小分子模块筛选与重编程
鉴定能有效将成纤维细胞转化为成骨细胞的小分子组合。
筛选靶向WNT通路的小分子,并根据对RUNX2、DLX5、SP7、c-MYC基因表达的调控效果进行模块化,形成CFRVT、CFRVGSE、CFRV三个组合,并按时序处理18天。
Engineering fibroblast with reprogramming and spheronization for bone defect repair.
包含体外细胞重编程、分子机制验证(WNT通路)、体内动物模型(小鼠股骨缺损)及组织学分析等多种独立证据层级。
人皮肤成纤维细胞 诱导成骨细胞(iOBs) iOB球体(iOB-Sps) 小鼠股骨缺损模型
小分子组合CFRVT、CFRVGSE、CFRV的时序处理 WNT信号通路抑制剂ICG-001和XAV939的作用 不同年龄供体(8至79岁)的成纤维细胞来源 iOB球体的细胞数量(7×10^4至2×10^6) 体内移植的细胞数量(4个球体,每个1.3×10^5细胞)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定能有效将成纤维细胞转化为成骨细胞的小分子组合。
筛选靶向WNT通路的小分子,并根据对RUNX2、DLX5、SP7、c-MYC基因表达的调控效果进行模块化,形成CFRVT、CFRVGSE、CFRV三个组合,并按时序处理18天。
验证iOBs是否具有成熟成骨细胞的功能特征。
通过茜素红染色、RT-qPCR、免疫荧光检测RUNX2、SP7、COL1、VEGF等表达,并与年轻供体的bMSC来源成骨细胞比较。
研究3D球体形成对iOBs存活、增殖和分泌功能的影响。
通过离心聚集形成iOB-Sps,评估细胞活力、H2O2应激下ROS水平、增殖(Ki67)、凋亡(TUNEL)、分化标志物(SP7、IBSP)、COL1和VEGF分泌,以及与脱细胞猪松质骨的共培养。
评估iOB-Sps对骨髓间充质干细胞和内皮细胞功能的影响。
使用Transwell系统共培养老年bMSCs和iOB-Sps,检测bMSCs的成骨分化;使用条件培养基处理HUVECs,检测管形成和增殖;建立接触和非接触共培养模型评估内皮细胞迁移。
评估iOB-Sps在体内促进骨缺损修复的效果和安全性。
在NOD/SCID小鼠股骨上制造5mm×1.5mm缺损,移植iOB-Sps(来自79岁供体),28天后通过Micro-CT、组织学染色、免疫组化分析骨形成和血管生成,并使用TUNEL、Ki67、GFP跟踪细胞存活和分化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | ExCell | -- | |
| 青霉素/链霉素 | sigma | -- | |
| 重编程 | CHIR99021 | -- | -- |
| 毛喉素 | -- | -- | |
| RepSox | -- | -- | |
| 丙戊酸 | -- | -- | |
| 曲古抑菌素A | -- | -- | |
| Go6983 | -- | -- | |
| SP600125 | -- | -- | |
| EPZ004777 | -- | -- | |
| ICG-001 | MCE | -- | |
| XAV939 | MCE | -- | |
| 成骨分化 | β-甘油磷酸 | Sigma-Aldrich | -- |
| 地塞米松 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 抗坏血酸 | MCE | -- | |
| 茜素红染色试剂盒 | Cyagen | ALIR-10001 | |
| 球体形成 | 胰蛋白酶 | -- | -- |
| ROS检测 | 过氧化氢溶液 | Macklin | H792077 |
| 细胞活力检测 | MTS实验 | -- | -- |
| AO/PI检测试剂盒 | Beijing BioLab Technology | HR0462 | |
| ROS检测 | DCFH-DA | Beyotime | S0033S |
| 细胞增殖 | MTT试剂盒 | Beyotime | C0009S |
| 二甲基亚砜 | Sigma | -- | |
| 细胞因子检测 | 人VEGF ELISA试剂盒 | enzyme research | EK-H11892 |
| 人IL6试剂盒 | Elabscience | E-EL-H6156 | |
| 人COL1 ELISA试剂盒 | enzyme research | EK-H10023 | |
| 共培养 | Transwell小室 | NEST | 725111 |
| 血管生成 | 基质胶 | Corning | 354230 |
| RNA提取 | RNAiso plus | TAKARA | -- |
| 反转录 | PrimeScript RT试剂盒(含gDNA Eraser) | TAKARA | -- |
| qPCR | 实时PCR预混液 | TAKARA | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| SDS-PAGE凝胶 | Beyotime | P0012AC | |
| PVDF膜 | Sigma | 3010040001 | |
| β-肌动蛋白抗体 | santa Cruz | sc-69879 | |
| CTNNB1抗体 | Medchem EXPRress | HY-P80488 | |
