体外验证CSE诱导肺上皮细胞铁死亡
明确CSE诱导的细胞死亡是否由铁死亡介导。
在HBECs中给予5% CSE处理24 h,检测C11-BODIPY脂质过氧化、LDH与MTT细胞死亡/活力,并用DFO、Fer-1、liproxstatin-1、Nec-1、zVAD-fmk处理及GPx4 siRNA敲低。
Involvement of cigarette smoke-induced epithelial cell ferroptosis in COPD pathogenesis.
含体外HBEC/BEAS-2B、GPx4敲低、CS暴露小鼠模型、GPx4+/−与GPx4TG小鼠及人体肺组织样本多层验证
人支气管上皮细胞(HBECs)与BEAS-2B细胞 A549细胞 CS暴露野生型及GPx4+/−、GPx4TG小鼠模型 人体肺组织样本(从不吸烟者、非COPD吸烟者、COPD患者)
CSE浓度5%、处理24 h;DFO 100 µM、Fer-1 10 µM、Nec-1 50 µM、zVAD-fmk 20 µM于CSE前1 h预处理 GPx4 siRNA或NCOA4 siRNA转染48 h后予以5% CSE处理 小鼠全身暴露CS,TSP 200 mg/m3,5天/周,1或6个月;使用University of Kentucky 3R4F research cigarettes GPx4+/−、GPx4+/+(WT)与TG(loxP-GPx4):GPx4+/+小鼠分组,年龄与性别匹配,6–8周龄 NCOA4 siRNA 15 µg经气管内给予,使用in vivo-jetPEI,第1天给药,第1–7天CS暴露
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确CSE诱导的细胞死亡是否由铁死亡介导。
在HBECs中给予5% CSE处理24 h,检测C11-BODIPY脂质过氧化、LDH与MTT细胞死亡/活力,并用DFO、Fer-1、liproxstatin-1、Nec-1、zVAD-fmk处理及GPx4 siRNA敲低。
探究CSE暴露下游离铁蓄积与铁蛋白降解的机制。
在BEAS-2B和HBECs中检测ferritin、NCOA4表达时程,使用calcein-AM与ICP-MS检测游离铁,NCOA4 siRNA、ATG5 siRNA、Pepstatin A/E64、MG132处理评估铁蛋白降解途径,并检测ferritin与LC3-GFP共定位及NCOA4敲低对脂质过氧化和细胞死亡的影响。
在动物模型中验证铁死亡参与CS暴露及GPx4的调控作用。
WT、GPx4+/−和GPx4TG小鼠接受全身CS暴露,检测肺组织非血红素铁、ferritin、NCOA4、PC/PE过氧化产物、4-HNE、TUNEL、cleaved caspase-3及线粒体形态。
验证NCOA4介导的铁蛋白自噬在体内CS诱导铁死亡中的作用。
WT小鼠经气管内给予NCOA4 siRNA后CS暴露7天,检测支气管上皮细胞NCOA4、ferritin、4-HNE表达及TUNEL阳性细胞。
明确GPx4调控的铁死亡对COPD样病理表型的作用。
GPx4+/−、WT和GPx4TG小鼠CS暴露4周或6个月,检测BALF炎症细胞计数、IL-33、IL-1α、HMGB-1、TNF-α,以及肺泡平均线性截距和气道壁厚度。
在人体样本中评估GPx4、NCOA4、铁蓄积和脂质过氧化与COPD的关系。
检测从不吸烟者、非COPD吸烟者和COPD患者来源HBECs及肺组织中的GPx4、NCOA4表达,Perls’ DAB染色、4-HNE染色、LC-MS检测PC/PE过氧化产物及TEM观察线粒体形态,并进行与FEV1/FVC的相关分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 支气管上皮生长培养基 | Lonza | CC-3170 |
| RPMI 1640培养基 | Gibco Life Technologies | 11875-093 | |
| 胎牛血清 | Gibco Life Technologies | 26140-079 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco Life Technologies | 15140-122 | |
| DMEM培养基 | Gibco Life Technologies | 11965-092 | |
| Western blot | 兔抗铁蛋白重链抗体 | Abcam | 65080 |
| 兔抗NCOA4抗体 | Abcam | 86707 | |
| 兔抗NCOA4抗体 | Thermo Fischer Scientific | PA5-36391 | |
| 兔抗ATG5抗体 | Cell Signaling Technology | 2630 | |
| 兔抗caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9665 | |
| 兔抗cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 兔抗GPx4抗体 | Abcam | 125066 | |
