EZHIP 限制生殖细胞中 Polycomb 抑制复合物 2 的活性

EZHIP constrains Polycomb Repressive Complex 2 activity in germ cells.

作者信息Roberta Ragazzini, Raquel Pérez-Palacios, Irem H Baymaz, Seynabou Diop, Katia Ancelin, Dina Zielinski, Audrey Michaud, Maëlle Givelet, Mate Borsos, Setareh Aflaki, Patricia Legoix, Pascal W T C Jansen, Nicolas Servant, Maria-Elena Torres-Padilla, Deborah Bourc'his, Pierre Fouchet, Michiel Vermeulen, Raphaël Margueron
PMID31451685
发布时间2019-08-26
DOI10.1038/s41467-019-11800-x

实验完整度

高

包含U2OS细胞系敲除、小鼠敲除模型、人类组织样本、蛋白质组学、ChIP-seq和CUT&RUN等多层证据,并进行功能验证。

主要模型

U2OS 骨肉瘤细胞系(EZHIP−/−、EED−/−) Ezhip 敲除小鼠(CRISPR/Cas9 1.5 kb 缺失) 人类睾丸和卵巢组织样本 EZH1-Flag/EZH2-Flag 敲入小鼠睾丸

重点核对

U2OS EZHIP−/− 与 EED−/− 细胞系的建立及 H3K27me2/3 蛋白水平检测 Ezhip−/− 小鼠睾丸和卵母细胞中 H3K27me3 的免疫荧光和 Western blot 定量 EZHIP 与 PRC2 相互作用的 Flag-IP 和质谱鉴定 EZHIP 缺失对 PRC2 辅因子(AEBP2、JARID2、PALI1)结合化学计量比的影响 Ezhip−/− 雌性小鼠的生育力监测(产仔数、每胎幼崽数)

摘要

Polycomb 蛋白组因在维持转录沉默中的作用而需要正确协调基因表达。它由多个染色质修饰复合物组成,包括沉积 H3K27me2/3 的 Polycomb 抑制复合物 2(PRC2)。在此,我们报道了 PRC2 的一个辅因子 EZHIP(EZH1/2 抑制蛋白)的鉴定,该蛋白主要在性腺中表达。EZHIP 限制 PRC2 的酶活性并减弱核心复合物与其辅助亚基之间的相互作用,但不干扰 PRC2 向染色质的募集。在小鼠中敲除 Ezhip 会导致在精子发生过程中以及卵母细胞成熟晚期 H3K27me2/3 沉积的全局性增加。这不影响卵泡的初始数量,但与衰老过程中卵泡减少相关。我们的结果提示 Ezhip−/− 的成熟卵母细胞可能功能不完全,并表明 Ezhip−/− 雌性的生育力严重受损。总之,我们的研究揭示了 EZHIP 作为配子中染色质景观的调节因子。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
EZHIP 是否在生殖细胞中调控 PRC2 的酶活性及 H3K27me2/3 沉积,并影响配子功能与生育力?
核心机制
EZHIP 作为 PRC2 辅因子,通过减弱核心复合物与辅助亚基(如 AEBP2、JARID2)的相互作用来限制 PRC2 酶活性,但不影响 PRC2 向染色质的募集。
主要证据
在 U2OS 细胞中敲除 EZHIP 导致 H3K27me2/3 全局增加;在 Ezhip−/− 小鼠的精子发生和卵母细胞成熟过程中 H3K27me3 沉积增加;Ezhip−/− 雌性小鼠生育力严重受损,表现为产仔数和每胎幼崽数减少。
研究意义
揭示了 EZHIP 作为配子中染色质景观调节因子的作用,表明 PRC2 活性在生殖细胞中受到严格调控,其失调与雌性生育力受损相关。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

鉴定 PRC2 在性腺中的新辅因子

寻找生殖细胞中调控 PRC2 的未知因子。

利用 EZH1-Flag 和 EZH2-Flag 敲入小鼠睾丸核提取物进行 Flag-IP 和质谱分析,鉴定与 PRC2 相互作用的蛋白;在 HeLa-S3 细胞中过表达 Flag 标记的 EZHIP 进行反向 IP 验证。

