS检测、DAMP释放等划分初始、中间和终末阶段。
验证铁死亡癌细胞能否激发抗肿瘤免疫保护
用ML162诱导的MCA205或iGPX4KD初始/终末阶段细胞左侧皮下接种,7天后右侧挑战活MCA205或B16-OVA细胞,监测肿瘤生长。
明确铁死亡细胞与DC相互作用时对成熟、吞噬和细胞因子产生的影响
将BMDC与不同阶段铁死亡MCA205共培养,流式检测CD86、CD40、MHCII、PD-L1及细胞因子;用CypHer标记肿瘤细胞、CFSE或CellTraceViolet标记BMDC检测吞噬;用BODIPY 493/503检测脂滴积累。
从转录水平揭示铁死亡细胞对DC抗原呈递相关基因和通路的影响
将ML162诱导的荧光标记Jurkat铁死亡细胞与小鼠BMDC共培养4 h,分选吞噬的BMDC进行RNA-seq和GSEA。
功能验证铁死亡细胞暴露后的DC能否交叉呈递抗原并刺激抗原特异性CD8+ T细胞增殖
BMDC与可溶性OVA及铁死亡或坏死细胞共培养,洗去后与OT-I Rag2−/−来源的CFSE标记CD8+ T细胞共培养72 h,流式检测增殖。
比较铁死亡与坏死性凋亡负载cDC1的治疗效果,并检验铁死亡对免疫原性凋亡疫苗潜力的影响
用负载 ferroptotic 或 necroptotic BM1-OVA 的cDC1皮内注射B16-OVA荷瘤小鼠;或将ML162杀伤的MCA205与米托蒽醌处理的MCA205混合进行预防性接种。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Gibco RPMI培养基 | Gibco | 52400 |
| 铁死亡诱导 | ML162 | Aobious Inc. | AOB1514 |
| RSL-3 | Absource | S8155 | |
| Erastin | Absource | S7242 | |
| 细胞死亡抑制 | zVAD.fmk | VWR International | BACE4026865.0005 |
| Fer1 | Xcess Biosciences | M60042-2s | |
| 去铁胺 | Sigma-Aldrich | D-9533 | |
| 凋亡诱导 | 米托蒽醌 | Sigma Aldrich | M-6545 |
| 多柔比星 | Sigma Aldrich | D-1515 | |
| iGPX4KD构建 | 嘌呤霉素 | Sigma-Aldrich | P7255 |
| iGPX4KD诱导 | 多西环素 | Sigma Aldrich | D8991 |
| Western blot | 抗GPX4抗体 | Abcam | ab125066 |
| 抗肌动蛋白抗体 | MP | 69100 | |
| 抗磷酸化IκBα (Ser32/36)抗体 | Cell Signaling Technology | 9246 | |
| 抗IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 9242 | |
| HRP标记抗兔抗体 | VWR International | NA934 | |
| HRP标记抗小鼠抗体 | VWR International | NA931 | |
| HRP标记抗微管蛋白抗体 | Abcam | ab21058 | |
| 细胞死亡检测 | SytoxGreen | -- | -- |
| 磷脂酰丝氨酸外翻检测 | Annexin V-APC | eBioscience | BMS306APC/100 |
| Annexin-FITC | ThermoFisher | BMS306FI | |
| 细胞死亡检测 | SytoxBlue | Molecular Probes | S11348 |
| 7-AAD | Molecular Probes | A-1310 | |
| DRAQ7 | Biostatus UK | DR71000 | |
| 脂质ROS检测 | C11-BODIPY | Molecular Probes | D3861 |
| 胞质ROS检测 | DHR123 | Sigma Aldrich | D-1054 |
| ATP释放检测 | CellTiter-Glo发光细胞活力检测 | Promega | G7570 |
| LDH释放检测 | Pierce LDH细胞毒性检测 | Life Technologies | 88954 |
| HMGB1释放检测 | HMGB1酶联免疫吸附测定 | Tecan | ST51011 |
| 活细胞成像 | 8孔腔室载玻片 | iBidi | 80826 |
| 钙网蛋白检测 | 抗钙网蛋白抗体 | Abcam | ab2907 |
| 同型对照 | ThermoFisher | PA5-23094 | |
