临床队列分析ER状态与化疗免疫治疗应答
评估ER状态与NAC及NAC+免疫治疗病理完全缓解率的关联
收集483例接受NAC的乳腺癌患者和110例接受NAC+免疫治疗的患者临床数据,以及外部队列,分析pCR率
Hormone therapy potentiates chemoimmunotherapy by inducing SUMOylation-mediated immunogenic cell death
含临床队列(483例及外部队列)、细胞系、免疫活性小鼠模型,并进行HMGB1 SUMO化位点突变及中和抗体功能验证
ER+乳腺癌患者临床队列(N=483)及外部队列 ER−乳腺癌患者临床队列(N=110)及外部队列 人乳腺癌细胞系MDA-MB-231、MDA-MB-468、MCF-7、BT-474 免疫活性C57BL/6小鼠DMMC-02同种移植瘤模型
ER状态分组(ER+ vs ER−)与病理完全缓解率关联 HMGB1 K114位点SUMO化对HMGB1核释放的调控 ER与HMGB1 HMG Box B结构域及DBD(180–282 aa)的直接相互作用 Epirubicin(7 mg/kg,每周,腹腔注射)与fulvestrant(150 mg/kg,每周,皮下注射)联合PD-1抗体的体内疗效 HMGB1敲除或α-HMGB1中和抗体对联合治疗效果的阻断
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ER状态与NAC及NAC+免疫治疗病理完全缓解率的关联
收集483例接受NAC的乳腺癌患者和110例接受NAC+免疫治疗的患者临床数据,以及外部队列,分析pCR率
构建免疫活性小鼠ER+乳腺癌模型以评估联合治疗
用MPA和DMBA诱导C57BL/6小鼠乳腺肿瘤,将肿瘤片段植入NSG小鼠,分离单细胞并选择性胰酶消化去除成纤维细胞,建立DMMC-02细胞系
确定ER表达是否影响化疗诱导的抗原呈递和T细胞杀伤
用表柔比星IC50浓度处理ER−(MDA-MB-231、MDA-MB-468)和ER+(MCF-7、BT-474)细胞,与DC共培养检测CD80/CD86,与T细胞共培养检测增殖和杀伤
验证ER−乳腺癌化疗后是否发生ICD及HMGB1释放差异
表柔比星处理细胞后,ELISA检测上清HMGB1,免疫荧光和Western blot检测HMGB1核质定位,同时检测CRT暴露和ATP分泌
确定ER是否通过抑制HMGB1 SUMO化调控其释放,并定位关键位点
免疫共沉淀检测SUMO化HMGB1,体外SUMO化实验,构建K82R、K86R、K90R、K114R、K147R、K167R、K177R突变体,免疫共沉淀和结构域缺失突变体定位ER与HMGB1互作结构域
评估fulvestrant+epirubicin+anti-PD-1三联方案的抗肿瘤效果并验证HMGB1依赖性
C57BL/6小鼠乳腺脂肪垫接种DMMC-02细胞,肿瘤可触及后给予epirubicin、fulvestrant、anti-PD-1,部分组加α-HMGB1或α-CD8中和抗体或HMGB1敲除
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞活力检测 | MTS细胞增殖检测试剂盒 | Promega | G3582 |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V凋亡检测试剂盒 | BioLegend | 640911 |
| CD8+ T细胞分离 | CD8+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130–096-495 |
| CD14+ 细胞分离 | CD14+细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-050-201 |
| DC诱导培养 | 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | Novus Biologicals | NBP2-34893 |
| 白细胞介素-4 | Novus Biologicals | NBP2-34896 | |
| CTL诱导培养 | 白细胞介素-2 | PeproTech | 200-02-50 |
| 流式分析 | PE标记抗CD80抗体 | eBioscience | 12-0809-42 |
| APC标记抗CD86抗体 | eBioscience | 17-0862-82 | |
| APC标记抗CD8a抗体 | eBioscience | 17-0086-42 | |
| eFluor 450标记抗穿孔素抗体 | eBioscience | 48-9994-42 | |
| PE标记抗颗粒酶B抗体 | eBioscience | 12-8896-42 | |
| ELISA | HMGB1酶联免疫吸附试剂盒 | Novus Biologicals | NBP2-62781 |
| 免疫荧光 | 兔抗钙网蛋白抗体 | Abcam | ab92516 |
| 抗CD8抗体 | Santa Cruz | sc-7970 | |
| 抗ER-α抗体 | Proteintech | 21244-1 AP | |
| 抗HMGB1抗体 | Abcam | ab18256 | |
| TUNEL实验 | 原位细胞死亡检测试剂盒 | Roche | 11684817910 |
| 免疫组化 | 兔抗人ER-α抗体 | Abcam | ab138492 |
