单细胞转录组分析揭示了废用性骨质疏松小鼠中具有白血病前期特征的髓系偏倚HSPC的扩增亚群

Single-cell transcriptome analysis profiles the enlarged subsets of myeloid-biased HSPCs with preleukemic characters in disuse osteoporosis mice.

作者信息Chen Zhang, Yueru Ji, Xiaotong Gao, Zhuo Wan, Fangna Gu, Dian Lou, Han Liang, Li Liu, Weiwei Qin
PMID41225641
发布时间2025-11-12
DOI10.1186/s13578-025-01499-3

实验完整度

包含体外功能验证(CFU、凋亡分析)、动物模型(HU诱导OP)、体内干预(JQ-1抑制BRD4)、单细胞转录组和bulk RNA-seq等多个独立证据层级。

主要模型

后肢卸载(HU)诱导的废用性骨质疏松小鼠模型 骨髓Lin−c-kit+ HSPCs C57BL/6小鼠

重点核对

小鼠品系:C57BL/6,8周龄雄性 后肢卸载持续28天 JQ-1给药剂量10 mg/kg/天,腹腔注射,从卸载第22天起连续6天 HSPC亚群鉴定标记(如MPP3: Lin−c-kit+Sca-1+CD135−CD150−CD48+) 单细胞RNA-seq过滤标准:UMI和基因计数、线粒体含量>10%排除

摘要

背景:骨质疏松症(OP)可导致骨髓微环境的改变和造血稳态的失衡,这可能增加血液系统恶性肿瘤的发病率。然而,在OP条件下是否发生髓系偏倚的造血并促进白血病发生仍不清楚。结果:本研究通过后肢卸载成功诱导了小鼠OP模型,该模型显示外周血(PB)中髓系细胞增加和B细胞减少。此外,我们的研究表明,具有降低的分化和凋亡能力的髓系偏倚的HSPC(造血干祖细胞)亚群,包括多能祖细胞3(MPP3)和粒-单核祖细胞(GMPs),在OP小鼠中扩增。髓系偏倚HSPC的扩增导致OP小鼠骨髓中HSPC的积累和PB中髓系细胞的增加。在扩增的HSPC池中,通过单细胞RNA-seq鉴定并分析了OP小鼠特异性富集的亚群,包括来自原始HSC的subHSCs、来自MPP3的MPP3-1、来自GMP的GMP5、来自巨核细胞祖细胞的MkP2和来自红细胞祖细胞的EryP1。同时,这些OP-HU小鼠富集的亚群共享显著上调和下调的基因,这些基因富集于染色质修饰和细胞分化及凋亡,如Bromodomain-containing protein 4(Brd4),一种重要的染色质重塑蛋白,以及Proteinase 3(Prtn3)。此外,与OP-HU小鼠中subHSCs、MPP3-1、GMP5和EryP1扩增相对应的特异性转录因子被鉴定为Zfp951、Nfic、Maz和Ezh2。最后,在体内抑制BRD4可部分恢复OP-HU小鼠的表型以及调节HSPC扩增、分化和凋亡的基因表达。结论:首先,我们的研究表明OP可诱导不平衡的造血并增强髓系偏倚的造血。其次,鉴定并表征了OP小鼠富集的HSPC亚群,这些亚群具有增强的染色质重塑、降低的分化和抗凋亡特性。最后,本研究证明Brd4调控的基因程序赋予OP小鼠中髓系偏倚的HSPC亚群肿瘤细胞样特征,这可能增加白血病演进的发病率。这项研究揭示了预防人类OP患者髓系白血病发生的重要性。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
骨质疏松条件下是否发生髓系偏倚的造血并促进白血病发生,以及其分子机制是什么?
核心机制
骨质疏松诱导骨髓微环境改变,导致髓系偏倚HSPC扩增,伴随染色质重塑增强、分化降低和凋亡抵抗,其中BRD4上调调控相关基因程序赋予肿瘤细胞样特征。
主要证据
流式细胞术显示OP-HU小鼠中MPP3和GMP扩增、分化能力降低和凋亡减少;单细胞RNA-seq鉴定出OP特异性亚群(如MPP3-1、GMP5),并发现Brd4等基因表达改变;JQ-1抑制BRD4部分恢复HSPC表型和基因表达(如Hoxa9、Cebpa)。
研究意义
该研究首次描绘了骨质疏松条件下髓系偏倚HSPC的扩增及促进髓系恶性肿瘤发展的基因程序,表明BRD4是预防骨质疏松诱导的白血病发生的潜在靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立废用性骨质疏松小鼠模型

