COPD小鼠模型建立与脂解评估
验证COPD中脂解是否增强
通过慢性CS暴露4个月建立COPD小鼠模型,检测GAT重量、ATGL表达、FFA释放、炎症因子水平。
Lipolysis engages CD36 to promote ZBP1-mediated necroptosis-impairing lung regeneration in COPD.
包含慢性CS暴露和弹性蛋白酶诱导的COPD小鼠模型、CD36基因敲除、ZBP1敲除/敲低、药理学抑制、AT2类器官培养、转录组学等多层级验证。
慢性香烟烟雾暴露诱导的小鼠COPD模型 弹性蛋白酶诱导的小鼠肺气肿模型 小鼠肺泡上皮细胞系MLE-12 小鼠AT2细胞类器官
CD36在肺上皮细胞中的特异性敲除(AAV6.2FF-Cre)对COPD进程的影响 ATGL抑制剂atglistatin的给药剂量(200 μmol/kg)和时间(预防或治疗) ZBP1敲除或敲低对坏死性凋亡和肺再生的影响 CD36单克隆抗体或SAB的治疗效果 香烟烟雾暴露的TPM浓度(500 mg/m3)和时长(4个月慢性,5天急性)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证COPD中脂解是否增强
通过慢性CS暴露4个月建立COPD小鼠模型,检测GAT重量、ATGL表达、FFA释放、炎症因子水平。
评估抑制脂解是否能改善COPD病理
使用ATGL抑制剂atglistatin进行预防(第3-4个月)或治疗(第5-6个月),检测BALF炎症细胞、胶原沉积、空气空间扩大等。
验证CD36在肺上皮细胞的特异性表达和功能
检测COPD患者和模型小鼠肺上皮CD36表达,利用AAV6.2FF-Cre在Cd36fl/fl小鼠中敲除CD36,评估预防和治疗效果。
证明CD36和脂解之间存在正反馈
检测Cd36敲除对GAT重量和FFA释放的影响,以及atglistatin对肺上皮CD36表达的影响。
验证ZBP1介导的坏死性凋亡是下游机制
使用Zbp1 KO小鼠,检测坏死性凋亡标志物(p-MLKL)、WNT信号、AT2类器官形成;免疫共沉淀验证ZBP1与RIPK3相互作用;检测Z-DNA形成。
评估CD36抗体或SAB对肺气肿的预防和治疗效果
使用CD36单克隆抗体或SAB处理慢性CS和弹性蛋白酶模型,检测病理、功能、信号通路和类器官形成。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 11995073 |
| DME/F-12培养基 | Cytiva | SH30023.01 | |
| Advanced DMEM/F12培养基 | Gibco | 12634010 | |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | F8687 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | A1933 | |
| 汉克斯平衡盐溶液 | Gibco | 14175095 | |
| 细胞分选 | EasySEP™生物素阳性选择试剂盒II | STEMCELL | 17683 |
| 小鼠CD326(Epcam)磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-105-958 | |
| 类器官培养 | 康宁基质胶(低生长因子) | Corning | 354230 |
| 表皮生长因子 | MedChemExpress | HY-P7067 | |
| ITS培养基添加剂(100X) | Beyotime Biotechnology | C0341 | |
| 成纤维细胞生长因子10 | MedChemExpress | HY-P7170 | |
| CHIR99021 | GlpBio | GC16702 | |
| SB431542 | MedChemExpress | HY-10432 | |
| Y-27632 | MedChemExpress | HY-10071 | |
| SB202190 | MedChemExpress | HY-10295 | |
| B27添加剂(无维生素A) | Gibco | 12587010 | |
| N-乙酰半胱氨酸 | Sigma-Aldrich | A9165 | |
| 烟酰胺 | Sigma-Aldrich | N0636 | |
| GlutaMax(100x) | Gibco | 35050061 | |
| HEPES | Gibco | 15630130 | |
| 细胞培养 | 青霉素/链霉素 | Gibco | 15070063 |
| Primocin | InvivoGen | ant-pm-1 | |
| 细胞因子刺激 | 白细胞介素-6 | MedChemExpress | HY-P7063 |
| 白细胞介素-1β | MedChemExpress | HY-P7073A | |
| 肿瘤坏死因子-α | MedChemExpress | HY-P7090A | |
| 动物模型 | 猪胰腺弹性蛋白酶 | Glpbio | GC61737 |
| 药物处理 | 丹酚酸B | Glpbio | GN10344 |
| RNA提取 | RNAiso Plus | TaKaRa | 9109 |
| RT-qPCR | ReverTra Ace® qPCR反转录试剂盒 | TOYOBO | FSQ-101 |
| ELISA | 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Elabscience | E-MSEL-M0002 |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-MSEL-M0001 | |
