AS模型建立与表型分析
建立ApoE-/-小鼠AS模型,并验证METTL3/ LGMN在AS动脉中的表达和修饰水平。
采用HFD喂养ApoE-/-小鼠16周,通过MeRIP-seq、qPCR、WB、IF等检测m6A水平和METTL3表达;通过H&E、Oil Red O、TEM评估斑块和线粒体形态。
METTL3-dependent N6-methyladenosine modification on LGMN mRNA promotes macrophage ferroptosis and atherosclerosis
包含体内动物模型(ApoE−/−小鼠)、体外细胞实验(BMDM)、临床样本(人动脉斑块)、单细胞测序数据分析,并通过功能获得/缺失、救援实验及机制验证(RIP、多聚糖体分析)确证METTL3-LGMN-YTHDF1通路。
ApoE-/-小鼠AS模型 骨髓源性巨噬细胞(BMDM) 人冠状动脉/颈动脉斑块标本 Ldlr-/-小鼠斑块单细胞数据(GSE155513)
ApoE-/-小鼠HFD喂养16周建立AS模型 METTL3抑制剂STM2457(50 mg/kg,腹腔注射,每日一次) Fer-1(1 mg/kg,腹腔注射,每日一次) AAV-shMETTL3或AAV-shLGMN尾静脉注射(5×10^11病毒基因组) BMDM中ox-LDL(100 μg/mL)处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立ApoE-/-小鼠AS模型,并验证METTL3/ LGMN在AS动脉中的表达和修饰水平。
采用HFD喂养ApoE-/-小鼠16周,通过MeRIP-seq、qPCR、WB、IF等检测m6A水平和METTL3表达;通过H&E、Oil Red O、TEM评估斑块和线粒体形态。
验证METTL3在AS中的作用及其对巨噬细胞铁死亡的影响。
使用STM2457抑制METTL3,或用AAV-shMETTL3进行巨噬细胞特异性敲低;检测斑块面积、脂质沉积、铁死亡标志物。在BMDM中敲低METTL3,检测ox-LDL和Erastin诱导的铁死亡相关指标。
验证LGMN在AS和巨噬细胞铁死亡中的作用。
通过AAV-shLGMN在体内敲低LGMN,评估斑块和铁死亡;在BMDM中敲低或过表达LGMN,检测脂质沉积、铁死亡、炎症反应。
证实METTL3通过m6A修饰调控LGMN表达,并揭示其机制。
通过MeRIP-seq分析LGMN mRNA的m6A修饰;双荧光素酶报告基因、RIP-qPCR和polysome profiling验证METTL3和YTHDF1对LGMN的调控。
验证YTHDF1作为m6A阅读蛋白结合LGMN mRNA并促进其翻译。
在BMDM中敲低YTHDF1,检测LGMN表达和炎症因子;通过RIP-qPCR验证YTHDF1与LGMN mRNA结合。
确保实验数据的统计学差异。
使用GraphPad Prism进行t检验或ANOVA,数据以mean±SD表示。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | STM2457 | GLPBIO | GC19771 |
| Ferrostatin-1 | MCE | HY-100579 | |
| 细胞培养 | 巨噬细胞集落刺激因子 | NovoProtein | CB34 |
| 氧化低密度脂蛋白 | Yiyuan Biotechnology | YB-002 | |
| 铁死亡诱导 | Erastin | MCE | HY-15763 |
| 转染 | Lipofectamine RNAiMAX | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 实时荧光定量PCR | 彩色SYBR Green qPCR预混液 | EZBioscience | A0012-R2 |
| 蛋白质印迹 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 抗METTL3抗体 | Proteintech | 15073-1-AP | |
| 抗LGMN抗体 | SANTACRUZ | sc-133234 | |
| 免疫荧光 | 抗CD68抗体 | Abcam | ab283654 |
| 抗LGMN抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-133234 | |
| 抗METTL3抗体 | Proteintech | 67733-1-Ig | |
| 流式细胞术 | JC-1染料 | Beyotime | C2006 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | ApoE-/-小鼠品系、性别、年龄、体重;HFD脂肪和胆固醇含量及喂养时长;对照组设置。 阅读提示:Methods 2.1和2.2,以及图1和图3图例。 |
| 药物处理 | STM2457和Fer-1的剂量、给药方式(腹腔注射)、给药时间及频率;STM2457为每日注射2周,Fer-1为每日注射8周。 阅读提示:Methods 2.2和补充图S1、S4。 |
| 细胞培养与处理 | BMDM提取方法、分化条件(M-CSF浓度)、ox-LDL浓度、Erastin浓度及处理时间;siRNA转染浓度和时间。 阅读提示:Methods 2.11和2.12,以及图S3和S6。 |
| 基因敲低/过表达 | AAV-shRNA构建、注射病毒剂量和时间点;siRNA和过表达载体的序列;lentivirus的MOI和处理时间。 阅读提示:Methods 2.2和2.12,以及图3、5和S7。 |