| 山羊抗兔-FITC抗体 | Thermo Fisher Scientific | 35553 | |
| BMDC分离 | ACK裂解液 | Biowhittaker Inc | 10-548E |
| BMDC培养 | GM-CSF | Miltenyi Biotech | 130-095-739 |
| 吞噬实验 | CellTrackerGreen | ThermoFisher | C2925 |
| CD11c-APC抗体 | BioLegend | 117309 | |
| Fc Block抗体 | BD Pharmingen | 553142 | |
| CellTraceViolet | Molecular Probes | C34557 | |
| TAMRA | Invitrogen | C2211 | |
| CypHer Red | VWR International | PA15405 | |
| 细胞松弛素D | Sigma Aldrich | C8273 | |
| Annexin V(未标记) | BioLegends | 640902 | |
| BMDC成熟分析 | 脂多糖 | Sigma Aldrich | L-2630 |
| CD11c-BV650抗体 | BioLegend | 117339 | |
| MHCII-APC/eFluor700抗体 | eBioscience | 47-5321-82 | |
| CD86-PE/Cy7抗体 | BioLegend | 105116 | |
| CD80-PE/Cy5抗体 | BioLegend | 104712 | |
| CD40-APC抗体 | BD Pharmingen | 558695 | |
| CD274-PE抗体 | eBioscience | 12-5982-82 | |
| 脂滴分析 | BODIPY 493/503 | Molecular Probes | D3922 |
| 抗原交叉呈递 | 无内毒素卵清蛋白 | Invivogen | vac-pova-100 |
| T细胞分离 | MagniSort小鼠CD8 T细胞富集试剂盒 | eBioscience | 8804-6822-74 |
| T细胞增殖检测 | CFSE | Thermo Fisher Scientific | 8804-6822-74 |
| T细胞染色 | CD3-AF700抗体 | ThermoFisher | 56-0032-82 |
| CD8-PE/Cy7抗体 | ThermoFisher | 25-0081-82 | |
| 治疗性疫苗 | Liberase TM研究级 | Roche | 5401127001 |
| DNA酶I | Roche | 10104159001 | |
| HBSS | Gibco | 14175-053 | |
| ACK裂解液 | Gibco | A1049201 | |
| cDC1分选 | XCR1-BV650抗体 | BioLegend | 148220 |
| CD11c-BV711抗体 | BD Pharmingen | 563048 | |
| 可固定活力染料eFluor 506 | ThermoFisher | 65-0866-14 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 铁死亡诱导与同步化 | ML162、RSL-3、Erastin浓度及处理时间;iGPX4KD多西环素浓度和诱导时长;Fer1去除时间点 阅读提示:Methods“Cancer cell lines and cell death-inducing reagents”及“Generation of inducible GPX4 knockdown cellular model”;Fig. 2b、c |
| 预防性疫苗接种模型 | 接种细胞数量、接种部位、挑战细胞数量与时间、观察终点及安乐死标准 阅读提示:Methods“Prophylactic vaccination model”;Fig. 1a、Fig. 2g、Fig. 6a |
| DC成熟与吞噬实验 | BMDC与肿瘤细胞比例、共培养时间、流式抗体及吞噬抑制剂浓度 阅读提示:Methods“Analysis of BMDC maturation”和“Phagocytosis assay”;Fig. 3b、e |
| 抗原交叉呈递与T细胞增殖 | OVA浓度、BMDC与肿瘤细胞共培养时间、T细胞来源与标记、共培养时间 阅读提示:Methods“Antigen-specific T-cell proliferation”;Fig. 5a |
| 治疗性疫苗接种模型 | cDC1分选标志、负载的死亡细胞类型与诱导条件、注射细胞数及注射部位 阅读提示:Methods“Therapeutic vaccination model”;Fig. 6c |