iLSEP的定向分化
从hiPS细胞诱导肝窦内皮祖细胞。
采用2D微图案分化方法,依次使用BMP4、VEGF-A、CHIR99021、SCF、bFGF、SB431542、Flt-3 ligand、IL-3、TPO、IL-6、IL-11、IGF-1和EPO等因子,在特定时间点更换培养基,诱导CD34+CD31+CD32+ iLSEP。
Self-organization of sinusoidal vessels in pluripotent stem cell-derived human liver bud organoids
体外2D/3D类器官模型、活体成像、动物移植及患者样本等多层级证据,含WNT2机制和功能验证
hiPS细胞系1383D2、625A4和511-3E IMALI培养的+iLSEP HLBO类器官 NOD/SCID小鼠颅窗移植模型 NSI-FVIII KO血友病A小鼠模型
iLSEP诱导分化中OSM浓度为10 ng ml−1,VEGF-A为5 ng ml−1,培养于37°C、5% CO2和5% O2 IMALI培养中iHE:iAEC:iSTM比例为10:7:1,iLSEP层细胞浓度为16.5 million cells per ml WNT2 siRNA在LNP中的最终浓度为200 nM APTT检测使用30 μl类器官培养上清与270 μl凝血因子缺陷血浆混合 HLBO移植:NSI-FVIII KO小鼠肝内移植三个组装后培养3天的类器官
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从hiPS细胞诱导肝窦内皮祖细胞。
采用2D微图案分化方法,依次使用BMP4、VEGF-A、CHIR99021、SCF、bFGF、SB431542、Flt-3 ligand、IL-3、TPO、IL-6、IL-11、IGF-1和EPO等因子,在特定时间点更换培养基,诱导CD34+CD31+CD32+ iLSEP。
验证iLSEP在OSM信号激活下分化为LSEC样细胞。
将CD34+ iLSEP分选后接种于Matrigel包被的24孔板,在EGM和肝细胞培养基混合液中加入Rock inhibitor和VEGF-A,有或无OSM处理,培养至day 14,通过流式细胞术、免疫细胞化学、扫描电镜和ELISA检测LSEC标志物和FVIII分泌。
建立3D类器官培养条件,使肝和内皮亚群自组织形成肝芽样类器官。
使用倒置多层气液界面培养,在transwell插入物膜上依次添加Matrigel底层、第一层含iHE、iAEC和iSTM的细胞层、第二层含iLSEP的细胞层,胶凝后置于超低吸附板中培养,形成HLBO。
评估HLBO在体内形成功能性血管网络的能力。
将培养3天的HLBO植入免疫缺陷小鼠颅窗或肝脏,通过活体成像、免疫荧光和APTT检测血管灌注、通透性和FVIII分泌。
研究WNT2介导的细胞间串扰在HLBO功能化中的作用。
在IMALI培养中通过LNP-siRNA复合物对iLSEP特异性敲低WNT2,然后通过免疫荧光、流式细胞术和ELISA检测肝细胞标志物、血管密度和FVIII分泌。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| iPS细胞培养 | iMatrix-511 | Nippi | 892012 |
| StemFit AK02N培养基 | Ajinomoto | AJ100 | |
| iLSEP诱导分化 | 骨形态发生蛋白4 | R&D | 314-BP |
| 血管内皮生长因子A | Invitrogen | PHC9393 | |
| CHIR99021 | Cayman Chemical | 13122 | |
| 干细胞因子 | R&D | 255-SC | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | FUJIFILM Wako | 060-04543 | |
| SB431542 | FUJIFILM Wako | 033-24631 | |
| Flt-3配体 | R&D | 308-FK | |
| 白细胞介素3 | R&D | 203-IL | |
| 血小板生成素 | R&D | 288-TPN | |
| 白细胞介素6 | R&D | 206-IL | |
| 白细胞介素11 | R&D | 218-IL | |
| 胰岛素样生长因子1 | R&D | 291-G1 | |
| 促红细胞生成素 | PeproTech | 100-64 | |
| LSEC诱导分化 | 基质胶 | Corning | 354230 |
| 内皮细胞生长培养基 | Lonza | CC-3124 | |
| 肝细胞培养基 | Lonza | CC-3198 | |
| Y-27632 | FUJIFILM Wako | 034-24024 | |
| 抑瘤素M | R&D | 295-OM | |
| IMALI培养 | 悬挂式细胞培养插入物 | Millipore | MCEP06H48 |
| 地塞米松 | Sigma-Aldrich | D2915 | |
| 肝细胞生长因子 | STEMCELL Technologies | 78019 | |
| 超低吸附六孔板 | Corning | 3471 | |
| 免疫荧光染色 | Triton-X | NACALAI TESQUE | 35501-02 |
| 驴血清 | Millipore | S30 | |
| DAPI | DOJINDO | D523 | |
| 扫描电镜 | 扫描电子显微镜 | JEOL | JSM-7900F |
| 临界点干燥仪 | JEOL | JCPD-5 | |
| scRNA-seq | Liberase TM | Roche | 5401119001 |
| DNase I | Sigma | 11284932001 | |
| NextGEM单细胞3′ v.3.1试剂盒 | 10x Genomics | 1000269 | |
| RNA提取与建库 | PureLink RNA mini试剂盒 | Invitrogen | 12183025 |
| SuperScript VILO cDNA合成试剂盒 | Invitrogen | 11754250 | |
