hTSC来源的胎盘类器官在芯片上的生成和鉴定
验证从hTSC在芯片上生成功能性胎盘类器官。
将hTSC聚集体包埋于Matrigel中,在芯片上动态培养分化形成TOs,并通过免疫染色、RT-qPCR、ELISA等方法鉴定滋养层标志物。
An engineered human placental organoid microphysiological system in a vascular niche to model viral infection.
包含体外细胞模型(hTSC来源类器官)、血管内皮共培养、RNA-seq、Luminex、ZIKV感染等,涵盖功能验证和机制分析。
人滋养层干细胞来源的胎盘类器官(TOs/EOs) 与血管内皮共培养的滋养层类器官(EndTOs/EndEOs) 人脐静脉内皮细胞(HUVECs)
hTSC细胞来源及培养条件 基质胶浓度和凝胶化条件 动态培养流速(2 rpm/min) 共培养培养基比例(TOM/EGM2=1:1) ZIKV感染MOI(0.1和1)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证从hTSC在芯片上生成功能性胎盘类器官。
将hTSC聚集体包埋于Matrigel中,在芯片上动态培养分化形成TOs,并通过免疫染色、RT-qPCR、ELISA等方法鉴定滋养层标志物。
评估血管内皮共培养对TOs长期存活和分化的影响。
将HUVECs接种于插入物膜下侧形成内皮层,与TOs共培养6天,分析细胞活力、增殖、分化标志物。
研究血管内皮对EOs中EVT分化的影响。
将EOs与内皮共培养,通过免疫染色和RT-qPCR分析EVT标志物表达。
表征EndTOs的转录特征和细胞因子分泌谱。
对TOs和EndTOs进行RNA-seq和Luminex分析,鉴定差异表达基因和分泌因子。
评估EndTOs对ZIKV感染的易感性及宿主防御反应。
将TOs和EndTOs感染ZIKV(MOI 0.1或1),检测病毒RNA水平、免疫染色、转录组和细胞因子分泌。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 胶原蛋白IV型 | Sigma-Aldrich | C5533 |
| DMEM/F12基础培养基 | Gibco | C11330500BT | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 人血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | A1653 | |
| ITS-X补充剂 | Sigma-Aldrich | 51500056 | |
| L-抗坏血酸 | Sigma-Aldrich | A4544 | |
| 表皮生长因子 | PeproTech | AF-100-15 | |
| CHIR99021 | Selleckchem | S1263 | |
| A83-01 | Selleckchem | S7692 | |
| SB431542 | Selleckchem | S1067 | |
| 丙戊酸 | Sigma-Aldrich | P4543 | |
| Y-27632 | Selleckchem | S6390 | |
| 胶原蛋白I型 | Corning | 354249 | |
| EGM-2培养基 | Lonza | CC-3162 | |
| 类器官培养 | TrypLE Express | Gibco | 12605028 |
| AggreWell™400微孔培养板 | Stemcell | 34411 | |
| 基质胶 | Corning | 354230 | |
| Advanced DMEM/F12培养基 | Gibco | 12634010 | |
| N2补充剂 | Gibco | 17502048 | |
| B27补充剂(不含维生素A) | Gibco | 12587010 | |
| Primocin | Invivogen | ant-pm-1 | |
| N-乙酰-L-半胱氨酸 | Sigma-Aldrich | A9165 | |
| L-谷氨酰胺 | Gibco | 25030081 | |
| R-spondin 1 | PeproTech | AF-120-38 | |
| 成纤维细胞生长因子2 | PeproTech | 100-18C | |
| 肝细胞生长因子 | Novoprotein | CJ72 | |
| 前列腺素E2 | Selleck | HY-101952 | |
| 免疫染色 | OCT包埋剂 | SAKURA | -- |
| DAPI | Life Technologies | 4000 | |
| Triton X-100 | -- | -- | |
| 山羊血清 | Solarbio | -- | |
| Alexa Fluor 488 | Cell Signaling Technology | 500 | |
| Alexa Fluor 594 | Cell Signaling Technology | 500 | |
| 透射电子显微镜 | SPI-Pon 812树脂 | Sigma-Aldrich | -- |
| ZIKV感染 | 细胞回收液 | Corning | 354253 |
| 流式细胞术 | PE-ITGA2 | -- | -- |
| CGB | -- | -- | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | TAKARA | -- |
| Ex Taq DNA聚合酶 | TAKARA | -- | |
| ELISA | hCG ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H0175 |
| 人PDGF-BB ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H1577 | |
| RNA-seq | Ribo-off rRNA去除试剂盒 | Illumina | -- |
| KC-DigitalTM标准mRNA文库制备试剂盒 | Seqhealth | -- | |
| NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| Luminex分析 | MILLIPLEX MAP人细胞因子/趋化因子磁珠面板(预混37重) | Merck Millipore | -- |
| 定制人血管生成阵列试剂盒 | R&D Systems | -- | |
| 免疫染色 | 低温恒温器 | Leica | -- |
| 共聚焦显微镜(FV3000) | Olympus | -- | |
| 流式细胞术 | SH800S细胞分选仪 | Sony Biotechnology | -- |
| 透射电子显微镜 | JEM-1400 PLUS电子显微镜 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞维持与分化 | hTSC和HUVEC的来源、培养条件(培养基组成、添加剂浓度)、传代代数 阅读提示:Methods中的Cell culture部分 |
| 类器官生成 | hTSC聚集体数量、Matrigel浓度、接种体积、分化培养基组成、动态培养流速 阅读提示:Methods中的Culture of hTSC-derived placental organoids on chip部分 |
| 血管内皮的整合 | HUVEC接种密度、膜孔径、胶原包被条件、共培养培养基比例 阅读提示:Methods中的Coculture of placental organoids with endothelium on chip部分 |
| 病毒感染 | ZIKV毒株、MOI、感染时间、复包埋步骤、感染后培养时间 阅读提示:Methods中的Exposure of organoids to ZIKV部分 |
| 数据分析和统计 | RNA-seq库制备协议、差异基因筛选阈值(FC>2, p<0.05)、GO/KEGG富集分析的p值阈值 阅读提示:Methods中的RNA-sequencing和Statistical analysis部分 |