rd10小鼠视网膜变性模型建立与TREM2表达验证
明确TREM2在rd10视网膜变性过程中的表达动态及细胞定位。
使用rd10小鼠,通过免疫荧光、qPCR和Western blot检测P15-P24视网膜中TREM2表达及IBA1阳性细胞定位。
TREM2 restrains myeloid inflammasome activation to protect against photoreceptor degeneration
包含体外scRNA-seq分析、体内rd10小鼠模型、全局和条件性基因敲除、药理学抑制及功能验证等多层级证据。
rd10小鼠视网膜变性模型 rd10;Trem2KO小鼠 rd10;Trem2KO;GsdmdKO小鼠 rd10;Trem2KO;GsdmdcKO小鼠
rd10;Trem2KO与rd10;Trem2WT小鼠在P19-P21的ONL中IBA1阳性髓系细胞积累和TUNEL阳性光感受器凋亡比较 P21 rd10;Trem2KO视网膜中cleaved caspase-1、cleaved GSDMD和cleaved IL-1β在IBA1阳性细胞中的共定位验证 rd10;Trem2KO;GsdmdKO和rd10;Trem2KO;GsdmdcKO小鼠在P30-P35的ONL厚度光感受器核数量评估 disulfiram(100 mg/kg,腹腔注射,P17-P26)处理后rd10;Trem2KO小鼠ONL厚度比较 P21 rd10;Trem2KO与对照视网膜中Trem2、Apoe、Lpl、C1qb、C3、Ifnar1及ISGs的qPCR验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确TREM2在rd10视网膜变性过程中的表达动态及细胞定位。
使用rd10小鼠,通过免疫荧光、qPCR和Western blot检测P15-P24视网膜中TREM2表达及IBA1阳性细胞定位。
验证TREM2缺失是否加速光感受器死亡和RPE结构破坏。
比较rd10;Trem2KO、rd10;Trem2HET和rd10;Trem2WT小鼠在P19-P50的TUNEL染色、ONL厚度、PNA标记视锥细胞和RPE形态及基因表达。
明确TREM2缺失如何改变视网膜髓系细胞的动态积累和与光感受器的空间关系。
通过IBA1免疫荧光在RPE flat mount和视网膜flat mount上定量P23、P28、P50的髓系细胞数量,并通过PNA/IBA1共定位分析空间关系。
揭示TREM2阳性小胶质细胞的转录特征和信号通路。
使用公开P21 rd10和WT视网膜scRNA-seq数据集(GSE183206),比较TREM2阳性与阴性小胶质细胞的差异表达基因、通路富集和细胞间通讯。
验证TREM2缺失是否损害APOE介导的脂质代谢和碎片清除。
通过qPCR和Western blot检测Apoe和Lpl表达,并通过自发荧光颗粒和脂褐素积累评估清除功能。
确定TREM2缺失是否改变补体激活和IFN信号。
通过qPCR和Western blot检测C1qa、C1qb、C3、Ifnar1、Ifna4、Ifnb1及ISGs表达。
验证TREM2缺失是否导致髓系细胞炎症小体激活和GSDMD介导的焦亡。
通过scRNA-seq分析炎症小体相关通路,并通过免疫组化检测cleaved caspase-1、cleaved GSDMD和cleaved IL-1β与IBA1共定位。
验证GSDMD介导的焦亡对TREM2缺失诱导的光感受器变性的功能贡献。
通过全局Gsdmd敲除、Cx3cr1CreER条件性敲除和disulfiram处理,评估ONL厚度和光感受器存活。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| RNA提取 | PureLink™ RNA Mini Kit | Thermo Fisher Scientific | 12183025 |
| 逆转录 | iScript™逆转录预混液 | Bio-Rad | 1708841 |
| qPCR | SYBR Green预混液 | Bio-Rad | 1708886 |
| CFX96实时PCR检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| Western blot | 蛋白酶抑制剂 | Sigma-Aldrich | 11836170001 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23227 | |
| ECL化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | 32106 | |
| 免疫荧光成像 | Zeiss 980共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| 图像分析 | ZEN软件 | Carl Zeiss | -- |
| OriginPro | OriginLab | -- | |
| 共定位分析 | ImageJ (Fiji) Coloc 2插件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| rd10小鼠模型与TREM2基因型分组 | rd10;Trem2WT、rd10;Trem2HET、rd10;Trem2KO小鼠的繁殖策略及对照组选择;使用同窝对照。 阅读提示:Methods中Mice小节及Figure S3繁殖策略。 |
| 光感受器变性和RPE完整性评估 | TUNEL染色、ONL厚度和RPE flat mount分析的时间点(P19-P50)和样本量(n=6-50)。 阅读提示:Figure 1图注及Results对应段落。 |
| 单细胞RNA测序数据分析 | 使用GSE183206数据集,TREM2阳性阈值75% imputed表达,统计方法Wilcoxon rank-sum test和BH校正。 阅读提示:Methods中Single-cell RNA sequencing and data analysis小节。 |
| GSDMD药理学抑制 | disulfiram剂量100 mg/kg,腹腔注射,给药时间P17-P26。 阅读提示:Figure 6E-F图注及Results中对应描述。 |
| qPCR和Western blot验证 | qPCR内参为Ppia;Western blot使用β-actin作为loading control;各实验重复数和样本量。 阅读提示:Methods中Total RNA extraction and quantitative RT-PCR及Western blot analysis小节。 |