| 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Elabscience | E-MSEL-M0003 | |
| 游离脂肪酸检测 | 游离脂肪酸定量试剂盒 | Sigma-Aldrich | MAK044 |
| 免疫印迹 | CD36抗体(C1C3) | GeneTex | GTX100642 |
| ATGL多克隆抗体 | Proteintech | 55190-1-AP | |
| ADRP/Perilipin-2多克隆抗体 | Proteintech | 15294-1-AP | |
| 磷酸化MLKL抗体(Ser358) | Cell Signaling Technology | 91689S | |
| MLKL兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 37705S | |
| RIP3兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 95702S | |
| ZBP1单克隆抗体 | Adipogen | AG-20B-0010-C100 | |
| GAPDH多克隆抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| Axin2抗体 | Abcam | ab32197 | |
| β-catenin兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 8480S | |
| 免疫荧光 | Z-DNA/Z-RNA抗体 | Absoluteantibody | AB00783-3 |
| 免疫沉淀 | IgG | Cell Signaling Technology | 3900S |
| 免疫荧光 | 前表面活性蛋白C抗体 | Abcam | ab211326 |
| 流式/分选 | 清道夫受体B2/CD36单克隆抗体(克隆JC63.1) | Cayman | 10009893 |
| 细胞分选 | 生物素标记抗小鼠CD45抗体 | Biolegend | 103104 |
| 生物素标记抗小鼠CD31抗体 | Biolegend | 102504 | |
| 生物素标记抗小鼠CD24抗体 | Biolegend | 101804 | |
| 生物素标记抗小鼠Ly-6A/E(Sca-1)抗体 | Biolegend | 108104 | |
| 对照抗体 | 小鼠IgA, kappa同型对照 | Abcam | AB37354 |
| 病毒包装 | pDGM6质粒 | Addgene | 110660 |
| PLVX-shRNA1载体 | Clontech | 632177 | |
| Lipofiter转染试剂 | Hanbio | HB-LF-1000 | |
| 病毒纯化 | 腺相关病毒纯化试剂盒 | Biomiga | V1469-01 |
| 组织消化 | Liberase | Roche | -- |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma-Aldrich | -- | |
| 红细胞裂解 | 红细胞裂解液 | BioLegend | -- |
| RNA-seq | TruePrep RNA文库制备试剂盒(Illumina) | Vazyme | TR502-01 |
| 设备 | 蔡司LSM 700共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| PANNORAMIC MIDI II 全景扫描仪 | 3DHISTECH | -- | |
| FinePointe肺功能检测系统 | DSI Buxco | -- | |
| Bio-Rad实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| 试剂 | Fast SybrGreen PCR预混液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ProLong Gold防淬灭封片剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| MAXblock封闭液 | Beyotime | -- | |
| ECL Western印迹底物 | Bio-Rad | -- | |
| X射线感光胶片 | Fujifilm | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、年龄;香烟烟雾暴露的TPM浓度、频率和时长;弹性蛋白酶剂量和给药途径 阅读提示:STAR Methods - Mice models and treatment |
| CD36敲除 | AAV6.2FF-Cre的剂量(1×10^11 vg/小鼠)和给药时间点(预防或治疗);验证敲除效率 阅读提示:STAR Methods - Mice models and treatment;结果部分Figure 3 |
| 药物处理 | atglistatin剂量(200 μmol/kg)、给药频率和时长;CD36抗体和SAB的剂量、给药方案 阅读提示:STAR Methods - Mice models and treatment |
| 检测指标 | BALF细胞计数、肺顺应性、组织学染色(H&E, Masson)、MLI、AT2类器官形成能力 阅读提示:STAR Methods - 相关检测部分;Figure legends |
| 分子机制检测 | ZBP1、p-MLKL、AXIN2、β-catenin的蛋白表达;ZBP1-RIPK3相互作用;Z-DNA形成 阅读提示:STAR Methods - Immunoprecipitation and immunoblotting;Immunofluorescence |