构建后肢卸载诱导的骨质疏松模型,模拟废用性骨质疏松条件。

对8周龄雄性C57BL/6小鼠进行后肢卸载28天,通过Micro-CT和组织学验证骨质疏松表型。

2

评估外周血和骨髓中造血细胞的变化

检测骨质疏松对髓系和淋巴系造血的影响。

通过血细胞计数和流式细胞术分析外周血和骨髓中的细胞组成,包括髓系细胞、B细胞、T细胞、HSPC亚群及凋亡。

3

验证HSPC分化和凋亡功能

检测OP-HU小鼠HSPC的克隆形成能力和凋亡水平。

进行甲基纤维素集落形成单位(CFU)实验和Annexin V凋亡分析。

4

分析骨髓微环境的转录改变

探究OP-HU小鼠骨髓微环境如何支持HSPC扩增和髓系偏倚造血。

对全骨髓细胞进行bulk RNA-seq分析,并检测骨髓液中TGF-β1水平。

5

单细胞RNA-seq解析HSPC异质性

在单细胞水平鉴定OP-HU小鼠中特异性扩增的HSPC亚群及其转录特征。

对Lin−c-kit+ HSPCs进行单细胞RNA-seq,进行聚类、细胞类型注释、亚群分析和转录因子调控网络分析。

6

体内抑制BRD4验证功能

验证BRD4在OP-HU小鼠HSPC异常中的作用。

对OP-HU和对照小鼠给予JQ-1(BRD4抑制剂)治疗,检测HSPC频率、凋亡、集落形成和基因表达。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
红细胞裂解液eBioscience00-4300-54
抗小鼠谱系抗体BioLegend--
B220抗体BioLegend103202
CD3抗体BioLegend100202
CD4抗体eBioscience16-0041-85
CD8抗体BioLegend100702
CD5抗体BioLegend100602
Gr-1抗体eBioscience14-5931-85
Mac-1抗体eBioscience16-0112-85
Ter-119抗体eBioscience16-5921-85
山羊抗大鼠FITCAbcamab6840
大鼠IgGAbcamab182931
c-Kit-APC-Cy7抗体BioLegend105826
Sca-1-PB抗体BioLegend108120
CD48-A647抗体BioLegend103416
CD150-PE抗体BioLegend115904
Flk2-Bio抗体eBioscience13-1351-85
链霉亲和素-PE-Cy7eBioscience25-4317-82
Annexin V-PE4A BiotechFXP027-50
CD34-PE抗体BioLegend152203
CD16/32-PE-Cy7抗体BioLegend101317
TruStain FcX受体阻断剂BioLegend101320
Gr-1-PE-Cy7抗体BioLegend108415
CD11b-APC抗体BioLegend101211
CD41-PE抗体BioLegend133905
CD45R/B220-FITC抗体BioLegend103205
CD3e-PE抗体eBioscience12-0031-81
7AAD----
BD FACS Aria III流式细胞分选仪BD--
Beckman Navious流式细胞仪Beckman--
全自动血液分析仪BC-5000MINDRAY--
Quantum GX2显微CTPerkinElmer--
MethoCult GF M3434甲基纤维素培养基Stem Cell Technologies--
倒置显微镜(IX73)Olympus--
TRNzol试剂TIANGENDP424
生物分析仪2100Agilent Technologies--
NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒(Illumina)NEB--
Illumina NovaSeq 6000测序仪Illumina--
OSTEOSOFT脱钙液Sigma1017281000
谱系微珠Miltenyi Biotech130-090-858
CD117微珠Miltenyi Biotech130-091-224
高密度微孔芯片Singleron Biotech--
M5 HiPer超微量RNA提取试剂盒Mei5 BiotechnologyMF789-plus-01
Hifair Advance Fast第一链cDNA合成试剂盒Yeasen11150ES60
2X M5 HiPer实时PCR混合液(含SYBR Green)Mei5 BiotechnologyMF015-01
QuantiCyto小鼠TGF-β1 ELISA试剂盒Neo-bioscienceEMC107b
JQ-1----
二甲基亚砜----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物模型
小鼠品系、性别、年龄、后肢卸载持续时间、悬挂角度
阅读提示:Materials and methods: Animal and Hindlimb unloading model
流式分析
抗体克隆号、荧光标记、染色条件、HSPC亚群圈门策略
阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry for BM cells and peripheral blood
集落形成实验
细胞种板数量、培养基类型、培养时间和集落计数标准
阅读提示:Materials and methods: Colony-forming unit assay
单细胞RNA-seq
样本制备、细胞数、过滤标准、聚类参数和细胞类型注释方法
阅读提示:Materials and methods: Single-cell RNA sequencing and analysis
BRD4抑制实验
JQ-1剂量、给药时间、给药途径、对照组设置
阅读提示:Materials and methods: Animal and Hindlimb unloading model; Results: Inhibition of BRD4 partially reverses the tumor cell-like characters of HSCs in OP-HU mice
定量PCR
引物序列、RNA量、逆转录和qPCR条件
阅读提示:Materials and methods: RNA isolation and quantitative PCR analysis