筛选NSC777201对CRC细胞的敏感性
评估NSC777201对CRC细胞系的生长抑制和细胞毒性作用。
通过NCI-60筛选,单剂量10 µM处理,发现CRC最敏感;随后在四种CRC细胞系中用MTT测定IC50。
NSC777201 exhibits anticancer activity against colorectal cancer cells by inducing multiple types of cell death.
NCI-60筛选、四种CRC细胞系体外实验、HCT116异种移植瘤模型、RNA-seq及多种细胞死亡机制验证。
HCT116、HT29、RKO、DLD-1细胞 HCT116肿瘤异种移植裸鼠模型 TCGA CRC患者数据
NCI-60筛选单剂量10 µM NSC777201 CRC细胞系HCT116、HT29、RKO、DLD-1的IC50值分别6.81、7.63、8.75、10.28 µM(处理24h) HCT116异种移植模型NSC777201剂量5 mg/kg体重,腹腔注射,每周5天 RNA-seq分析处理条件:HCT116 6 µM、HT29 8 µM,处理6小时 DHCR7敲低或7-DHC补充实验验证铁死亡机制
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估NSC777201对CRC细胞系的生长抑制和细胞毒性作用。
通过NCI-60筛选,单剂量10 µM处理,发现CRC最敏感;随后在四种CRC细胞系中用MTT测定IC50。
验证NSC777201在体内的抗肿瘤活性及耐受性。
使用HCT116异种移植裸鼠模型,腹腔注射NSC777201,监测肿瘤体积和体重。
探究NSC777201是否通过抑制EGFR和MET发挥抗癌作用。
通过Western blot、qPCR、CETSA等分析EGFR和MET表达及相互作用。
预测NSC777201诱导的细胞死亡途径。
RNA-seq分析处理后的HCT116和HT29细胞,筛选差异基因,GSVA分析富集的细胞死亡基因签名。
验证NSC777201诱导的细胞死亡具体类型和机制。
使用Western blot检测自噬标志物(LC3B、p62)、铁死亡标志物(GPX4、SLC7A11、SLC3A2)和铁蛋白自噬标志物(NCOA4、FTL)的表达,并通过荧光探针检测脂质过氧化和亚铁离子。
验证NSC777201通过上调DHCR7降低7-DHC水平从而诱导铁死亡。
qPCR检测DHCR7等基因表达,ELISA检测7-DHC水平,并补充外源性7-DHC观察细胞活力和脂质过氧化变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | NSC777201 | -- | -- |
| 奥沙利铂 | AdooQ Bioscience | A10346 | |
| 5-氟尿嘧啶 | AdooQ Bioscience | A10042 | |
| SN-38 | AdooQ Bioscience | A12011 | |
| 依托泊苷 | AdooQ Bioscience | A10373 | |
| MG132 | AdooQ Bioscience | A11043 | |
| Ferrostatin-1 | AdooQ Bioscience | A13247 | |
| 细胞培养 | McCoy's 5A培养基 | Corning | 10-050-CVS |
| 胎牛血清 | Corning | 35-010-CV | |
| RPMI-1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | 22400071 | |
| L-谷氨酰胺 | Thermo Fisher Scientific | 25030-81 | |
| 非必需氨基酸 | Thermo Fisher Scientific | 11140050 | |
| 抗生素-抗真菌溶液 | Thermo Fisher Scientific | 15240-062 | |
| 磷酸盐缓冲液片剂 | Thermo Fisher Scientific | 18912014 | |
| 细胞裂解 | RIPA裂解和提取缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | 89901 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596026 |
| 药物处理 | 氯喹 | Sigma-Aldrich | C6628 |
| Spautin-1 | Sigma-Aldrich | SML0440 | |
| 去铁胺 | Sigma-Aldrich | D9533 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | D5879 | |
| 细胞裂解 | 磷酸酶抑制剂混合物片剂 | Sigma-Aldrich | 04906837001 |
| 蛋白酶抑制剂混合物片剂 | Sigma-Aldrich | 11873580001 | |
| 药物处理 | Z-VAD-FMK | APExBIO | A1902 |
| 细胞活力检测 | MTT | Alfa Aesar | AF-L11939 |
| Western blot | 抗SLC7A11抗体 | Arigo Biolaboratories | ARG57998 |
