EP3表达分析
确定肥胖状态下巨噬细胞中EP3表达的变化
分析人类脂肪组织单核测序数据中EP3表达,并检测HFD小鼠脂肪组织巨噬细胞及棕榈酸处理的BMDM中EP3 mRNA水平
Deletion of EP3 prostaglandin receptor in murine macrophages aggravates diet-induced obesity by suppressing SPARC.
包含细胞共培养、巨噬细胞条件性敲除/过表达小鼠模型、蛋白质组学、DNA甲基化分析及药物干预等多层级证据。
骨髓来源巨噬细胞(BMDM)与3T3-L1共培养体系 巨噬细胞特异性EP3敲除小鼠(EP3F/FLysMCre) 巨噬细胞特异性EP3α过表达小鼠(Rosa-EP3α/LysMCre) 高脂饮食(HFD)诱导肥胖小鼠
EP3在肥胖患者和HFD小鼠的脂肪组织巨噬细胞中表达下调 巨噬细胞特异性EP3缺失加重HFD诱导的肥胖,而过表达EP3α减轻肥胖 EP3缺失通过Dnmt1/3a介导的DNA甲基化抑制SPARC表达 SPARC缺失消除EP3过表达的保护作用 EP3激动剂sulprostone治疗缓解HFD诱导的肥胖
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定肥胖状态下巨噬细胞中EP3表达的变化
分析人类脂肪组织单核测序数据中EP3表达,并检测HFD小鼠脂肪组织巨噬细胞及棕榈酸处理的BMDM中EP3 mRNA水平
验证巨噬细胞EP3对脂肪细胞分化的影响
用EP3激动剂sulprostone或抑制剂L-798106处理BMDM,与3T3-L1前脂肪细胞共培养,检测脂肪生成标志物
评估巨噬细胞EP3对HFD诱导肥胖的影响
比较巨噬细胞特异性EP3敲除小鼠(EP3F/FLysMCre)和对照小鼠在HFD下的体重、脂肪组织质量、脂肪细胞大小及代谢指标;并构建巨噬细胞EP3α过表达小鼠进行验证
寻找EP3缺失巨噬细胞中变化的关键分泌因子
对WT和EP3−/− BMDM用棕榈酸处理后,收集培养基上清进行4D无标记定量蛋白质组学分析
阐明EP3调控SPARC表达的分子机制
检测EP3缺失巨噬细胞中Sparc启动子甲基化水平及Dnmt1/3a表达,并验证PKA/Sp1通路的作用
评估EP3激动剂对HFD诱导肥胖的治疗效果
对HFD喂养的小鼠给予EP3激动剂sulprostone治疗,评估体重、糖耐量、胰岛素敏感性及脂肪组织形态
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | SPARC条件性敲除小鼠 | Shanghai Model Organisms Center, Inc. | NM-CKO-2109560 |
| Dnmt1和Dnmt3a双条件性敲除小鼠 | -- | N/A | |
| EP3敲除小鼠 | -- | N/A | |
| 巨噬细胞特异性EP3敲除小鼠 | -- | N/A | |
| Rosa-EP3α小鼠 | -- | N/A | |
| 抗体 | 兔抗Dnmt1抗体 | Cell Signaling Technology | 5032 |
| 兔抗Dnmt3a抗体 | Abcam | ab188470 | |
| 兔抗Dnmt3b抗体 | Abcam | ab2851 | |
| 兔抗SPARC抗体 | Cell Signaling Technology | 5420 | |
| 兔抗SP1抗体 | Proteintech | 21962-1-AP | |
| 兔抗磷酸化SP1 (T453)抗体 | Abcam | ab59257 | |
| 兔抗TET1抗体 | Abclonal | A1506 | |
| 兔抗TET2抗体 | Proteintech | 21207-1-AP | |
| 兔抗TET3抗体 | Abclonal | A7612 | |
| 兔抗NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242S | |
| 兔抗组蛋白H3抗体 | Cell Signaling Technology | 4499S | |
| 兔抗NOS2抗体 | Abcam | ab15323 | |
| 山羊抗YM1抗体 | R&D Systems | AF2446 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG抗体 | Abclonal | AS029 | |
| HRP标记的二抗 | Cell Signaling Technology | 7074S, 7076S | |
| Mac-3抗体 | Biolegend | 108512 | |
| CD31抗体 | Abcam | ab28364 | |
| Alexa Fluor 488标记的二抗 | Invitrogen | A11008 | |
| Alexa Fluor 647标记的二抗 | Jackson ImmunoResearch | 112-606-07 | |