2

验证 EZHIP 对 PRC2 酶活性的抑制作用

确定 EZHIP 是否影响 PRC2 的催化活性。

在 U2OS 细胞中敲除 EZHIP,检测 H3K27me2/3 水平;通过回补实验验证 EZHIP 全长及突变体的功能;利用纯化的 PRC2 复合物进行组蛋白甲基转移酶(HMT)实验。

3

分析 EZHIP 对染色质景观的影响

探究 EZHIP 缺失对 H3K27me2/3 基因组分布的影响。

在 U2OS WT、EZHIP−/− 和 EED−/− 细胞中进行 H3K27me3 ChIP-seq 以及 H3K27me2、H3K27ac、H2Aub 的 CUT&RUN。

4

解析 EZHIP 抑制 PRC2 的分子机制

确定 EZHIP 是否影响 PRC2 的染色质结合及与辅因子的相互作用。

通过 SUZ12 CUT&RUN 检测 PRC2 募集;免疫荧光观察 EZHIP 与 EED 共定位;质谱分析 EZHIP 缺失下 PRC2 辅因子化学计量比变化;Co-IP/WB 验证 AEBP2 和 JARID2 与 EZH2 的相互作用。

5

体内验证 Ezhip 缺失对雄性生殖细胞的影响

评估 Ezhip 敲除对精子发生和雄性生育力的影响。

利用 CRISPR/Cas9 构建 Ezhip 敲除小鼠;Western blot 检测睾丸核提取物 H3K27me2/3;免疫荧光观察睾丸切片 H3K27me3;流式分析生殖细胞亚群;精子质量分析;生育力测试。

6

体内验证 Ezhip 缺失对雌性卵母细胞和生育力的影响

评估 Ezhip 敲除对卵母细胞成熟和雌性生育力的影响。

免疫荧光检测 P17 和成年雌性卵泡及 MII 卵母细胞中 H3K27me3 水平;卵泡计数;卵巢重量测量;生育力监测(产仔数、每胎幼崽数);单卵母细胞 RNA-seq。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
Orbitrap Fusion 质谱仪Thermo Fisher Scientific--
Q Exactive 质谱仪Thermo Fisher Scientific--
SuperSignal™ West Pico PLUS 化学发光底物Thermo Fisher--
Flag M2 磁珠SIGMA-ALDRICHA4596
抗CD25-FITC偶联抗体BD Biosciences553866
Alexa Fluor偶联二抗----
DAPI----
聚乙烯亚胺----
潮霉素B----
嘌呤霉素----
孕马血清促性腺激素----
人绒毛膜促性腺激素----
二丁酰环磷酸腺苷Sigma-Aldrich--
透明质酸酶----
RNeasy Mini 试剂盒Qiagen--
High Capacity cDNA 逆转录试剂盒Applied Biosystems4368814
SYBR Green 试剂Roche--
SMART-Seq™ v4 Ultra™ 低输入 RNA 试剂盒Clontech Laboratories--
Nextera XTIllumina--
刀豆蛋白A包被磁珠----
蛋白A-微球菌核酸酶----
Bioruptor 超声破碎仪Diagenode--
Starbright700Biorad--
BIORAD ChemiDoc MP 成像系统Biorad--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
U2OS 细胞敲除与回补实验
U2OS EZHIP−/− 和 EED−/− 细胞系的建立方法(gRNA、同源重组 cassette、抗生素筛选浓度)及回补实验用的 EZHIP 突变体设计
阅读提示:Methods 中 Cell lines 小节及 Fig. 2c 图注
小鼠模型构建与基因型鉴定
Ezhip 敲除小鼠的 CRISPR/Cas9 策略(1.5 kb 缺失)、 founders 筛选及回交方案
阅读提示:Methods 中 Mouse lines 小节及 Supplementary Fig. 5A
H3K27me3 免疫荧光定量
卵母细胞和卵泡中 H3K27me3 免疫荧光染色的抗体、稀释比例、图像采集参数及定量方法
阅读提示:Methods 中 Immunofluorescent staining of GV and MII oocytes 小节及 Fig. 6c–e 图注
生育力监测
雌性小鼠生育力测试的周龄、交配方案、监测持续时间及产仔数统计方法
阅读提示:Methods 中 Mouse fertility evaluation 小节及 Fig. 8c–e 图注
CUT&RUN 实验
CUT&RUN 的细胞数量、spike-in 比例、抗体用量及消化条件
阅读提示:Methods 中 CUT and RUN 小节