AP-2α与AP-2β在远端肾单位的表达定位
确定AP-2α与AP-2β在成年小鼠肾脏中的空间分布及其相互依赖性。
分析三个独立成年小鼠肾脏scRNA-Seq数据集,并对WT及条件敲除小鼠肾脏切片进行AP-2α、AP-2β与各节段标志物的共免疫荧光;对Six2Cre+Tfap2afl/flTfap2bfl/WT小鼠全肾进行RNA-Seq。
Transcription factors AP-2α and AP-2β regulate distinct segments of the distal nephron in the mammalian kidney.
采用多种条件性敲除小鼠模型,结合免疫荧光、蛋白免疫印迹、RNA-Seq及肾功能检测进行体内功能与机制验证
Six2Cre+条件性敲除小鼠(靶向CDs近端全部肾单位) Aqp2Cre+条件性敲除小鼠(靶向CTs/CDs主细胞) PvalbCre+条件性敲除小鼠(靶向DCT1s) TCF/Lef:H2B-GFP β-catenin报告小鼠
Aqp2Cre+Tfap2afl/fl小鼠在2–4月龄出现BUN升高及髓质集合管扩张,而皮质CDs/CTs正常 Six2Cre+Tfap2bfl/fl小鼠存活至4周龄比例仅1.8%(预期25%),1–2月龄出现NCC缺失、囊肿、纤维化及肾功能衰竭 Six2Cre+Tfap2bfl/WT小鼠随年龄出现BUN升高、多尿、烦渴、NCC蛋白进行性丢失及β-catenin/mTOR过度激活 PvalbCre+Tfap2bfl/fl小鼠DCT1中NCC、Pvalb、EGF蛋白减少,9–12月龄24小时尿量增加并伴低镁血症 免疫荧光与RNA-Seq确认六种Cre品系靶向特异性及Tfap2a外显子5/6、Tfap2b外显子6的有效切除
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定AP-2α与AP-2β在成年小鼠肾脏中的空间分布及其相互依赖性。
分析三个独立成年小鼠肾脏scRNA-Seq数据集,并对WT及条件敲除小鼠肾脏切片进行AP-2α、AP-2β与各节段标志物的共免疫荧光;对Six2Cre+Tfap2afl/flTfap2bfl/WT小鼠全肾进行RNA-Seq。
评估AP-2α对集合管发育及成年期结构维持的作用。
利用Aqp2Cre+Tfap2afl/fl小鼠,检测生存率、BUN、肾脏组织形态、Aqp2/Aqp3免疫定位、尿液及血清电解质、24小时禁水浓缩能力,并进行β-catenin相关Western blot。
评估AP-2α对CDs近端全部肾单位发育及功能的作用。
构建Six2Cre+Tfap2afl/fl小鼠,检测孟德尔比例、BUN、尿量、饮水、体重及EGF、NCC表达与DCT标志物共定位。
评估AP-2β完全缺失对DCT形成及出生后肾功能的影响。
扩大Six2Cre+Tfap2bfl/WT杂交,统计279只子代中Six2Cre+Tfap2bfl/fl存活情况,对存活1–2月龄小鼠进行H&E、免疫荧光、Western blot及BUN检测。
区分AP-2β在DCT1s维持终末分化中的作用与其在早期DCT形成中的作用。
利用PvalbCre+Tfap2bfl/fl小鼠在早期DCT已形成后特异性失活DCT1中的AP-2β,检测NCC、Pvalb、EGF蛋白、BUN、体重、24小时尿量及组织形态。
检验AP-2β基因剂量对成年DCT功能维持的影响。
构建Six2Cre+Tfap2bfl/WT及Six2Cre+Tfap2afl/flTfap2bfl/WT小鼠,纵向检测BUN、尿量、饮水、体重、肾脏组织学、NCC/EGF/SFRP1表达、β-catenin/mTOR激活、尿微量白蛋白及肾小球硬化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 代谢笼 | Techniplast | 3600M021 |
| 血清生化 | Dri-Chem7000生化分析仪 | Heska | -- |
| 尿液生化 | Roche ModP分析仪 | Roche | -- |
| 尿渗透压检测 | Advanced Instruments微量渗透压仪3300型 | Advanced Instruments | Model 3300 |
| 尿微量白蛋白检测 | Siemens DCA Vantage分析仪 | Siemens | -- |
| 免疫荧光 | 兔抗AP-2α抗体 | Abcam | ab108311 |
| 兔抗AP-2β抗体 | Cell Signaling Technology | 2509 | |
| 兔抗AP-2β抗体 | Atlas Antibodies | HPA034683 | |
| 大鼠抗F4/80-Alexa647抗体 | BioLegend | 123121 | |
| 兔抗Slc3a1抗体 | Proteintech | 16343-1-AP | |
| 小鼠抗Calb1抗体 | Sigma Aldrich | C9848 | |
| 山羊抗Aqp2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-9882 | |
| 兔抗NCC抗体 | Millipore | AB3553 | |
| 兔抗NKCC2抗体 | Cell Signaling Technologies | 38436 | |
| 兔抗小清蛋白抗体 | Abcam | ab11427 | |
| 大鼠抗PDGFRβ抗体 | Thermo Fisher Scientific | 14-1402-82 | |
| 大鼠抗CD45抗体 | BD Pharmingen | 550539 | |
| 大鼠抗CD133抗体 | ebioscience | 14-1331-80 | |
| 兔抗TFEB抗体 | Bethyl | A303-672A | |
| 兔抗Aqp3抗体 | Sigma-Aldrich | A0303 | |
| 山羊抗EGF抗体 | R&D Systems | AF2028 | |
| 兔抗磷酸化4E-BP1(Thr37/46)抗体 | Cell Signaling Technology | 2855 | |