| 流式分选 | 抗CD45-APCCy7抗体 | ebioscience | 47-0451-82 |
| 抗F4/80-Brilliant Violet 421抗体 | BioLegend | 123137 | |
| 抗CD11b-FITC抗体 | BioLegend | 101206 | |
| siRNA转染 | siRNA序列 | Hanbio Biotechnology | Appendix Table S1 |
| qRT-PCR | RT-qPCR引物 | This study | Appendix Table S2 |
| DNA甲基化分析 | BSP甲基化引物 | This study | Appendix Table S3 |
| 药物处理 | 地西他滨 | Sigma-Aldrich | A3656 |
| 胰岛素 | Sigma-Aldrich | I6634 | |
| 细胞分离 | II型胶原酶 | Sigma-Aldrich | S20133006 |
| 细胞分化 | 地塞米松 | Sigma-Aldrich | D4902 |
| 3-异丁基-1-甲基黄嘌呤 | Sigma-Aldrich | I5879 | |
| 罗格列酮 | Sigma-Aldrich | D2408 | |
| GTT | D-葡萄糖 | Sigma-Aldrich | G6152 |
| 信号通路抑制 | H-89 | Cayman | 10010556 |
| 普卡霉素A | Cayman | 11434 | |
| siRNA转染 | Lipofectamine™ RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | 13778075 |
| ELISA | IL-6 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0044 |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M3063 | |
| MCP-1 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M3001 | |
| PBMC分离 | 小鼠外周血单个核细胞分离试剂盒 | Solarbio | P5230 |
| 细胞处理 | 棕榈酸 | Kunchuang Biotechnology | KC002 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596018 |
| cDNA合成 | Hifair® III第一链cDNA合成SuperMix(qPCR用) | YeaSen Biotechnology | 11141ES60 |
| 油红O染色 | 油红O染色液 | Servicebio | G1015 |
| 流式细胞分选 | FACSAriaTM II流式细胞分选系统 | BD Biosciences | BD Biosciences |
| 蛋白质组学 | timeTOF Pro质谱仪 | Bruker | Bruker |
| 质谱分析 | ACQUITY UPLC液相色谱系统 | Waters | Waters |
| 5500 QTRAP质谱仪 | AB Sciex | AB Sciex | |
| 显微镜 | 激光共聚焦超高分辨率显微镜 | ZEISS | ZEISS |
| qRT-PCR | LightCycler 480 II实时荧光定量PCR仪 | Roche | Roche |
| 代谢率测定 | CLAMS代谢笼 | Columbus | Columbus |
| 共培养 | Transwell系统 | Corning | Corning |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系(C57BL/6)、年龄(8-12周)、性别(雄性)、HFD脂肪含量(60%)、喂养时长(16周) 阅读提示:Methods: Animals |
| BMDM培养与处理 | BMDM分化时间(7天)、M-CSF来源(L929条件培养基)、代谢活化条件(30 mM葡萄糖、10 nM胰岛素、0.4 mM棕榈酸) 阅读提示:Methods: Isolation, culturing, and transfection of BMDMs |
| 共培养实验 | BMDM与3T3-L1共培养方式(Transwell)、分化诱导剂组合(地塞米松、IBMX、胰岛素) 阅读提示:Methods: Coculture of adipocytes with BMDMs |
| DNA甲基化分析 | Sparc启动子区域CpG位点、甲基化水平定量方法 阅读提示:Figure 5A–C, Methods: DNA methylation analysis of SPARC |
| 药物干预实验 | EP3激动剂sulprostone给药剂量、给药方案(HFD喂养13周后处理5周) 阅读提示:Figure 8A, Methods: 未明确说明(需参考原文) |