病毒株表征与体外复制动力学比较
比较JEV-S1和JEV-S3在神经和非神经细胞中的复制效率、病毒进入和内化差异
感染Huh7、Neuro2a和EA.hy926细胞,在MOI=1下,于感染后6、12、24、36小时收获细胞,通过qRT-PCR检测病毒RNA,Western blot检测NS3蛋白,蚀斑实验检测病毒滴度,并评估病毒进入和细胞内化。
Neutrophil depletion at the early stage of Japanese encephalitis virus infection affects CD8+ T cell infiltration into the mouse brain and causes severe encephalitis.
包含体外细胞感染实验、小鼠模型(JEV-S1和JEV-S3)、抗体介导的细胞耗竭实验(抗Ly6G、抗CD8)和药物抑制实验(AMD3100),并进行流式细胞术、ELISA、qRT-PCR、Western blot等验证,实验设计完整且多层次。
C57BL/6小鼠(3-4周龄),JEV-S1和JEV-S3感染小鼠模型 Huh7人肝癌细胞系 Neuro2a小鼠神经母细胞瘤细胞系 EA.hy926人内皮细胞系
C57BL/6小鼠周龄为3-4周,JEV感染剂量为107 pfu/ml,通过腹腔注射 中性粒细胞耗竭使用抗Ly6G抗体(mAb1A8,300μg/鼠),感染前48小时开始注射,每两天一次 AMD3100处理剂量为4 mg/kg,感染前12小时开始,每12小时一次,持续至第5天 CD8耗竭使用抗CD8α抗体(150μg/鼠),感染前48小时注射,每两天一次 脑内CD8+ T细胞浸润减少与CXCR4表达降低相关,通过流式细胞术检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较JEV-S1和JEV-S3在神经和非神经细胞中的复制效率、病毒进入和内化差异
感染Huh7、Neuro2a和EA.hy926细胞,在MOI=1下,于感染后6、12、24、36小时收获细胞,通过qRT-PCR检测病毒RNA,Western blot检测NS3蛋白,蚀斑实验检测病毒滴度,并评估病毒进入和细胞内化。
评估JEV-S1和JEV-S3在C57BL/6小鼠中的复制动力学、疾病表型和血脑屏障完整性
小鼠腹腔注射107 pfu/ml病毒,监测生存率、体重变化和临床评分;使用Evans Blue染料检测BBB渗透性;在感染后24、96、144小时收获肝、脾和脑,通过qRT-PCR和Western blot评估病毒载量和NS3蛋白表达;同时检测脑内炎症小体相关基因和蛋白表达。
比较JEV-S1和JEV-S3感染后脾脏和脑中中性粒细胞、单核细胞等免疫细胞的浸润情况
在感染后96和144小时,以及JEV-S1感染后第12天,收集脾脏和脑,通过流式细胞术检测CD11b、Ly6G、Ly6C等标志物,分析中性粒细胞(CD11b+Ly6G+Ly6C+)和单核细胞(CD11b+Ly6C+Ly6G-)的比例和数量。
研究中性粒细胞耗竭对JEV感染小鼠病毒复制、疾病严重程度和存活的影响
使用抗Ly6G抗体(mAb1A8)在感染前48小时通过腹腔注射耗竭中性粒细胞,每两天一次,对照组注射同型对照抗体。感染后监测体重、临床评分和生存率,并检测脑内病毒滴度和NS3蛋白表达。
研究中性粒细胞耗竭对JEV感染小鼠脑内CD8+ T细胞浸润和分布的影响
在症状出现时,通过流式细胞术检测脑、血和脾中CD3、CD4和CD8 T细胞的比例和数量,比较中性粒细胞耗竭组和对照组。
研究CXCR4拮抗剂AMD3100对JEV感染小鼠病毒复制、免疫细胞浸润和存活的影响
小鼠在感染前12小时腹腔注射AMD3100(4mg/kg),每12小时一次直至第5天,对照组注射PBS。监测体重、临床评分和生存率;在特定时间点收获脾脏和脑,通过qRT-PCR和Western blot检测病毒RNA和NS3蛋白;通过流式细胞术检测免疫细胞浸润。
评估中性粒细胞耗竭或AMD3100处理对JEV感染小鼠脑内炎症和趋化因子水平的影响
在症状出现时,通过qRT-PCR检测脑内NLRP3、ASC、Caspase-1、IL-18、IL-1β等基因表达,Western blot检测ASC蛋白;通过ELISA检测血清和脑裂解液中CXCL12、MIF-1、CXCL10、CCL2水平。
研究中性粒细胞耗竭后CD8+ T细胞CXCR4表达变化及颗粒酶B产生情况
在感染后第9天,通过流式细胞术检测血、脾、脑中CD8+和CD4+ T细胞上CXCR4表达;对血和脾细胞进行细胞内染色检测颗粒酶B(GrB)水平。
研究CD8+ T细胞在JEV-S1感染后期对病毒清除和疾病结局的影响
