果蝇模型建立与遗传筛选
在模拟PDAC 4-hit基因型的果蝇模型中鉴定维生素代谢通路中的潜在治疗靶点。
利用Ser>4-hit果蝇模型,通过引入杂合突变或siRNA敲低37个维生素代谢相关基因,评估对果蝇致死率的挽救效果。
Inhibition of NAD-GPx4 axis and MEK triggers ferroptosis to suppress pancreatic ductal adenocarcinoma
包含果蝇体内遗传筛选与化学测试、人类PDAC细胞功能验证(软琼脂集落、3D球体)、scRNA-seq分析、原位异种移植小鼠模型等多层级证据,明确包含机制验证(ROS、铁、铁死亡抑制剂回救)及体内药效与安全性评估。
模拟PDAC 4-hit基因型的果蝇模型(Ser>4-hit, ptc>4-hit) 人类PDAC细胞系AsPC-1 AsPC-1原位异种移植小鼠模型
GPx4与MEK的敲低或抑制方式:siRNA、杂合突变、ML210与trametinib浓度 铁死亡抑制剂Fer-1与铁螯合剂DFO的使用剂量及处理时间 体内给药方案:ML210 40 mg/kg/天 腹腔注射,trametinib 0.5 mg/kg/天口服,共4周 细胞与体内模型中ROS、Fe2+、4-HNE等指标检测方法 AsPC-1球体形成与软琼脂集落实验的细胞接种数、培养与处理时间
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在模拟PDAC 4-hit基因型的果蝇模型中鉴定维生素代谢通路中的潜在治疗靶点。
利用Ser>4-hit果蝇模型,通过引入杂合突变或siRNA敲低37个维生素代谢相关基因,评估对果蝇致死率的挽救效果。
确定NAD合成通路下游影响ROS调控的效应分子,并测试相关抑制剂在果蝇模型中的治疗效果。
通过siRNA和杂合突变筛选ROS相关基因,检测对4-hit果蝇致死率的挽救。随后在果蝇中进行ML210与trametinib单药及联合应用的化学测试。
在人类PDAC细胞系AsPC-1中验证GPx4下调及MT联合处理对细胞增殖和铁死亡的影响。
采用RT-qPCR、Western blot确认敲低效率;通过3D球体形成实验、软琼脂集落形成实验检测细胞增殖;使用Fer-1和DFO评估铁死亡参与度;利用荧光探针检测ROS和Fe2+水平。
在哺乳动物体内评估联合抑制GPx4和MEK对PDAC肿瘤生长的治疗效果及安全性。
在BALB/c-nu/nu小鼠胰腺原位注射AsPC-1细胞建立移植瘤模型,按方案给予ML210、trametinib或联合治疗,观察肿瘤体积/重量、H&E染色、4-HNE免疫荧光、CC3免疫组化等指标。
评估人PDAC组织中GPx4表达及GSH代谢与铁死亡通路在细胞类型间的分布,以支持临床相关性。
重新分析公开的PDAC scRNA-seq数据(GSE205013),对94,929个细胞进行聚类和注释,分析GPx4表达差异以及GSH和铁死亡模块评分。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 化学筛选 | ML210 | -- | -- |
| 曲美替尼 | -- | -- | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | NICHIREI | -- | |
| RNA干扰 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Western blot | 蛋白酶抑制剂混合物 | -- | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 抗谷胱甘肽过氧化物酶4抗体 | Abcam | ab125066 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2125 | |
| 抗兔IgG HRP链接抗体 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| RT-qPCR | ISOGEN II 试剂 | Nippon Gene | -- |
| ReverTra Ace qPCR RT预混液 | Toyobo | -- | |
| Thunderbird SYBR qPCR预混液 | Toyobo | -- | |
| ROS检测 | DCFH-DA ROS探针 | Dojindo | -- |
| CellROX Deep Red 试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 铁离子检测 | FerroOrange 铁离子探针 | Dojindo | -- |
| 球体形成实验 | CellTiter-Glo 3D 试剂 | Promega | -- |
| 流式细胞术 | BD FACS Canto II 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 动物实验 | 阿替美唑 | Kyoritsu Seiyaku | -- |
| 汉克斯平衡盐溶液 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| IVIS Spectrum小动物活体成像系统 | Caliper Life Science | -- | |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 聚氧乙烯蓖麻油 | Nacalai Tesque | -- | |
| 组织学 | 迈耶苏木素溶液 | Fujifilm Wako | -- |
| 伊红Y乙醇溶液 | Fujifilm Wako | -- | |
| 免疫组织化学 | 抗裂解Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 |
| 抗F4/80抗体 | Abcam | -- | |
| 抗CD45R抗体 | Invitrogen | -- | |
| ImmPACT DAB过氧化物酶底物 | Vector Laboratories | -- | |
| 免疫荧光 | 抗4-羟基壬烯醛抗体 | Abcam | ab48506 |
| Alexa 488标记抗鼠IgG二抗 | Invitrogen | -- | |
| 果蝇实验 | Vectashield Vibrance防淬灭封片剂 | Vector Biolabs | -- |
| ImageJ软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 果蝇遗传筛选与化学测试 | 果蝇品系来源及平衡染色体、基因突变或siRNA信息,化学测试ML210与trametinib所用浓度、DMSO终浓度0.1%、培养温度等。 阅读提示:参照Materials and methods中“Drosophila genetic screening”、“Drosophila chemical testing”,以及Figure 1、2图注。 |
| 细胞培养与处理 | AsPC-1细胞培养条件(如培养基、NAM缺乏处理天数),GPx4 siRNA浓度(5 nM)及转染试剂,ML210工作浓度(如300 nM/1 μM),trametinib工作浓度(如1 nM/3 nM),Fer-1与DFO浓度(均为10 μM)和处理时间。 阅读提示:参照Materials and methods中“The development of NAM-deficient AsPC-1 cells”、“RNA interference”、“Spheroid formation assay”和Figure 4、5图注。 |
| 动物模型建立与给药 | 小鼠品系、周龄与性别,AsPC-1细胞接种数量与悬液体积,给药方案(ML210 40 mg/kg i.p.,trametinib 0.5 mg/kg p.o.)及持续时间,人道终点确认标准。 阅读提示:参照Materials and methods中“Mouse xenograft assay”及Figure 6图注。 |
| 表型与机制检测 | ROS检测使用的探针(DCFH-DA,CellROX)和Fe2+检测使用FerroOrange时的孵育条件;4-HNE免疫荧光染色中抗体稀释度和孵育条件;IHC中CC3、F4/80、CD45R抗体的稀释度。 阅读提示:参照Materials and methods中“Detection of intracellular ROS levels”、“Detection of intracellular Fe2+ levels”、“Immunofluorescence staining”、“IHC staining”及相关图注。 |
| 统计分析 | 具体统计学方法(如one-way ANOVA、post hoc Dunnett/Tukey检验)、样本量(如n=6 mice/group,biological triplicate)以及显著性定义。 阅读提示:参照Materials and methods中“Statistical analyses”及对应Figure legends。 |