SLC46A3的AhR依赖性诱导验证
验证TCDD通过AhR诱导Slc46a3表达及其肝特异性。
小鼠体内TCDD处理,检测不同组织Slc46a3 mRNA;利用Ahr−/−和ArntΔLiv小鼠验证AhR依赖性;ChIP-seq和荧光素酶报告基因 assay 验证DRE位点。
Lysosomal SLC46A3 modulates hepatic cytosolic copper homeostasis.
包含Slc46a3−/−小鼠、原代肝细胞、细胞系及多种功能与机制验证
Slc46a3−/−小鼠 野生型C57BL/6J小鼠 原代肝细胞 Hepa1c1c7细胞
TCDD给药剂量10或200 μg/kg,给药时间3或7天 高脂饮食喂养6周 Slc46a3−/−小鼠与野生型小鼠对照 腺病毒过表达SLC46A3(2×10^10 pfu/mouse) 铜离子检测采用ICP-MS和CF4探针
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TCDD通过AhR诱导Slc46a3表达及其肝特异性。
小鼠体内TCDD处理,检测不同组织Slc46a3 mRNA;利用Ahr−/−和ArntΔLiv小鼠验证AhR依赖性;ChIP-seq和荧光素酶报告基因 assay 验证DRE位点。
确定SLC46A3是否定位于溶酶体。
在Hepa1c1c7细胞中表达eGFP-SLC46A3,与溶酶体标志物LAMP1共定位;分离溶酶体组分进行Western blot。
验证SLC46A3是否调节肝脏和溶酶体铜水平。
ICP-MS检测WT和Slc46a3−/−小鼠肝脏铜含量;分离溶酶体检测铜;使用CF4探针检测溶酶体铜;检测CCS蛋白水平。
验证SLC46A3是否影响线粒体膜电位、形态和功能。
原代肝细胞和Hepa1c1c7细胞中过表达SLC46A3,检测MitoTracker、TMRE、OCR、ATP水平;TEM观察线粒体形态。
验证Slc46a3缺失是否抵抗TCDD诱导的肝脏甘油三酯积累。
WT和Slc46a3−/−小鼠给予TCDD或高脂饮食,检测肝脏TG和NEFA水平,Oil Red O染色。
验证SLC46A3过表达是否直接增加肝脏脂质积累。
通过腺病毒或流体动力学注射过表达SLC46A3,检测肝脏脂质、TG、Adfp mRNA和脂滴大小。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | 抗磷酸化AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | 2535 |
| 抗AMPK抗体 | Cell Signaling Technology | 2532 | |
| 抗磷酸化ACC抗体 | Cell Signaling Technology | 11818 | |
| 抗ACC抗体 | Cell Signaling Technology | 3676 | |
| 抗VDAC抗体 | Cell Signaling Technology | 4661 T | |
| 抗COX IV抗体 | Cell Signaling Technology | 4850 | |
| 抗铁蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-376594 | |
| 抗LC3抗体 | Cell Signaling Technology | 2775 | |
| 抗OPA1抗体 | Cell Signaling Technology | 80471 | |
| 抗小鼠IgG HRP标记二抗 | Cell Signaling Technology | 7076 S | |
| 抗兔IgG HRP标记二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 S | |
| 抗GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47724 | |
| 抗CCS抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-374205 | |
| 抗Drp1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-271583 | |
| 抗GFP抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-9996 | |
| 抗FLAG抗体 | Sigma-Aldrich | F1804 | |
| 铜螯合处理 | Bathocuproinedisulfonic acid | Sigma-Aldrich | -- |
| 脂滴染色 | 尼罗红 | Invitrogen | -- |
| 线粒体染色 | MitoTracker | Invitrogen | -- |
| 铜离子检测 | Phen Green FL | Invitrogen | -- |
| 转染 | JetPEI转染试剂 | VWR International | -- |
| Western blot | 抗Mitofusin2抗体 | Abcam | ab56889 |
| 线粒体膜电位检测 | TMRE | Abcam | -- |
| SOD活性检测 | 超氧化物歧化酶(SOD)试剂盒 | Abcam | -- |
| AhR抑制 | CH-223191 | Tocris | -- |
| 体内DNA递送 | TransIT-QR流体动力学递送溶液 | Mirus | -- |
| ATP测定 | EZ-ATP检测试剂盒 | DoGenBio | -- |
| 铜离子检测 | CF4 | -- | -- |
| 铜离子检测对照 | Ctrl-CF4 | -- | -- |
| 肝TG检测 | 甘油三酯试剂盒 | Wako Chemicals USA Inc. | -- |
| NEFA检测 | 游离脂肪酸试剂盒 | Wako Chemicals USA Inc. | -- |
| 血清ALT检测 | 丙氨酸氨基转移酶试剂盒 | Catachem | -- |
| 血清ALP检测 | 碱性磷酸酶试剂盒 | Catachem | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| TCDD诱导模型 | TCDD剂量(10或200 μg/kg)、给药途径(腹腔注射)、时间(24 h、3天或7天) 阅读提示:Methods: Animals and treatments |
| 高脂饮食模型 | 高脂饮食成分(60% HFD)、喂养时长(6周) 阅读提示:Methods: Animals and treatments |
| SLC46A3过表达 | 腺病毒剂量(2×10^10 pfu/mouse)、流体动力学注射质粒量(20 μg)、检测时间点 阅读提示:Methods: In vivo and in vitro DNA delivery |
| 铜水平检测 | ICP-MS型号(Agilent 7500cs)、CF4浓度(1 μM)、孵育时间(10 min) 阅读提示:Methods: Metal analysis in the liver; Copper transport assay |
| 线粒体功能检测 | MitoTracker浓度(20 nM)、TMRE浓度、OCR测量用Seahorse XF24 阅读提示:Methods: Mitochondria analysis; Cell culture |