| Western blot/免疫组化 | 兔抗4-HNE抗体 | Abcam | 46545 |
| Western blot | 兔抗IRP-1抗体 | Cell signaling | 20272 |
| 兔抗IRP-2抗体 | Cell signaling | 37135 | |
| 兔抗转铁蛋白受体抗体 | Cell signaling | 13113 | |
| 山羊抗膜铁转运蛋白抗体 | Santa cruz | sc-49668 | |
| 小鼠抗β-actin抗体 | Sigma-Aldrich | A5316 | |
| 药物处理 | 去铁胺 | Sigma-Aldrich | D9533 |
| Ferrostatin-1 | Sigma-Aldrich | SML0583 | |
| Necrostatin-1 | Sigma-Aldrich | N9037 | |
| z-VAD-fmk | Promega | G7231 | |
| 胃蛋白酶抑制剂A | Peptide Institute | 4397 | |
| E64d | Peptide Institute | 4321-v | |
| 巴弗洛霉素A1 | Sigma-Aldrich | B1793 | |
| MG-132 | Enzo Life Science | BML-P102 | |
| Liproxstatin-1 | Sigma-Aldrich | SML1414 | |
| N-乙酰半胱氨酸 | Wako | #017-05131 | |
| 免疫荧光染色 | Hoechst 33258 | Sigma-Aldrich | 861405 |
| LC-MS | 16:0 PC-d75内标 | Avanti Polar Lipids | 860358 |
| 质粒转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen Life Technologies | 11668-027 |
| 细胞筛选 | G418 | Wako | 070-05183 |
| 细胞转染 | Neon转染系统 | Invitrogen Life Technologies | MPK5000 |
| 优化转染试剂盒 | Invitrogen Life Technologies | MPK10096 | |
| CSE制备 | 0.22 μm滤器 | Merck Millipore | SLGS033SS |
| 游离铁检测 | 2,2-联吡啶 | Sigma-Aldrich | D216305 |
| ICP-MS | 8900 ICP-QQQ电感耦合等离子体串联质谱仪 | Agilent technology | 8900 ICP-QQQ |
| 激光烧蚀ICP-MS | NWR 213激光烧蚀系统 | Electro Scientific Industries | NWR 213 |
| 铁含量检测 | 铁含量检测试剂盒 | Abcam | 83366 |
| 细胞死亡检测 | LDH细胞毒性检测试剂盒 | Roche | 4744926 |
| 细胞活力检测 | MTT细胞活力检测试剂盒 | Roche | 11465007001 |
| TUNEL检测 | DeadEnd荧光TUNEL检测系统 | Promega | G3250 |
| 脂质过氧化检测 | C11-BODIPY 581/591探针 | Invitrogen | C10445 |
| 在体siRNA递送 | 体内jet PEI转染试剂 | Polypulus Transfection Inc | -- |
| MicroSprayer喷雾器 | Penn-Century | IA-1C | |
| 高压注射器 | Penn-Century | FMJ-250 | |
| 蛋白提取 | 蛋白提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | 78510 |
| 完整蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 589297001 | |
| 磷酸酶抑制剂 | Roche | 4906845001 | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 |
| 细胞裂解 | RIPA裂解液 | Thermo Fisher Scientific | 89900 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 11697498001 | |
| 原钒酸钠 | Wako | 13721-39-6 | |
| Western blot | 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | ISEQ00010 |