| 兔抗人CD8抗体 | ZSGB-BIO | ZA-0508 | |
| T细胞增殖实验 | 羧基荧光素琥珀酰亚胺酯 | Thermo Fisher | C34554 |
| 细胞毒性实验 | CellTracker深红染料 | Thermo Fisher Scientific | C34565 |
| CD8微珠 | Miltenyi Biotec | 130-045-201 | |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Invitrogen | A22066 |
| 核质分离 | NE-PER核质分离试剂 | Thermo Fisher Scientific | 78833 |
| 蛋白定量 | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | A55860 |
| Western blot | 抗HMGB1抗体 | Abcam | ab79823 |
| 抗组蛋白H3抗体 | CST | 9715S | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | HRP-60004 | |
| 抗SUMO-1抗体 | CST | 4930s | |
| 抗SUMO-2/3抗体 | CST | 4971 | |
| 抗His标签抗体 | Proteintech | 66005-1 Ig | |
| 抗HA标签抗体 | CST | 3724T | |
| 体内中和实验 | 抗HMGB1中和抗体(3E8) | BioLegend | -- |
| 抗CD8中和抗体(2.43) | BioXcell | -- | |
| 体内免疫治疗 | 抗PD-1抗体(RMP1-14) | BioXcell | -- |
| IFN-γ检测 | IFN-γ酶联免疫吸附试剂盒 | DAKAWE | 1210002 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | A33251 |
| RT-qPCR | PrimeScript逆转录预混液 | Takara Bio | RR036A |
| SYBR预混Ex Taq II | TaKaRa Bio | RR820A | |
| ELISpot | IFN-γ酶联免疫斑点试剂盒 | Dakewe Biotech | 2210002 |
| 免疫沉淀 | 免疫沉淀裂解缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | 87787 |
| Dynabeads蛋白A磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 10 001D | |
| 重组蛋白纯化 | HisPur Ni-NTA纯化试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 88229 |
| 重组蛋白浓缩 | Amicon Ultra-0.5离心柱 | Merck Millipore | Z677094 |
| 体外SUMO化 | SUMO化检测试剂盒 | Enzo Life Sciences | BML-UW8955 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床队列分析 | NAC方案:多柔比星或表柔比星60–80 mg/m2,每3周,4–8周期;免疫治疗药物包括pembrolizumab、toripalimab、camrelizumab、sintilimab;外部验证队列I-SPY 1(GSE32603)和I-SPY 2(n=67) 阅读提示:Methods 'Patients and tissue samples'及table 1、table 3 |
| DMMC-02细胞系建立 | MPA pellets释放50 mg/90天;DMBA 5 mg/mL,200 µL口服灌胃,第1、2、4、5、7、8周;NSG小鼠乳腺脂肪垫植入 阅读提示:Methods 'Animal experiments' |
| 体外化疗与免疫细胞共培养 | 表柔比星IC50浓度处理24小时;DC:T细胞比例5:1;CTL杀伤E:T比例10:1,共培养18小时;Subasumstat 100 nM处理24小时 阅读提示:Methods 'Cell culture and induction of cell death'、'Generation of tumor-specific DCs and T cells'、'Cytotoxicity assays' |
| HMGB1 SUMO化位点鉴定 | 突变位点K82R、K86R、K90R、K114R、K147R、K167R、K177R;体外SUMO化反应体系含E1、E2、SUMO1/2、ATP、HMGB1、重组ER 阅读提示:Methods 'In vitro SUMOylation assay'、'Mammalian expression vectors'及figure 4 |
| 体内联合治疗及中和抗体实验 | Epirubicin 7 mg/kg,每周,腹腔注射;fulvestrant 150 mg/kg,每周,皮下注射;anti-PD-1 200 µg,每周两次,腹腔注射;α-HMGB1 1 mg/kg,每周两次;α-CD8 200 µg,每周两次;每组n=6 阅读提示:Methods 'Animal experiments'及figure 6 legend |