建立Mettl3-cKO小鼠和ID8同基因模型
验证METTL3在免疫应答中的作用及ID8细胞致瘤性。
通过Cre-LoxP系统生成Mettl3fl/fl Lyz2-Cre+小鼠,并腹腔注射ID8细胞建立OC模型,观察肿瘤生长、腹水和球体形成。
METTL3-mediated m6A methylation regulates ovarian cancer progression by recruiting myeloid-derived suppressor cells.
包含体外BMDM共培养实验、体内同基因小鼠模型、流式细胞术、单细胞测序等多层级验证,并明确功能与机制验证。
ID8同基因小鼠卵巢癌模型 骨髓源性巨噬细胞(BMDMs) Mettl3-cKO小鼠(髓系特异性敲除)
5×10^5 ID8细胞腹腔注射 Mettl3-cKO小鼠(Lyz2-Cre+) LPS预处理(10 ng/ml) 活ID8细胞与BMDM共培养 ELISA检测IL-1β、CCL2、CXCL2
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证METTL3在免疫应答中的作用及ID8细胞致瘤性。
通过Cre-LoxP系统生成Mettl3fl/fl Lyz2-Cre+小鼠,并腹腔注射ID8细胞建立OC模型,观察肿瘤生长、腹水和球体形成。
确定髓系METTL3缺失对体内OC生长的影响。
腹腔注射5×10^5 ID8细胞,在不同时间点测量肿瘤细胞数量、腹水量、球体数量和增殖。
评估METTL3缺失对腹膜巨噬细胞组成和极化的影响。
通过流式细胞术分析SPM和LPM的比例及M1/M2标志物。
检测METTL3缺失是否增加MDSCs募集和相关趋化因子。
通过流式细胞术分析Gr-1+ MDSCs及其亚群,并用ELISA测定腹腔灌洗液和血清中的细胞因子/趋化因子。
确定METTL3缺乏如何增强IL-1β分泌及其是否依赖炎症小体。
将LPS预处理或未处理的BMDMs与活ID8细胞或裂解物共培养,检测IL-1β转录和分泌,并通过Western blot和LDH法分析炎症小体和细胞死亡。
从转录组水平确认MDSCs募集和细胞因子表达变化。
对WT和Mettl3-cKO荷瘤小鼠的腹膜细胞进行scRNA-seq,分析细胞亚群和差异表达基因。
探讨MDSCs功能变化(NOX2)是否与免疫抑制相关。
从肿瘤腹腔分离粒细胞,通过qRT-PCR验证Cybb表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco Inc. | -- |
| 胎牛血清 | Gibco Inc. | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco Inc. | -- | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | Novoprotein | CB34 | |
| 红细胞裂解液 | Sigma-Aldrich | R7757 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Vazyme Biotech Co.,Ltd | R411-01 |
| RNA定量 | NanoDrop 2000 | Thermo Scientific | -- |
| dot blot | Hybond-N+膜 | GE Healthcare | RPN3003B |
| 抗m6A抗体 | Ablconal Technology | A19841 | |
| Western blot | 抗NLRP3抗体 | CST | 15101S |
| 抗β-actin抗体 | CST | 4970S | |
| 抗GSDMD抗体 | CST | 39754S | |
| 抗caspase-1抗体 | AdipoGen | AG-20B-0042-C100 | |
| HRP标记的抗兔IgG抗体 | Sigma | A0545 | |
| HRP标记的抗小鼠IgG抗体 | Invitrogen | 31,430 | |
| ECL检测系统 | Millipore | WBKLS500 | |
| 细胞毒性检测 | Roche细胞毒性检测试剂盒 | Roche Applied Science | 11,644,793,001 |
| 流式细胞术 | Zombie Aqua固定活力试剂盒 | BioLegend | 423,102 |
| Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | Invitrogen | 00-5523-00 | |
| 免疫荧光 | 抗CD68抗体 (AF594) | BioLegend | 137,020 |
| 抗Ki-67抗体 (FITC) | eBioscience | 11-5698-82 | |
| DAPI | Sigma-Aldrich | D9542 | |
| ELISA | 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Invitrogen | 88-7013-88 |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | R&D Systems | M6000B | |
| 小鼠IL-10 ELISA试剂盒 | R&D Systems | M1000B | |
| 小鼠IL-12 ELISA试剂盒 | R&D Systems | M1270 | |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | R&D Systems | MTA00B | |
| 小鼠CCL2 ELISA试剂盒 | Absin | abs520016-96T | |
| 小鼠CXCL2 ELISA试剂盒 | Neobioscience | EMC122.96 | |
| qRT-PCR | UNlQ-10柱式Trizol总RNA提取试剂盒 | Sangon | B511321-0100 |
| ReverTra Ace™ qRT-PCR试剂盒 | TOYOBO | FSQ-101 | |
| 单细胞测序 | Chromium控制器 | 10x Genomics | -- |
| Chromium单细胞3'试剂盒v3 | 10x Genomics | -- | |
| NovaSeq 6000 | Illumina | -- | |
| CellRanger v5.0.1 | -- | -- | |
| Seurat v3.2.0 | -- | -- | |
| clusterProfiler | -- | -- | |
| 数据分析 | FlowJo | FlowJo LLC | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 建立Mettl3-cKO小鼠模型 | Mettl3fl/fl Lyz2-Cre+ 基因型;6-8周龄雌性小鼠 阅读提示:Materials and methods - Mice |
| ID8肿瘤模型 | ID8细胞系来源(iCell Bioscience),腹腔注射剂量(5×10^5),监测时间点(1、4、8周) 阅读提示:Materials and methods - Mouse tumor experiments; Figure 1 legend |
| BMDM培养和共培养 | 骨髓来源,M-CSF(10 ng/ml)诱导7天;LPS预处理(10 ng/ml)过夜;与活ID8细胞或裂解物共培养 阅读提示:Materials and methods - Cell cultures; Cytotoxicity assay |
| IL-1β分泌检测 | ELISA试剂盒(Invitrogen, 88-7013-88);LPS预处理必要性;活ID8细胞而非裂解物诱导分泌 阅读提示:Results - 'Viable ID8 cells...'; Figure 4 legend |
| MDSCs分析 | 流式细胞术门控Gr-1+ MDSCs;PMN-MDSCs (Ly6G+) 和M-MDSCs (Ly6C+) 亚群 阅读提示:Results - 'Mettl3 depletion...'; Figure 3 legend |