建立SA-AKI小鼠模型及MaR1剂量筛选
确定MaR1对SA-AKI的保护作用及最佳剂量
对BALB/C小鼠行CLP手术建立SA-AKI模型,术后腹腔注射不同剂量MaR1(0.04、0.4、4 μg/kg),24小时后评估肾组织病理、肾功能及炎症指标。
Maresin-1 Attenuates Sepsis-Associated Acute Kidney Injury via Suppressing Inflammation, Endoplasmic Reticulum Stress and Pyroptosis by Activating the AMPK/SIRT3 Pathway.
包含CLP体内模型、剂量梯度实验、AMPK抑制剂回补实验、组织学染色、Western blot、qPCR、ELISA、TUNEL及分子对接等多层次验证。
CLP诱导的脓毒症相关急性肾损伤小鼠模型(BALB/C小鼠) 肾脏组织样本
MaR1剂量(0.04、0.4、4 μg/kg)及给药方式(腹腔注射) AMPK抑制剂Compound C剂量(20 mg/kg)及给药时间(术前2小时腹腔注射) 样本采集时间(术后24小时) 每组小鼠数量(n=4-6)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定MaR1对SA-AKI的保护作用及最佳剂量
对BALB/C小鼠行CLP手术建立SA-AKI模型,术后腹腔注射不同剂量MaR1(0.04、0.4、4 μg/kg),24小时后评估肾组织病理、肾功能及炎症指标。
探索MaR1是否激活AMPK/SIRT3通路
通过Western blot检测肾组织中p-AMPK、AMPK、Sirt3蛋白表达,qPCR检测Sirt3 mRNA水平,并用分子对接预测MaR1与AMPK结合。
确认AMPK激活是否介导MaR1的保护作用
在CLP模型中,术前2小时给予AMPK抑制剂Compound C(CC),观察CC能否逆转MaR1对肾功能、炎症、ER应激和焦亡的改善作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | Maresin-1 | Cayman Chemical | 10878 |
| 试剂 | 磷酸盐缓冲液 | Gibco | -- |
| 生化检测 | 肌酐检测试剂盒 | Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| 尿素检测试剂盒 | Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RT-PCR | HiScript® 逆转录预混液 | Vazyme | -- |
| AceQ qPCR SYBR® Green 预混液 | Vazyme | -- | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beijing ComWin Biotech Co., Ltd. | -- |
| Western blot | 增强化学发光底物 | Biosharp | BL520A |
| Anti-PERK抗体 | Cell Signaling Technology | #3192S | |
| Anti-p-EIF2α抗体 | Cell Signaling Technology | 3398S | |
| Anti-EIF2α抗体 | Cell Signaling Technology | 5324S | |
| Anti-ATF4抗体 | Cell Signaling Technology | 11815S | |
| Anti-CHOP抗体 | Cell Signaling Technology | 5554S | |
| Anti-NLRP3抗体 | Cell Signaling Technology | #15101S | |
| Anti-p-AMPK (Thr172)抗体 | Cell Signaling Technology | #2535T | |
| Anti-GRP78抗体 | Proteintech | 11587-1-AP | |
| Anti-Caspase-1抗体 | Proteintech | 22915-1-AP | |
| Anti-IL-1β抗体 | Proteintech | 26048-1-AP | |
| Anti-IL-18抗体 | Proteintech | 10663-1-AP | |
| Anti-AMPK抗体 | Proteintech | 10929-2-AP | |
| Anti-Sirt3抗体 | Proteintech | 10099-1-AP | |
| Anti-GSDMD抗体 | Abcam | ab209845 | |
| Anti-HMGB1抗体 | ABclonal | A2553 | |
| Anti-p-PERK抗体 | ImmunoWay Biotechnology | YP1055 | |
| Anti-α-Tubulin抗体 | Antgene Biotechnology | ANT329s | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG (H+L) | Antgene Biotechnology | ANT020 | |
| Anti-β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| HRP标记的亲和纯化山羊抗小鼠IgG (H+L) | Proteintech | SA00001-1 | |
| ELISA | ELISA试剂盒 | Neobioscience | -- |
| TUNEL | TUNEL试剂盒 | Roche | -- |
| 组织学 | 光学显微镜 | Olympus Optical | -- |
| TUNEL | 荧光显微镜 | Olympus Optical | -- |
| qRT-PCR | Bio-Rad CFX Connect实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- |
| 分子对接 | Chemdraw软件 | -- | -- |
| MOE 2019.0102软件 | -- | -- | |
| PyMOL2.3.0 | -- | -- | |
| Ligplot v2.2.5 | -- | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 7.0 | GraphPad Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、性别、年龄和体重;CLP手术具体操作(结扎位置、穿刺针型号);麻醉剂量;术后补液 阅读提示:Materials and Methods: Experimental Animals, Experimental Design |
| 药物处理 | MaR1剂量和溶剂;给药时间和途径;Compound C剂量和给药时间 阅读提示:Materials and Methods: Reagents and Drugs, Experimental Design |
| 样本采集 | 术后采集时间(24小时);血液离心条件;肾脏处理 阅读提示:Materials and Methods: Renal Function and Histologic Examination |
| 肾功能和组织学检测 | 试剂盒名称和品牌;染色方法(HE/PAS);肾小管损伤评分标准 阅读提示:Materials and Methods: Renal Function and Histologic Examination; Figure 1 legend |
| 炎症、ER应激和焦亡检测 | ELISA试剂盒品牌;Western blot抗体信息及稀释比;qPCR引物序列和内参基因 阅读提示:Materials and Methods: Enzyme-Linked Immunosorbent Assay, Western Blotting, Quantitative Real-Time Polymerase Chain Reaction; Table 1 |