TYLCV感染诱导凋亡与自噬
验证TYLCV感染是否同时激活烟粉虱凋亡和自噬。
对取食TYLCV感染植株24小时的烟粉虱,解剖中肠和唾液腺,进行TUNEL assay和免疫荧光检测ATG8-PE,并用qPCR和免疫印迹检测凋亡与自噬相关基因和蛋白。
PEBP balances apoptosis and autophagy in whitefly upon arbovirus infection.
包含体外蛋白互作、RNAi、药理学处理、免疫荧光及生存率等多层级功能与机制验证
MED烟粉虱成虫 TYLCV侵染番茄植株 烟粉虱中肠和唾液腺组织
烟粉虱获取TYLCV 24小时后取样检测 dsPEBP4饲喂敲低BtPEBP4表达 药理学化合物浓度:mirdametinib、PAC-1、Z-VAD-FMK、rapamycin为10 μM,3-MA为1 μM 各处理至少三个生物学重复 生存率实验每组100头或60头烟粉虱
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TYLCV感染是否同时激活烟粉虱凋亡和自噬。
对取食TYLCV感染植株24小时的烟粉虱,解剖中肠和唾液腺,进行TUNEL assay和免疫荧光检测ATG8-PE,并用qPCR和免疫印迹检测凋亡与自噬相关基因和蛋白。
鉴定与TYLCV CP相互作用的烟粉虱蛋白。
以TYLCV CP为诱饵进行酵母双杂交筛选烟粉虱cDNA文库,对候选PEBP4进行一对一Y2H、Co-IP、GST pull-down和免疫荧光共定位验证。
验证PEBP4在TYLCV诱导的凋亡和自噬中的作用。
通过饲喂dsPEBP4敲低BtPEBP4表达,用qPCR检测凋亡和自噬相关基因表达,用TUNEL和免疫荧光检测凋亡与自噬,用免疫印迹检测Caspase3切割、SQSTM1消耗和ATG8脂化。
探究PEBP4是否通过Raf1/MAPK通路调控凋亡。
用GST pull-down和Co-IP验证PEBP4与Raf1互作,用免疫印迹检测MAPK磷酸化动态及梯度PEBP4或CP的影响,用MEK抑制剂mirdametinib处理并检测凋亡。
验证CP是否通过竞争性结合PEBP4释放ATG8。
用GST pull-down和Co-IP验证PEBP4与ATG8互作,用体外共孵育实验检测梯度CP和PEBP4对自噬的影响,用竞争性pull-down和免疫荧光验证竞争关系。
评估凋亡与自噬平衡对TYLCV载量和烟粉虱生存率的影响。
分别或组合饲喂自噬激动剂rapamycin、自噬抑制剂3-MA、凋亡激动剂PAC-1、凋亡抑制剂Z-VAD-FMK,检测病毒CP蛋白丰度和DNA载量,并记录生存率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 病毒获取与取样 | 烟粉虱取食TYLCV感染植株的时间;中肠和唾液腺解剖时间点 阅读提示:Methods中Insect, plant, and virus及Results第一部分 |
| RNAi敲低 | dsRNA浓度和饲喂时间;dsGFP对照;至少三个生物学重复 阅读提示:Methods中Pharmacological experiments and RNA interference via feeding |
| 药理学处理 | 化合物浓度(rapamycin、PAC-1、Z-VAD-FMK为10 μM,3-MA为1 μM);DMSO对照;饲喂24小时 阅读提示:Methods中Pharmacological experiments and RNA interference via feeding及Fig. 6图注 |
| 生存率分析 | 每组烟粉虱数量(100头或60头);三个生物学重复;观察时间点 阅读提示:Methods中Survival rate analysis及Fig. 6图注 |
| 蛋白互作验证 | Y2H培养基选择(TDO/QDO);Co-IP抗体;GST pull-down竞争实验浓度 阅读提示:Methods中Yeast two-hybrid assays、GST pull-down assays和Co-immunoprecipitation |