| 抗GPX4抗体 | Arigo Biolaboratories | ARG41400 | |
| 抗磷酸化MET抗体 | Abcam | AB5662 | |
| 抗caspase-3抗体 | Abcam | AB13585 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | A19056 | |
| 抗Vinculin抗体 | Cell Signaling Technology | A2752 | |
| 抗FTL抗体 | Cell Signaling Technology | A11241 | |
| 抗EGFR抗体 | Cell Signaling Technology | 4267 | |
| 抗磷酸化EGFR抗体 | Cell Signaling Technology | 2243 | |
| 抗PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9542 | |
| 抗MET抗体 | GeneTex | GTX100637 | |
| 抗p62抗体 | GeneTex | GTX100685 | |
| 抗SLC3A2/CD98抗体 | GeneTex | GTX104108 | |
| 肌动蛋白抗体 | GeneTex | GTX109639 | |
| 抗LC3B抗体 | Proteintech Group | 18725-1-AP | |
| 脂质过氧化检测 | 脂质过氧化检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K880-M |
| Western blot | HRP标记的抗兔二抗 | Jackson Laboratory | 111-035-003 |
| HRP标记的抗鼠二抗 | Jackson Laboratory | 115-035-003 | |
| 增强化学发光试剂 | PerkinElmer | NEL105001EA | |
| Bradford蛋白定量试剂 | Bio-Rad Laboratories | 5000006 | |
| 双色蛋白marker | Bio-Rad Laboratories | 1610374 | |
| 10× SDS-甘氨酸电泳缓冲液 | Bio-Rad Laboratories | 1610772 | |
| Trans-Blot Turbo RTA小型0.2 μm硝酸纤维素膜转印试剂盒 | Bio-Rad Laboratories | 1704270 | |
| 显微镜检查 | µ-Slide八孔板 | ibidi | IB-80826 |
| 自噬检测 | Cyto-ID自噬检测试剂盒 | Enzo Life Sciences | ENZ-51031-K200 |
| 铁离子检测 | FerroOrange探针 | Dojindo Laboratories | F374 |
| 蛋白质合成 | iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad Laboratories | 1708891 |
| qPCR | IQ2 SYBR Green快速qPCR系统预混液 | Bio-Genesis Technologies | DBU-006 |
| Quantstudio 1实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| ELISA | 7-DHC ELISA试剂盒 | Cloud-Clone | CED057Hu |
| 统计分析 | GraphPad Prism 9 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活力检测 | 细胞系;细胞接种密度(10,000-15,000);药物浓度;处理时间(24小时);MTT浓度和孵育时间 阅读提示:Methods: Cell viability assay |
| 肿瘤异种移植 | 细胞系HCT116;接种细胞数(10^7);动物品系(裸鼠);给药剂量(5 mg/kg);给药方式(腹腔注射);给药频率(每天,每周5天);肿瘤体积测量频率(每周三次) 阅读提示:Methods: Tumor xenograft model |
| 蛋白表达检测 | 细胞系;药物浓度(如6 µM、8 µM);处理时间;抗体稀释度;裂解缓冲液 阅读提示:Methods: Western blot analysis; Figure legends Fig. 2, 4 |
| RNA-seq分析 | 细胞系;药物浓度;处理时间;生物学重复数;测序平台;差异基因筛选标准 阅读提示:Methods: RNA sequencing (RNA-Seq) analysis |
| 铁死亡机制验证 | 细胞系;药物浓度;处理时间;外源性7-DHC浓度(30 µM);脂质过氧化探针使用;FerroOrange探针使用 阅读提示:Methods: Fluorescence microscopy of autophagic vacuoles; Lipid peroxidation assay; Fluorescence imaging of intracellular ferrous iron; Figure legends Fig. 4E、F, 8C、D |