5-ALA代谢与HIR相关性分析
检测人供肝和小鼠HIR后5-ALA代谢酶表达及PBG水平的变化。
分析配对的人供肝移植前后5-ALA代谢酶表达;在小鼠HIR模型术后检测Alas1、Alad等表达及PBG含量。
5-aminolevulinate and CHIL3/CHI3L1 treatment amid ischemia aids liver metabolism and reduces ischemia-reperfusion injury.
实验包含小鼠HIR模型、原代肝细胞和巨噬细胞、OGD/R模型、转录组分析、代谢检测及功能验证等多层级证据支持。
小鼠70%肝脏缺血再灌注(HIR)模型 小鼠原代肝细胞和巨噬细胞 小鼠腹膜巨噬细胞(PMs) 人肝细胞系L-02
5-ALA给药剂量为30 mg/kg,缺血期腹腔注射 OGD/R模型:4小时氧糖剥夺后复氧6小时 Cx3cr1基因敲除小鼠 CHIL3/CHI3L1蛋白补充浓度 M1/M2极化检测标志物(CD86, CD206)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测人供肝和小鼠HIR后5-ALA代谢酶表达及PBG水平的变化。
分析配对的人供肝移植前后5-ALA代谢酶表达;在小鼠HIR模型术后检测Alas1、Alad等表达及PBG含量。
确定5-ALA治疗能否减轻HIR诱导的肝损伤和线粒体ROS。
对小鼠HIR模型缺血期腹腔注射5-ALA,检测肝损伤指标、细胞凋亡和线粒体ROS;在细胞OGD/R模型验证。
探索5-ALA是否调节肝脏脂质代谢和巨噬细胞M1/M2极化。
通过对小鼠肝脏转录组分析,代谢笼监测,BODIPY染色,以及巨噬细胞ATP产生和极化标志物检测。
确定CX3CR1是否介导5-ALA的有益效果。
检测5-ALA对巨噬细胞趋化因子受体表达的影响,使用NF-κB激活剂探索机制,并在Cx3cr1 KO小鼠中验证表型。
研究CX3CR1缺陷如何影响肝脏代谢和巨噬细胞极化。
分析Cx3cr1 KO小鼠HIR后的肝损伤、免疫细胞浸润、转录组变化和巨噬细胞极化。
确定CHIL3/CHI3L1是否作为CX3CR1下游效应分子保护肝细胞。
检测血清CHIL3水平,在培养的肝细胞中补充CHIL3/CHI3L1,评估细胞存活和代谢变化。
测试5-ALA和CHIL3联合治疗是否能进一步减轻HIR损伤。
小鼠HIR模型中联合给药5-ALA和CHIL3,检测肝损伤、脂质代谢和能量代谢指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Thermo Fisher Scientific | C11995500BT |
| 胎牛血清 | PAN | P30-3302 | |
| 汉克斯平衡盐溶液 | GE | -- | |
| 细胞分离 | IV型胶原酶 | Sigma-Aldrich | -- |
| Percoll | -- | -- | |
| 细胞处理 | 脂多糖 | -- | -- |
| 白细胞介素-4 | -- | -- | |
| 桦木酸 | -- | -- | |
| 蛋白检测 | 蛋白酶抑制剂 | -- | -- |
| 细胞凋亡检测 | TUNEL检测试剂盒 | Roche Diagnostics | 11684795910 |
| 细胞染色 | DAPI | Invitrogen | D1306 |
| MitoNeoD | MedKoo Biosciences | 563761 | |
| 免疫荧光 | 鬼笔环肽 | -- | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 细胞成像 | 共聚焦显微镜LSM880 | Zeiss | -- |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| ELISA | 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Neobioscience | EMC001b |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Neobioscience | EMC004 | |
| 小鼠IL-10 ELISA试剂盒 | Neobioscience | EMC005 | |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Neobioscience | EMC102a | |
| 小鼠CHIL3 ELISA试剂盒 | RayBio | ELM-YM1 | |
| 代谢检测 | XF96海马 | Seahorse Bioscience | -- |
| 寡霉素 | -- | -- | |
| 鱼藤酮 | Sigma | R8875 | |
| TMRE | MCE | HY-D0985A | |
| NAD+/NADH检测试剂盒 | BioVision | K347-100 | |
| NADP+/NADPH检测试剂盒 | BioVision | K347-100 | |
| ATP比色检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| L-乳酸检测试剂盒 | Solarbio | BC2230 | |
| 线粒体复合物活性检测 | 细胞色素c | Sigma | C2867 |
| 癸基泛醌 | Sigma | D7911 | |
| 线粒体复合物IV活性检测试剂盒 | Acmec | BC0940 | |
| 线粒体复合物V活性检测试剂盒 | Solarbio | BC1445 | |
| RNA提取 | TRIzol | Invitrogen | 15596026 |
| RNA建库 | NEBNext® Ultra™ RNA文库制备试剂盒 | NEB | E7775 |
| 测序 | Illumina NovaSeq平台 | Illumina | -- |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Vazyme | A311 |
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
| EDTA | -- | -- | |
| 代谢监测 | CLAMS HC综合实验动物监测系统 | Columbus Instruments | -- |
| 生化分析 | 7180生化分析仪 | Hitachi | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、周龄、缺血时间、再灌注时间、麻醉方法 阅读提示:Materials and Methods: Mouse HIR injury model |
| 5-ALA给药 | 剂量、给药途径、给药时机 阅读提示:Materials and Methods: Mouse HIR injury model; Figure 2 legend |
| 细胞模型 | 细胞类型、OGD时长、复氧时长、培养基、低氧条件 阅读提示:Materials and Methods: Oxygen-glucose deprivation and reoxygenation (OGD/R) model |
| 巨噬细胞极化分析 | 标记物、流式抗体、门控策略、样本处理 阅读提示:Materials and Methods: Flow cytometry; Figure 5 legend |
| CHIL3/CHI3L1处理 | 蛋白来源、浓度、处理时间 阅读提示:Materials and Methods: 细胞处理(未明确详述,参见图5、6 legends) |