构建条件性敲除小鼠模型
在子宫内膜上皮中特异性删除Prickle1,以研究其生理功能。
使用Prickle1f/+ ES细胞创建Prickle1f/f小鼠,并与Lactoferrin-iCre转基因小鼠杂交获得Prickle1f/f Ltf+/icre cKO小鼠。
Loss of PRICKLE1 leads to abnormal endometrial epithelial architecture, decreased embryo implantation, and reduced fertility in mice.
包含基因敲除小鼠模型、生育力与着床分析、3D成像、组织学与免疫染色、scRNA-seq及RNA velocity等多种证据层级,并包含功能与机制验证。
Prickle1f/f Ltf+/icre 小鼠(子宫内膜上皮条件性敲除) C57BL/6 野生型雄性小鼠(用于交配) 6月龄 Prickle1f/f Ltf+/icre 和对照小鼠子宫组织
Prickle1条件性敲除效率:通过免疫染色确认PRICKLE1表达缺失,但存在斑片状表达,提示不完全外显 生育力评估:6月龄Prickle1f/f Ltf+/icre cKO雌鼠与C57BL6 WT雄鼠交配,记录活产仔数(cKO为5.70,对照为9.36) 胚胎着床:在GD 4.5通过尾静脉注射1%芝加哥天蓝6B染料计数着床点,存在两组突变表型 子宫3D成像:使用全组织免疫荧光和共聚焦显微镜,检测腔折叠、腔关闭和腺体长度 scRNA-seq条件:6月龄小鼠(n=3每组),使用10× Genomics Chromium Single Cell 3' v3、Illumina NovaSeq 6000,数据已存入GSE272552
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在子宫内膜上皮中特异性删除Prickle1,以研究其生理功能。
使用Prickle1f/+ ES细胞创建Prickle1f/f小鼠,并与Lactoferrin-iCre转基因小鼠杂交获得Prickle1f/f Ltf+/icre cKO小鼠。
评估Prickle1缺失对活产仔数和胚胎着床的影响。
将雌性cKO和对照小鼠与C57BL6 WT雄鼠交配,记录活产仔数;在GD 3.5或4.5静脉注射染料计数着床点。
观察子宫腔折叠、腔关闭和腺体结构的变化。
对GD 4.5子宫进行全组织免疫荧光染色,使用共聚焦显微镜获取Z堆栈图像,并用Imaris软件重建3D结构,分析腺体长度。
检查上皮细胞形态、蛋白表达和定位变化。
对子宫组织进行H&E染色和免疫荧光/免疫组化染色,检测AQP2、E-cadherin、SOX9、EMT标志物等。
检测相关基因表达变化,包括生长因子、激素受体和EMT标志物。
提取子宫RNA,进行qRT-PCR分析特定基因表达。
在单细胞水平上分析细胞类型比例和基因表达变化,探究EMT和细胞重分类。
对6月龄小鼠子宫组织进行scRNA-seq,使用Seurat分析聚类,并利用RNA velocity评估细胞状态转变。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因分型 | Prickle1引物 | -- | -- |
| Ltf+/icre引物 | -- | -- | |
| 着床评估 | 芝加哥天蓝6B | Millipore Sigma | C8679 |
| 全组织免疫荧光 | 抗FOXA2抗体 | Abcam | ab108422 |
| 抗CDH1抗体 | Takara Biosciences | M108 | |
| Alexa Fluor 555标记驴抗兔IgG | Invitrogen | A31572 | |
| Alexa Fluor 633标记山羊抗大鼠IgG | Invitrogen | A21094 | |
| Hoechst | Sigma-Aldrich | B2261 | |
| 成像 | Leica TCS SP8 X共聚焦激光扫描显微镜 | Leica | -- |
| 图像分析 | Imaris v9.2.1 | Bitplane | -- |
| 组织学 | 抗原修复液 | Vector Labs | H-3301 |
| 免疫荧光 | 抗AQP2抗体 | Novus Biologicals | NB110-74682SS |
| 抗E-CAD抗体 | Cell Signaling | 24E10 | |
| 抗ZEB1抗体 | Cell Signaling | 70512 | |
| 抗TWIST1抗体 | Cell Signaling | 90445 | |
| 抗SNAI2抗体 | Cell Signaling | 9585 | |
| 抗PGR抗体 | Invitrogen | MA1-411 | |
| 抗PRICKLE1抗体 | BiCell Scientific | 50621 | |
| Alexa Fluor 488和594二抗 | Jackson Immuno Research Laboratories | 711-545-152, | |
| 免疫组化 | ABC Universal PLUS过氧化物酶试剂盒 | Vector Labs | PK-8200 |
| 抗KRT7抗体 | ThermoFisher Scientific | pA5-82291 | |
| 抗SOX9抗体 | Cell Signaling | 82630 | |
| 抗vimentin抗体 | Cell Signaling | D21H3 | |
| 抗ER抗体 | Proteintech | 21244-1-AP | |
| 抗dHAND抗体 | Santa-Cruz Biotechnology | sc-398167 | |
| 凋亡检测 | 一步法TUNEL原位凋亡试剂盒 | Elabscience | E-CK-A320 |
| RNA分离 | RNAlater | Invitrogen | AM7020 |
| TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 | |
| cDNA合成 | 高容量cDNA反转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4368814 |
| qRT-PCR | TaqMan检测(Fgf1、Fgf2等) | IDT | -- |
| Rn18s TaqMan检测 | ThermoFisher Scientific | Mm03928990_G1 | |
| 激素评估 | ELISA | -- | -- |
| scRNA-seq | 10× Chromium单细胞3' v3试剂 | 10× Genomics | -- |
| Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与基因型 | Prickle1f/f Ltf+/icre cKO小鼠的构建方法,包括ES细胞系和Cre品系;基因分型引物;年龄(6月龄用于主要实验) 阅读提示:Materials and methods: Generation of Prickle1 cKO mouse |
| 生育力与着床评估 | 交配方案,阴道栓检测时间(GD 0.5),着床点计数方法(GD 4.5,Chicago Sky Blue注射),样本量(对照组n=8,突变组n=13) 阅读提示:Materials and methods: Fertility and implantation; Figure 1E-F |
| 子宫3D成像 | 全组织免疫荧光步骤(固定、抗体、清除)、成像参数(Z-stack间隔、物镜)、图像分析软件和腺体长度测量方法 阅读提示:Materials and methods: Whole-mount immunofluorescence, Confocal imaging, Image analysis |
| 组织学与免疫染色 | 组织固定与包埋、抗原修复、抗体稀释和孵育时间、检测指标 阅读提示:Materials and methods: Histology and staining |
| 基因表达分析 | RNA提取方法、qRT-PCR引物、内参、分析方法 阅读提示:Materials and methods: RNA isolation and qRT-PCR analysis |
| 单细胞RNA测序 | 样本制备、文库构建、测序平台、生物信息学分析参数(如聚类分辨率、DoubletFinder设置) 阅读提示:Materials and methods: scRNA sequencing and Single-cell data analysis |