使用抗CD8α抗体(150μg/鼠)在感染前48小时通过腹腔注射耗竭CD8+ T细胞,每两天一次,对照组注射同型对照。监测体重、临床评分和生存率,并通过Western blot检测脑内NS3蛋白。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 (11960) | Invitrogen | 11960 |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 病毒滴度测定 | MEM培养基 (11095080) | Invitrogen | 11095080 |
| 细胞培养 | 青霉素-链霉素 | -- | -- |
| 病毒滴度测定 | VII型琼脂糖 (A0701) | Sigma-Aldrich | A0701 |
| 甲醛 (252549) | Sigma-Aldrich | 252549 | |
| 结晶紫 (C6158) | Sigma-Aldrich | C6158 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 (15596018) | Invitrogen | 15596018 |
| cDNA合成 | GoScript逆转录系统 (A5003) | Promega | A5003 |
| qRT-PCR | SYBR Premix Ex Taq (RR420) | Takara | RR420 |
| Quanta Studio 6 Flex实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 (A55860) | Pierce | A55860 |
| GAPDH抗体 (GTX100118) | GeneTex | GTX100118 | |
| JEV NS3抗体 (GTX125868) | GeneTex | GTX125868 | |
| ASC抗体 (D2W8U) | Cell Signaling Technology | D2W8U | |
| 剪切的Caspase-1抗体 (Asp297) | Cell Signaling Technology | Asp297 | |
| Caspase-1抗体 (#2225) | Cell Signaling Technology | 2225 | |
| Claudin-5抗体 (sc-374221) | Santa Cruz Biotechnology | sc-374221 | |
| 鲁米诺试剂 (sc-2048) | Santa Cruz Biotechnology | sc-2048 | |
| ChemiDoc XRS系统 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫荧光 | 牛血清白蛋白 (A9418) | Sigma-Aldrich | A9418 |
| Alexa Fluor 488山羊抗小鼠 (A11029) | Invitrogen | A11029 | |
| DAPI (D1306) | Invitrogen | D1306 | |
| Leica SP5激光共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| 中性粒细胞耗竭 | 抗Ly6G抗体(克隆1A8, #BP0075-1) | Bio X Cell | BP0075-1 |
| 对照抗体 | 抗大鼠Kappa免疫球蛋白(克隆MAR18.5, #BE0122) | Bio X Cell | BE0122 |
| CD8耗竭 | 抗小鼠CD8a(克隆53.6-7, #BP0004-1) | Bio X Cell | BP0004-1 |
| BBB渗透性检测 | 伊文思蓝染料 (E2129) | Sigma-Aldrich | E2129 |
| 免疫细胞分离 | 红细胞裂解液 (00-4300-54) | Invitrogen | 00-4300-54 |
| Dounce匀浆器 (D8938) | Sigma-Aldrich | D8938 | |
| HBSS缓冲液 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Percoll (17089102) | Cytiva | 17089102 | |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD16/32抗体 (101302) | BioLegend | 101302 |
| CD11b抗体 (101211) | BioLegend | 101211 | |