| WNT5A抗体 | GeneTex | GTX111187 | |
| c-MYC抗体 | Proteintech | 67447-1-Ig | |
| SP7抗体 | abcam | ab94744 | |
| DLX5抗体 | Proteintech | 67111-1-Ig | |
| RUNX2抗体 | santa Cruz | sc-39035 | |
| 山羊抗小鼠IgG (H+L) HRP | Transgen | HS201-01 | |
| 山羊抗兔IgG (H+L) HRP | Transgen | HS101-01 | |
| 化学发光试剂盒 | Sunviewbio | PL101-100 | |
| 衰老检测 | 细胞衰老SA-β-半乳糖苷酶染色试剂盒 | Beyotime | C0602 |
| 核染色 | DAPI | Life Technologies | 62248 |
| 脱细胞骨制备 | Triton X-100 | -- | -- |
| 氯仿 | -- | -- | |
| 甲醇 | -- | -- | |
| 过氧化氢 | -- | -- | |
| RNA-seq | Illumina NovaSeq测序平台 | Illumina | -- |
| ROS检测 | 小鼠ROS ELISA试剂盒 | mlbio | YJ141325 |
| ROS成像 | ROS Brite™ 700 | in vivo imaging solutions | -- |
| Micro-CT | SkyScan1272 | Bruker | -- |
| 组织化学 | EDTA | Servicebio | G1105 |
| 改良番红O和快绿染色试剂盒 | solarbio | G1371 | |
| H&E染色试剂盒 | Phygene | PH0516 | |
| 免疫组化 | 抗GFP抗体 | Abcam | ab13970 |
| 抗IBSP抗体 | Bioss | bs-2668R | |
| 抗OCN抗体 | Bioss | bs-4917R | |
| 抗Ki67抗体 | Invitrogen | 2747806 | |
| 抗SP7抗体 | Abcam | ab94744 | |
| 抗RUNX2抗体 | santacruz | sc-390351 | |
| 抗COL1抗体 | Bioss | bs-0578R | |
| 抗VEGF抗体 | santacruz | sc-7269 | |
| 人特异性抗VEGF抗体 | Abcam | ab27620 | |
| 抗STEM121抗体 | TAKARA | Y40410 | |
| 抗CD31抗体 | Immunoway | YP0530 | |
| 抗CD31抗体 | Servicebio | GB12063 | |
| 抗Nrf2抗体 | Proteintech | 80593-1-RR | |
| TUNEL试剂盒 | Beyotime | C1090 | |
| 免疫荧光 | 二抗 | Invitrogen | A21235 |
| 二抗 | Invitrogen | A21244 | |
| 二抗 | Univ | 703-545-155 | |
| 二抗 | Univ | 711-165-152 | |
| 二抗 | Abcam | AB150159 | |
| 二抗 | Servicebio | GB21301 | |
| 细胞爬片 | solarbio | YA0350 | |
| 荧光显微镜 | SLIDEVIEW VS200 | OLYMPUS | -- |
| 组织包埋 | O.C.T.包埋剂 | Sakura-Finetek | -- |
| 冰冻切片 | HM525 NX冰冻切片机 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞标记 | Hoechst 33342 | Thermo | -- |
| 体内成像 | 小动物活体成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 酶标仪 | Infinite M200 pro | TECAN | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 成纤维细胞重编程 | 小分子组合及其浓度(CFRVT、CFRVGSE、CFRV) 阅读提示:Materials and methods 5.2, 表S1和S2 |
| 成纤维细胞重编程 | 处理时间(各阶段天数) 阅读提示:Materials and methods 5.2 |
| iOB球体形成 | 细胞数量(7×10^4至2×10^6) 阅读提示:Materials and methods 5.5 |
| iOB球体形成 | 离心速度和时间(300g 5分钟) 阅读提示:Materials and methods 5.5 |
| H2O2处理 | H2O2浓度(800μM)和处理时间(4小时) 阅读提示:Materials and methods 5.6 |
| 体内移植 | 小鼠品系(NOD/SCID)、周龄(8-12周)、性别(雄性) 阅读提示:Materials and methods 5.18 |
| 体内移植 | 移植细胞数量(每个缺损4个球体,每个含1.3×10^5细胞) 阅读提示:Materials and methods 5.18 |
| 体内移植 | 观察时间(28天) 阅读提示:Materials and methods 5.18 |