| HRP标记抗小鼠IgG二抗 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| HRP标记抗兔IgG二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 化学发光检测试剂 | Thermo scientific | 34080 | |
| 化学发光检测试剂 | BIO-RAD | 1705061 | |
| ChemiDoc Touch成像系统 | BIO-RAD | ChemiDoc Touch | |
| ELISA | IL-1α ELISA试剂盒 | R&D | #DY400 |
| IL-33 ELISA试剂盒 | R&D | #DY3626 | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | R&D | #DY410 | |
| HMGB1 ELISA试剂盒 | SHINO-TEST | #326054329 | |
| 免疫荧光染色 | Triton X-100 | Wako | 16024751 |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | A2153 | |
| 共聚焦显微镜 | LSM880共聚焦激光扫描显微镜 | Carl Zeiss | LSM880 |
| 荧光显微镜 | BZ-X700荧光显微镜 | Keyence | BZ-X700 |
| LC-MS | QTRAP 4500四极杆线性离子阱混合质谱仪 | AB Sciex | QTRAP 4500 |
| Nexera XR高效液相色谱仪 | Shimadzu Co. | Nexera XR | |
| XBridge BEH C18色谱柱 | Waters | XBridge BEH C18 | |
| 透射电子显微镜 | Hitachi H-7500透射电子显微镜 | Hitachi | H-7500 |
| CS暴露 | InExpose全身暴露系统 | SCIREQ | InExpose |
| 3R4F研究用香烟 | University of Kentucky | 3R4F |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外CSE处理与铁死亡检测 | CSE浓度5%、处理时间24 h;DFO 100 µM、Fer-1 10 µM、Nec-1 50 µM、zVAD-fmk 20 µM均为CSE前1 h预处理;GPx4 siRNA转染48 h后处理;C11-BODIPY 581/591 1 µM孵育30 min 阅读提示:Methods“Measurement of lipid peroxidation in vitro”与Fig. 1图注 |
| NCOA4介导的铁蛋白自噬检测 | 5% CSE处理;NCOA4或ATG5 siRNA转染48 h;Pepstatin A 10 µg/ml与E64 10 µg/ml;MG132处理浓度:文中未明确说明;calcein-AM 0.2 µM、37 °C 7 min、2,2-Bipyridyl 100 µM 阅读提示:Methods“Perls’ DAB staining and non-hem iron measurements”与Fig. 2图注 |
| 小鼠CS暴露与GPx4基因型分组 | TSP 200 mg/m3、5天/周、1或6个月;6–8周龄、年龄与性别匹配;GPx4+/−、GPx4+/+(WT)与TG(loxP-GPx4):GPx4+/+分组;使用University of Kentucky 3R4F research cigarettes 阅读提示:Methods“Cigarette smoke exposure”与“Animal models”;Fig. 3、Fig. 4图注 |
| 体内NCOA4敲低 | NCOA4 siRNA 15 µg/只;in vivo-jetPEI体积25 µl、核酸磷酸与阳离子脂质氮电荷比1:6;第1天经气管内给药;CS暴露第1–7天,第7天处死 阅读提示:Methods“In vivo knockdown of NCOA4 in lung using RNAi”与Supplementary Fig. 6 |
| 人体样本来源与分组 | HBEC:从不吸烟者n=6、非COPD吸烟者n=6、COPD患者n=7;肺匀浆NCOA4 Western blot:从不吸烟者n=5、非COPD吸烟者n=6、COPD患者n=15;LC-MS:非COPD吸烟者n=6、COPD患者n=6–7;样本来自肺癌肺切除/肺叶切除标本 阅读提示:Methods“Cell culture, antibodies, and reagents”与Fig. 5图注 |
| 形态学与炎症表型分析 | CS暴露4周用于BALF细胞计数与细胞因子ELISA;6个月用于肺泡MLI与气道壁厚度分析;形态学每组n=3–6只小鼠;气道分析选用8–15条随机气道,平均大小381 ± 64 µm 阅读提示:Methods“Morphometric analysis”与Fig. 4图注 |