| 兔抗cleaved caspase-3(Asp175)抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 鸡抗GFP抗体 | Rockland | 600-901-215 | |
| 兔抗GFP抗体 | Thermo Fisher Scientific | A-11122 | |
| 兔抗Ki67抗体 | Abcam | ab16667 | |
| Cy3标记小鼠单克隆SMA抗体(克隆1A4) | Sigma-Aldrich | A2547 | |
| 大鼠抗CD31抗体 | BD Biosciences | 550274 | |
| Alexa647标记小鼠抗V-ATPase B1/B2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-55544 AF647 | |
| Alexa488标记鬼笔环肽 | Molecular Probes | A-12379 | |
| Alexa647标记鬼笔环肽 | Thermo Fisher Scientific | A22287 | |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | D3571 | |
| 罗丹明标记花生凝集素 | Vector Laboratories | RL-1072 | |
| 荧光素标记四叶莲凝集素 | Vector Laboratories | FL-1321 | |
| 罗丹明标记小麦胚芽凝集素 | Vector Laboratories | RL-1022 | |
| Western blot | 兔多克隆抗β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 4970 |
| 兔抗活性β-catenin(非磷酸化Ser33/37/Thr41)抗体 | Cell Signaling Technology | 8814S | |
| 兔抗总GSK-3β抗体 | Cell Signaling Technology | 9315 | |
| 兔抗总GSK-3β抗体 | Cell Signaling Technology | 12456 | |
| 兔抗总4E-BP1抗体 | Cell Signaling Technology | 9644 | |
| 兔抗p70 S6激酶(49D7)抗体 | Cell Signaling Technology | 2708 | |
| HRP标记抗兔IgG | Cell Signaling Technology | 7074S | |
| HRP标记抗山羊IgG | Santa Cruz Biotechnology | sc-2020 | |
| SuperSignal WestPico化学发光底物 | Pierce | -- | |
| RNA-Seq | Directzol RNA MiniPrep试剂盒 | Zymo | R2050 |
| NEBNext Ultra定向RNA文库构建试剂盒 | -- | E7420L | |
| Kapa文库定量试剂盒 | -- | KK4824 | |
| Illumina HiSeq 2500测序仪 | Illumina | -- | |
| RT-PCR | Transcriptor第一链合成试剂盒 | Roche | -- |
| LightCycler 480 SYBR Green I预混液 | Roche Applied Science | -- | |
| LightCycler 480系统 | -- | -- | |
| RNA-Seq | BioRad CFX96定量PCR仪 | BioRad | -- |
| Western blot | NuPage 4-12%Bis-Tris凝胶 | Life Technologies | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| AP-2α在集合管主细胞中的失活 | 小鼠品系Aqp2Cre+Tfap2afl/fl(仅雌性Aqp2Cre+用于交配);观察时间点1、2–4、6月龄;BUN及组织形态检测终点 阅读提示:Methods Animals;Fig. 2b–e及Supplementary Fig. S6 |
| AP-2α在Six2+肾单位前体细胞中的失活 | Six2Cre+Tfap2afl/fl小鼠4周龄孟德尔比例;BUN检测至13–16月龄;2月龄RT-PCR每组n=7 阅读提示:Fig. 3a–f及Supplementary Fig. S9 |
| AP-2β完全缺失 | Six2Cre+Tfap2bfl/fl小鼠1–2月龄;279只子代存活统计;BUN样本量n=9 WT、n=3敲除 阅读提示:Results 'Consequences of lack of AP-2β in NPCs';Fig. 4b |
| DCT1特异性AP-2β失活 | PvalbCre+Tfap2bfl/fl小鼠;16月龄免疫荧光、12月龄Western blot(n=4 WT,n=5敲除);9–12月龄24小时尿量 阅读提示:Fig. 6b–f及Supplementary Fig. S12 |
| AP-2β杂合缺失纵向表型 | Six2Cre+Tfap2bfl/WT小鼠不同年龄点(3、5–6、7.5、13–15月龄);半定量RT-PCR每基因n=9肾脏 阅读提示:Fig. 3b–d、Fig. 8a及Supplementary Fig. S14 |
| 免疫荧光与组织学分析 | 每组至少3只小鼠、每只至少3张切片盲法评估;抗体稀释度及货号 阅读提示:Methods 'Immunolabeling of kidney sections and morphological kidney analyses' |
| 代谢笼与尿液生化 | 单只小鼠24小时代谢笼(3600M021, Techniplast);CO2窒息后心脏采血可人为升高血钾 阅读提示:Methods 'Metabolic cages, serum, and urine chemistries' |