分析TP53突变在PCa中的临床意义
评估TP53突变的患病率及其与患者预后的关联
通过对7,678例患者的cBioPortal数据进行综合分析,比较TP53突变与野生型患者的生存期、复发率、Gleason评分和病理T分期。
Modulating the Immunosuppressive Tumor Microenvironment and Inhibiting Growth in Mutp53-Driven CRPC via STAT3 Pathway Blockade.
包含临床样本数据分析、CRISPR/Cas9基因编辑细胞模型、体外功能实验、小鼠体内模型、免疫微环境分析(流式、免疫荧光、ELISA)及机制验证(Co-IP),证据层级多样。
RM-1小鼠前列腺癌细胞(Trp53 p.R245Q突变) C57BL/6小鼠皮下移植瘤模型 C4-2人前列腺癌细胞系 HEK293T细胞
TP53突变状态:Trp53 p.R245Q(对应人TP53 p.R248Q)在RM-1细胞中的引入,以及C4-2细胞中TP53敲除 JAK2和STAT3抑制剂给药方案:STAT3抑制剂(10 mg/kg,口服,隔日,7天)和Jak-2抑制剂(20 mg/kg,口服,每日,13天) 肿瘤模型:RM-1细胞皮下注射(1×10⁶细胞),与Matrigel混合 免疫细胞分型标志物:F4/80+CD86+(M1)和F4/80+CD206+(M2)巨噬细胞,CD4+Foxp3+ Treg 细胞因子检测:IFN-γ、IL-10、TGF-β(ELISA)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估TP53突变的患病率及其与患者预后的关联
通过对7,678例患者的cBioPortal数据进行综合分析,比较TP53突变与野生型患者的生存期、复发率、Gleason评分和病理T分期。
通过CRISPR/Cas9基因编辑引入鼠源p53突变,以模拟人类TP53 p.R248Q突变。
使用CRISPR/Cas9在RM-1细胞中引入Trp53 p.R245Q突变,通过Sanger测序和凝胶电泳验证,并进行功能分析(增殖和集落形成)。
确定mutp53对肿瘤生长的影响
将RM-1细胞(WTp53或mutp53)皮下植入C57BL/6小鼠,测量肿瘤体积和重量;同时进行RNA测序和通路富集分析。
表征mutp53肿瘤中的免疫细胞浸润和细胞因子表达
通过H&E染色、流式细胞术、免疫荧光和ELISA分析免疫细胞亚群(M1/M2巨噬细胞、Treg)和细胞因子(IFN-γ、IL-10、TGF-β)。
阐明mutp53如何通过SHP1相互作用调节STAT3激活
通过Co-IP检测mutp53与STAT3/p-STAT3的结合,以及SHP1与p-STAT3的结合;使用siRNA敲低SHP1;分析SHP1表达与患者预后的关联。
确定JAK2/STAT3通路抑制是否能逆转mutp53驱动的肿瘤生长和免疫抑制
对携带mutp53肿瘤的小鼠给予JAK2和STAT3抑制剂,测量肿瘤体积和重量,并通过免疫荧光和ELISA分析免疫细胞浸润和细胞因子。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Shanghai VivaCell Biosciences | C3103-0500 |
| RPMI-1640培养基 | Shanghai VivaCell Biosciences | C3001-0500 | |
| 胎牛血清 | Shanghai VivaCell Biosciences | C04001-500 | |
| 青霉素/链霉素 | Proteintech Group | PR40022 | |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000001 |
| Western blotting | 裂解缓冲液 | Cell Signaling Technology | 9803 |
| 蛋白酶抑制剂 | Beyotime Biotech | P1008 | |
| 磷酸酶抑制剂 | Beyotime Biotech | P1081 | |
| PVDF膜 | Merck | IPVH00010 | |
| 免疫沉淀 | 免疫共沉淀试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 26147 |
| 细胞增殖检测 | MTT试剂 | Beyotime Biotech | C0009S |
| 动物实验 | STAT3抑制剂 (HY-100753) | MedChemExpress | HY-100753 |
| Jak-2抑制剂 (HY-131906) | MedChemExpress | HY-131906 | |
| 基质胶 | Shanghai Nova Pharmaceutical Technology | 0827045 | |
| 免疫组化 | p-JAK2抗体 | Affinity Biosciences | AF3024 |
| p-STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9145 | |
| 免疫荧光 | CD86抗体 | Cell Signaling Technology | 91882 |
| CD163抗体 | Abcam | EPR19518 | |
| CD45抗体 | Affinity Bioscience | DF6839 | |
| IFN-γ抗体 | Wuhan Servicebio Technology | GB11107-1 | |
| 流式细胞术 | IFN-γ抗体 | BD Biosciences | 554412 |
| F4/80抗体 | BioLegend | 123116 | |
| CD11b抗体 | BioLegend | 101206 | |
| CD86抗体 | Elabscience | 213111 | |
| CD206抗体 | BD Biosciences | 565250 | |
| ELISA | IFN-γ ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0048 |
| IL-10 ELISA试剂盒 | Servicebio | GEM0003-96T | |
| TGF-β ELISA试剂盒 | Elabscience | E-UNEL-M0099 | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0037 | |
| 流式细胞术 | CytoFLEX LX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| Western blotting | Chemiscope 5600化学发光分析仪 | Clinx Science Instruments | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | RM-1细胞使用RPMI-1640培养基,C4-2和HEK293T细胞使用DMEM,均添加10% FBS和1%青霉素/链霉素,培养在37°C、5% CO2。 阅读提示:Methods 2.1 Cell culture and maintenance |
| 基因编辑 | 通过CRISPR/Cas9在RM-1细胞中引入Trp53 p.R245Q突变,使用CRISPR-U™和Donor质粒电转,经新霉素筛选;在C4-2细胞中敲除TP53使用YCas-LV002载体和sgRNA,G418筛选。 阅读提示:Methods 2.2 CRISPR/Cas9 gene editing techniques |
| 体外功能实验 | MTT实验:5 mg/ml MTT,孵育2小时,570 nm读取OD值;集落形成实验:接种于6孔板,培养8天,结晶紫染色。 阅读提示:Methods 2.4 Cell proliferation and colony formation assays |
| 动物模型 | 6周龄雄性C57BL/6小鼠,皮下注射1×10⁶ RM-1细胞(100 μL Matrigel:PBS 1:1),肿瘤约100 mm³时开始治疗。 阅读提示:Methods 2.5 Animal studies |
| 药物治疗 | STAT3抑制剂(HY-100753)10 mg/kg口服隔日7天,Jak-2抑制剂(HY-131906)20 mg/kg口服每日13天,治疗终止于第21天。 阅读提示:Methods 2.5 Animal studies |
| 免疫微环境分析 | 流式细胞术检测M1(F4/80+CD86+)、M2(F4/80+CD206+)巨噬细胞;ELISA检测IFN-γ、IL-10、TGF-β和IL-1β。 阅读提示:Methods 2.5 Animal studies and histological techniques |