| Ly6G抗体 (127606) | BioLegend | 127606 | |
| Ly6C抗体 (128018) | BioLegend | 128018 | |
| CD3抗体 (100204) | BioLegend | 100204 | |
| CD4抗体 (10043) | BioLegend | 10043 | |
| CD8抗体 (100737) | BioLegend | 100737 | |
| 抗Gr1抗体 (553123) | BD Pharmingen | 553123 | |
| BD FACS Verse流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| CD8a抗体(APC; #200081-U; 克隆S18018E) | -- | 200081-U | |
| 颗粒酶B抗体(FITC; #396404; 克隆QA18A28) | -- | 396404 | |
| GolgiStop (554724) | BD Biosciences | 554724 | |
| 固定/破膜试剂盒 (554714) | BD Biosciences | 554714 | |
| BD FACS Symphony流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 药物处理 | AMD3100八盐酸盐水合物 (A5602) | Sigma-Aldrich | A5602 |
| ELISA | CXCL12 ELISA试剂盒 (E-EL-M3046) | Elabscience | E-EL-M3046 |
| MIF-1 ELISA试剂盒 (EM0440) | Fine Test | EM0440 | |
| CXCL10 ELISA试剂盒 (EM0004) | Fine Test | EM0004 | |
| CCL2 ELISA试剂盒 (EM0135) | Fine Test | EM0135 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 病毒株和感染剂量 | JEV-S1和JEV-S3的病毒滴度、感染剂量(107 pfu/ml)和注射途径(腹腔注射) 阅读提示:材料与方法中的“Virus isolates”和“Results”中的图2图注 |
| 宿主小鼠 | 小鼠品系为C57BL/6,周龄为3-4周,性别未明确说明 阅读提示:材料与方法中的“Ethics”和“Results”中的图2图注 |
| 中性粒细胞耗竭方案 | 抗Ly6G抗体(mAb1A8)剂量为300μg/鼠,腹腔注射,感染前48小时开始,每两天一次;对照组使用同型抗体 阅读提示:材料与方法中的“In Vivo neutrophil depletion”和图4图注 |
| CD8耗竭方案 | 抗CD8α抗体剂量为150μg/鼠,腹腔注射,感染前48小时开始,每两天一次;对照组使用同型抗体 阅读提示:材料与方法中的“In vivo depletion of CD8+ T-cells”和图12图注 |
| AMD3100处理方案 | AMD3100剂量为4mg/kg,腹腔注射,感染前12小时开始,每12小时一次,持续至第5天;对照组注射PBS 阅读提示:材料与方法中的“Administration of AMD3100”和图6图注 |
| 组织采集时间点 | 对于JEV-S1感染,脑和脾采集时间点为96、144小时及第9天和第12天;对于JEV-S3感染,时间点为96和144小时及第3天和第5天 阅读提示:材料与方法中的“Immune cell isolation”和相关图注 |
| 流式细胞术分析 | 用于检测免疫细胞浸润的抗体组合(CD11b, Ly6G, Ly6C, CD3, CD4, CD8等)和门控策略 阅读提示:材料与方法中的“Immune cell isolation from mouse blood and brain for flow cytometry” |
| 脑内病毒载量和NS3蛋白检测 | 通过qRT-PCR检测JEV mRNA,Western blot检测NS3蛋白,具体引物序列和抗体信息在表和材料中提供 阅读提示:材料与方法中的“RNA extraction and qRT-PCR”和“Immunoblotting” |
| 炎症小体激活检测 | qRT-PCR检测NLRP3、ASC、Caspase-1、IL-18、IL-1β基因表达,Western blot检测ASC、Caspase-1、Cleaved Caspase-1蛋白水平 阅读提示:材料与方法中的“RNA extraction and qRT-PCR”和“Immunoblotting” |