| Ion AmpliSeq转录组人基因表达试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | A31446 | |
| Agencourt AMPure XP试剂 | Beckman Coulter | A63880 | |
| Ion文库TaqMan定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 4468802 | |
| Ion 540芯片试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | A27766 | |
| Ion 540 Kit-Chef | Life Technologies | A30011 | |
| RT-qPCR | 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4368813 |
| TaqMan基因表达预混液 | Applied Biosystems | 4370048 | |
| 全组织透明化与成像 | SCALEVIEW-S | FUJIFILM Wako | 299-79901 |
| 透射免疫电镜 | 抗LYVE1抗体 | abcam | ab36993 |
| 纳米金标记的山羊抗兔IgG Fab’片段抗体 | Nanoprobes | 2003 | |
| siRNA转染 | Silencer Select WNT2 siRNA | Thermo Fisher Scientific | s14865/s14866/s14867 |
| BLOCK-iT Alexa Fluor红色荧光对照 | Thermo Fisher Scientific | 14750100 | |
| 谷氨酰胺代谢分析 | T-PER组织蛋白提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | 78510 |
| NanoOrange蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | N6666 | |
| 谷氨酰胺合成酶活性检测试剂盒 | Abcam | ab284572 | |
| 谷氨酰胺/谷氨酸-Glo检测 | Promega | J8021 | |
| 氨检测试剂盒 | Abcam | ab83360 | |
| APTT检测 | 重组人凝血因子VIII | PROSPEC | PRO-318 |
| CRYOcheck凝血因子缺陷血浆 | Precision BioLogic | FDP05/FDP08/FDP09/FDP11 | |
| FVIII抑制剂血浆 | Affinity Biologicals | INH8DP | |
| 阴性FVIII抑制剂对照 | Precision BioLogic | CCIK08 | |
| 凝血酶生成试验 | SMAT-FVIII/FIX试剂盒 | Thrombo Translational Research Lab Inc. | VIII-001a |
| 纤维蛋白凝块 | Alexa Fluor 488标记的纤维蛋白原 | Invitrogen | F13191 |
| 活体成像 | 四甲基罗丹明标记的葡聚糖 | Thermo Fisher Scientific | D7139 |
| Texas Red标记的葡聚糖 | Thermo Fisher Scientific | D1864 | |
| Alexa Fluor 647标记的抗小鼠CD31抗体 | BioLegend | 102516 | |
| 乙酰化低密度脂蛋白 | Thermo Fisher Scientific | L35354 | |
| 出血试验 | Amicon超离心过滤器 | Merck | UFC9010 |
| 移植 | Beriplast P Combi-Set | CSL Behring | -- |
| 美洛昔康 | Boehringer Ingelheim | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| iLSEP诱导分化 | BMP4 80 ng ml−1、VEGF-A 80 ng ml−1、CHIR99021 2 μM、SCF 50 ng ml−1、bFGF 25 ng ml−1、SB431542 2 μM等因子浓度及换液时间点(day 2, 4, 6) 阅读提示:Methods 'iLSEP induction'小节及Fig. 1a |
| LSEC诱导分化 | OSM 10 ng ml−1、VEGF-A 5 ng ml−1、Rock inhibitor 10 μM、细胞密度8.8 × 104 cells per well、培养条件37°C, 5% CO2, 5% O2 阅读提示:Methods 'LSEC induction'小节及Extended Data Fig. 2f |
| IMALI培养形成HLBO | iHE:iAEC:iSTM比例10:7:1、第一层细胞浓度44 million cells per ml、第二层iLSEP浓度16.5 million cells per ml、Matrigel稀释比例1:1、培养基添加因子(dexamethasone 0.1 mM, OSM 10 ng ml−1, HGF 20 ng ml−1等) 阅读提示:Methods 'Formation of HLBO by IMALI culture'小节及Fig. 1a |
| WNT2敲低 | siRNA最终浓度200 nM、LNP-siRNA复合物与iLSEP混合于凝胶中 阅读提示:Methods 'siRNA transfection'小节 |
| APTT检测 | 30 μl培养上清与270 μl凝血因子缺陷血浆混合、热灭活条件56°C 1 h、FVIII抑制剂滴定7.52 BU ml−1 阅读提示:Methods 'Analysis of APTT'小节 |
| HLBO移植 | NSI-FVIII KO小鼠、移植三个组装后培养3天的类器官、移植前静脉注射200 μl 50 U kg−1 rhFVIII、移植后使用meloxicam 5 mg kg−1 阅读提示:Methods 'Transplantation of HLBOs into liver'小节 |