患者队列METTL5变异筛选与致病性验证
探究METTL5变异与男性不育的相关性。
对1,427例男性不育患者和800例 fertile 对照进行WES,Sanger测序确认变异,minigene assay验证剪接变异,Western blot检测突变体蛋白表达。
METTL5 deficiency induces oligoasthenoteratozoospermia via impaired 18S rRNA m6A methylation in humans and mice
包含患者WES队列、细胞系功能验证、Mettl5敲除小鼠体内模型、Ribo-seq及蛋白组学机制验证
1,427例男性不育患者及800例 fertile 对照 GC-2spd(ts)细胞系 Mettl5敲除小鼠
患者队列:1,427例OAT/弱畸精子症患者与800例正常生育对照,WES筛选METTL5变异 小鼠模型:Mettl5−/−雄性小鼠,8周龄,与Mettl5+/+对照比较 精子分析:精子浓度、活力、形态,每只小鼠至少200条精子,实验重复3次 m6A检测:SELECT法检测18S rRNA A1832位点m6A,m6A-IP-qPCR验证,n=3 翻译效率:Ribo-seq结合蔗糖梯度分离多聚核糖体RT-qPCR,n=3
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究METTL5变异与男性不育的相关性。
对1,427例男性不育患者和800例 fertile 对照进行WES,Sanger测序确认变异,minigene assay验证剪接变异,Western blot检测突变体蛋白表达。
验证Mettl5缺失对雄性小鼠生育力和精子发生的影响。
构建Mettl5−/−小鼠,检测睾丸大小、精子计数和活力、精子形态、顶体发育、生育力。
解析METTL5变异或Mettl5缺失导致的精子结构缺陷。
对患者和小鼠精子进行TEM分析,观察顶体、核周鞘、ODF、CP和DMT结构。
验证METTL5对18S rRNA A1832位点m6A修饰的调控。
检测总RNA m6A水平,SELECT法检测18S rRNA A1832 m6A,m6A-IP-qPCR验证。
揭示Mettl5缺失对精子形成相关基因翻译的影响。
Ribo-seq结合单细胞转录组分析,蔗糖梯度分离多聚核糖体RT-qPCR,Western blot验证蛋白水平,TMT蛋白质组学。
评估ICSI对METTL5相关OAT患者的治疗效果。
对4对携带METTL5变异的夫妇进行ICSI,记录受精率、卵裂率、妊娠率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因分型 | 基因型鉴定试剂盒 | Vazyme | PD101-01 |
| DNA提取 | QIAamp DNA血液中提试剂盒 | Qiagen | -- |
| 精子形态分析 | Diff-Quik试剂盒 | Solarbio | G2572 |
| 精子染色 | 苯胺蓝染色试剂盒 | Puhualife | 20190136 |
| 免疫荧光 | 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Invitrogen | D1306 |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher | 11668027 |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher | L3000008 | |
| 定点突变 | Mut Express II快速定点突变试剂盒V2 | Vazyme | C214-01 |
| Western blot | 放射免疫沉淀分析缓冲液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂 | Thermo Fisher | 78442 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher | 23225 | |
| SDS-PAGE蛋白上样缓冲液 | Beyotime | P0015 | |
| 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| ECL底物 | Vazyme | E412-01 | |
| 兔抗AKAP4抗体 | ABclonal | A14813 | |
| 兔抗PGK2抗体 | Proteintech | 13686-1-AP | |
| 兔抗GK2抗体 | Proteintech | 12913-1-AP | |
| 兔抗ODF2抗体 | Proteintech | 12058-1-AP | |
| 兔抗mCherry抗体 | Abcam | ab167453 | |
| 鼠抗FLAG抗体 | Sigma | F1804 | |
| 鼠抗嘌呤霉素抗体 | Sigma | MABE343 | |
| 兔抗β-微管蛋白抗体 | Abcam | ab6046 | |
| 兔抗α-微管蛋白抗体 | Arigo | ARG65693 | |
| 免疫荧光 | 柠檬酸钠缓冲液 | Beyotime | P0083 |
| 驴血清 | The Jackson Laboratory | 017-000-121 | |
| 荧光素标记花生凝集素 | Sigma | L7381 | |
| 抗荧光淬灭封片剂 | Invitrogen | P36970 | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Sigma | T9424 |
| PrimeScript逆转录试剂盒 | Takara | RR047A | |
| Dimer Eraser qPCR预混液 | Takara | RR091B | |
| 蔗糖梯度分离 | PrimeScript逆转录试剂盒 | Takara | RR037A |
| 2× SYBR Green qPCR预混液 | Selleckchem | B21202 | |
| m6A定量 | EpiQuik m6A RNA甲基化定量试剂盒(比色法) | EpigenTek | P-9005-96 |
| m6A-IP-qPCR | m6A抗体 | Proteintech | 68055-1-Ig |
| 蛋白A/G磁珠 | MCE | HY-K0202 | |
| mRNA分离 | VAHTS mRNA捕获磁珠2.0试剂盒 | Vazyme | N403-02 |
| Ribo-seq | RNase I | NEB | M0243S |
| DNase I | NEB | M0303S | |
| SUPERase In RNA酶抑制剂 | Ambion | AM2694 | |
| RNA Clean and Concentrator-25试剂盒 | Zymo Research | R1017 | |
| NEBNext多重小RNA文库构建试剂盒(Illumina) | NEB | E7300L | |
| IVF | 孕马血清促性腺激素 | Ningbo Second Hormone Factory | -- |
| 人绒毛膜促性腺激素 | Ningbo Second Hormone Factory | -- | |
| ICSI | KSOM培养基 | Millipore | MR-020P-D |
| 嘌呤霉素掺入试验 | 嘌呤霉素 | Selleck | S7417 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者队列与变异筛选 | 患者纳入标准(OAT或弱畸精子症,WHO标准)、对照标准(正常精液参数且自然生育至少一孩)、WES平台和变异过滤策略 阅读提示:Methods 'Subject recruitment and METTL5 variant screening'及Table S1 |
| Mettl5敲除小鼠表型 | 小鼠周龄(8周龄)、基因型鉴定引物序列、生育力测试交配方案(每雄与3雌,重复3次) 阅读提示:Methods 'Animals'和'Assessment of fecundity' |
| 精子活力与形态分析 | 精子获能条件(HTF培养基,37°C 10 min)、CASA系统设置(Hamilton Thorne IVOS II默认设置)、每只小鼠至少200条精子、重复3次 阅读提示:Methods 'Sperm analyses' |
| m6A修饰检测 | SELECT法检测18S rRNA A1832位点、m6A-IP-qPCR抗体和磁珠用量、n=3 阅读提示:Methods 'm6A quantification analysis' |
| 翻译效率分析 | Ribo-seq建库和测序平台、蔗糖梯度分离条件(10%–50%,100,000×g 3 h)、多聚核糖体RT-qPCR内参(Gapdh) 阅读提示:Methods 'Ribosome sequencing and analysis'和'Sucrose gradient fractionation analysis' |