建立废用性骨质疏松小鼠模型
构建后肢卸载诱导的骨质疏松模型,模拟废用性骨质疏松条件。
对8周龄雄性C57BL/6小鼠进行后肢卸载28天,通过Micro-CT和组织学验证骨质疏松表型。
Single-cell transcriptome analysis profiles the enlarged subsets of myeloid-biased HSPCs with preleukemic characters in disuse osteoporosis mice.
包含体外功能验证(CFU、凋亡分析)、动物模型(HU诱导OP)、体内干预(JQ-1抑制BRD4)、单细胞转录组和bulk RNA-seq等多个独立证据层级。
后肢卸载(HU)诱导的废用性骨质疏松小鼠模型 骨髓Lin−c-kit+ HSPCs C57BL/6小鼠
小鼠品系:C57BL/6,8周龄雄性 后肢卸载持续28天 JQ-1给药剂量10 mg/kg/天,腹腔注射,从卸载第22天起连续6天 HSPC亚群鉴定标记(如MPP3: Lin−c-kit+Sca-1+CD135−CD150−CD48+) 单细胞RNA-seq过滤标准:UMI和基因计数、线粒体含量>10%排除
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建后肢卸载诱导的骨质疏松模型,模拟废用性骨质疏松条件。
对8周龄雄性C57BL/6小鼠进行后肢卸载28天,通过Micro-CT和组织学验证骨质疏松表型。
检测骨质疏松对髓系和淋巴系造血的影响。
通过血细胞计数和流式细胞术分析外周血和骨髓中的细胞组成,包括髓系细胞、B细胞、T细胞、HSPC亚群及凋亡。
检测OP-HU小鼠HSPC的克隆形成能力和凋亡水平。
进行甲基纤维素集落形成单位(CFU)实验和Annexin V凋亡分析。
探究OP-HU小鼠骨髓微环境如何支持HSPC扩增和髓系偏倚造血。
对全骨髓细胞进行bulk RNA-seq分析,并检测骨髓液中TGF-β1水平。
在单细胞水平鉴定OP-HU小鼠中特异性扩增的HSPC亚群及其转录特征。
对Lin−c-kit+ HSPCs进行单细胞RNA-seq,进行聚类、细胞类型注释、亚群分析和转录因子调控网络分析。
验证BRD4在OP-HU小鼠HSPC异常中的作用。
对OP-HU和对照小鼠给予JQ-1(BRD4抑制剂)治疗,检测HSPC频率、凋亡、集落形成和基因表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞染色 | 红细胞裂解液 | eBioscience | 00-4300-54 |
| 流式细胞术 | 抗小鼠谱系抗体 | BioLegend | -- |
| B220抗体 | BioLegend | 103202 | |
| CD3抗体 | BioLegend | 100202 | |
| CD4抗体 | eBioscience | 16-0041-85 | |
| CD8抗体 | BioLegend | 100702 | |
| CD5抗体 | BioLegend | 100602 | |
| Gr-1抗体 | eBioscience | 14-5931-85 | |
| Mac-1抗体 | eBioscience | 16-0112-85 | |
| Ter-119抗体 | eBioscience | 16-5921-85 | |
| 山羊抗大鼠FITC | Abcam | ab6840 | |
| 大鼠IgG | Abcam | ab182931 | |
| c-Kit-APC-Cy7抗体 | BioLegend | 105826 | |
| Sca-1-PB抗体 | BioLegend | 108120 | |
| CD48-A647抗体 | BioLegend | 103416 | |
| CD150-PE抗体 | BioLegend | 115904 | |
| Flk2-Bio抗体 | eBioscience | 13-1351-85 | |
| 链霉亲和素-PE-Cy7 | eBioscience | 25-4317-82 | |
| 凋亡分析 | Annexin V-PE | 4A Biotech | FXP027-50 |
| 流式细胞术 | CD34-PE抗体 | BioLegend | 152203 |
| CD16/32-PE-Cy7抗体 | BioLegend | 101317 | |
| TruStain FcX受体阻断剂 | BioLegend | 101320 | |
| Gr-1-PE-Cy7抗体 | BioLegend | 108415 | |
| CD11b-APC抗体 | BioLegend | 101211 | |
| CD41-PE抗体 | BioLegend | 133905 | |
| CD45R/B220-FITC抗体 | BioLegend | 103205 | |
| CD3e-PE抗体 | eBioscience | 12-0031-81 | |
| 7AAD | -- | -- | |
| 细胞分选 | BD FACS Aria III流式细胞分选仪 | BD | -- |
| 流式细胞分析 | Beckman Navious流式细胞仪 | Beckman | -- |
| 血细胞计数 | 全自动血液分析仪BC-5000 | MINDRAY | -- |
| Micro-CT | Quantum GX2显微CT | PerkinElmer | -- |
| 集落形成实验 | MethoCult GF M3434甲基纤维素培养基 | Stem Cell Technologies | -- |
| 集落计数 | 倒置显微镜(IX73) | Olympus | -- |
| RNA提取 | TRNzol试剂 | TIANGEN | DP424 |
| RNA质量检测 | 生物分析仪2100 | Agilent Technologies | -- |
| RNA文库构建 | NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒(Illumina) | NEB | -- |
| RNA测序 | Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- |
| 组织学 | OSTEOSOFT脱钙液 | Sigma | 1017281000 |
| 单细胞RNA-seq | 谱系微珠 | Miltenyi Biotech | 130-090-858 |
| CD117微珠 | Miltenyi Biotech | 130-091-224 | |
| 高密度微孔芯片 | Singleron Biotech | -- | |
| RNA提取 | M5 HiPer超微量RNA提取试剂盒 | Mei5 Biotechnology | MF789-plus-01 |
| 逆转录 | Hifair Advance Fast第一链cDNA合成试剂盒 | Yeasen | 11150ES60 |
| qPCR | 2X M5 HiPer实时PCR混合液(含SYBR Green) | Mei5 Biotechnology | MF015-01 |
| ELISA | QuantiCyto小鼠TGF-β1 ELISA试剂盒 | Neo-bioscience | EMC107b |
| 体内给药 | JQ-1 | -- | -- |
| 二甲基亚砜 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、年龄、后肢卸载持续时间、悬挂角度 阅读提示:Materials and methods: Animal and Hindlimb unloading model |
| 流式分析 | 抗体克隆号、荧光标记、染色条件、HSPC亚群圈门策略 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry for BM cells and peripheral blood |
| 集落形成实验 | 细胞种板数量、培养基类型、培养时间和集落计数标准 阅读提示:Materials and methods: Colony-forming unit assay |
| 单细胞RNA-seq | 样本制备、细胞数、过滤标准、聚类参数和细胞类型注释方法 阅读提示:Materials and methods: Single-cell RNA sequencing and analysis |
| BRD4抑制实验 | JQ-1剂量、给药时间、给药途径、对照组设置 阅读提示:Materials and methods: Animal and Hindlimb unloading model; Results: Inhibition of BRD4 partially reverses the tumor cell-like characters of HSCs in OP-HU mice |
| 定量PCR | 引物序列、RNA量、逆转录和qPCR条件 阅读提示:Materials and methods: RNA isolation and quantitative PCR analysis |