验证MGST3表达与AD的相关性
探究在AD模型和细胞模型中MGST3的表达变化。
通过Western blot检测APP/PS1小鼠海马和SY5Y-APP细胞中MGST3蛋白水平,与野生型小鼠和SH-SY5Y细胞比较。
MGST3 regulates BACE1 protein translation and amyloidogenesis by controlling the RGS4-mediated AKT signaling pathway.
包含细胞模型、动物模型和患者样本等多个证据层级,并通过Western blot、免疫荧光、ELISA、RNA-seq等功能验证和机制验证。
SH-SY5Y细胞 HEK-293细胞 SY5Y-APP细胞 APP/PS1小鼠
MGST3敲低使用siRNA,转染48小时 RGS4敲低使用siRNA,转染48小时 4EGI-1(25 μM)和LY294002(10 μM)处理24小时 BAY u9773(1 μM)处理24小时 BACE1蛋白和mRNA水平检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究在AD模型和细胞模型中MGST3的表达变化。
通过Western blot检测APP/PS1小鼠海马和SY5Y-APP细胞中MGST3蛋白水平,与野生型小鼠和SH-SY5Y细胞比较。
确定MGST3敲低是否影响BACE1、APP以及淀粉样蛋白生成。
在SH-SY5Y、HEK-293和SY5Y-APP细胞中转染siMGST3,通过Western blot检测APP、BACE1、ADAM10、CTFs和Aβ42水平。
探究MGST3敲低是否影响ROS和凋亡。
使用ROS检测试剂盒和CCK-8检测细胞活力和ROS水平,Western blot检测凋亡相关蛋白。
检验MGST3调控BACE1是否通过CysLTs或蛋白降解,以及是否涉及翻译机制。
使用CysLT受体拮抗剂BAY u9773、溶酶体抑制剂Baf A1和翻译抑制剂4EGI-1处理细胞,检测BACE1蛋白和mRNA水平。
寻找MGST3调控BACE1的潜在下游基因。
在SH-SY5Y细胞中敲低MGST3后进行RNA-seq分析,筛选差异表达基因,并通过KOG分析和STRING数据库进行功能分析。
确定RGS4是否调节BACE1表达及淀粉样变。
通过Western blot和免疫荧光检测RGS4敲低对BACE1、CTFs和Aβ42的影响,并检查RGS4在AD模型中的表达。
探究RGS4是否是MGST3调控BACE1的关键中介。
通过共转染siMGST3和siRGS4,或使用RGS4抑制剂CCG50014,检测BACE1蛋白水平。
确定AKT是否介导MGST3和RGS4对BACE1的调控。
使用PI3K抑制剂LY294002处理细胞,检测p-AKT和BACE1蛋白水平,以及Aβ42水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | -- |
| F-12营养培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| G418 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| Opti-MEM减血清培养基 | Invitrogen | -- | |
| 药物处理 | 4EGI-1 | MedChemExpress | -- |
| BAY u9773 | MedChemExpress | -- | |
| 巴弗洛霉素A1 | MedChemExpress | -- | |
| CCG-50014 | MedChemExpress | -- | |
| LY294002 | MedChemExpress | -- | |
| 蛋白检测 | MGST3抗体 | Abcam | ab192254 |
| ADAM10抗体 | Abcam | ab1997 | |
| BACE1抗体 | Abcam | ab2077 | |
| LC3B抗体 | Abcam | ab48394 | |
| MGST3抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-97969 | |
| APP/CTFs抗体 | Sigma-Aldrich | A8717 | |
| Caspase 3抗体 | Proteintech | 19677-1-AP | |
| BAX抗体 | Proteintech | 50599-2-Ig | |
| Bcl-2抗体 | Proteintech | 12789-1-AP | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60003-2-Ig | |
| 磷酸化AKT (Ser473)抗体 | Proteintech | 66444-1-Ig | |
| AKT抗体 | Proteintech | 10176-2-AP | |
| Caspase 8抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-56070 | |
| RGS4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-398348 | |
| Caspase 12抗体 | ZEN-BIOSCIENCE | 160136 | |
| 蛋白裂解 | 蛋白酶抑制剂 | Beyotime | WB-0181 |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Beyotime | P1081 | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0011 |
| Western blot | SDS-PAGE凝胶 | EpiZyme | PG111 |
| Tris-tricine凝胶 | Solarbio | P1320 | |
| 电化学发光试剂 | Beyotime | P0018M | |
| Fusion FX5成像分析系统 | Vilber Lourmat | -- | |
| Quantity One软件 | Bio-Rad | -- | |
| ELISA | Aβ42 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H0543 |
| 流式分析 | 活性氧检测试剂盒 | Beyotime | S0033S |
| 碘化丙啶 | Beyotime | ST511 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | MedChemExpress | -- |
| Spectra Max 340 PC酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| RNA提取 | 总RNA提取试剂盒 | Sangon | B511311 |
| RT-qPCR | 5 × HiScript II Select qRT Super Mix II | Vazyme | R233-01 |
| AceQ qPCR SYBR Green Master Mix | Vazyme | Q111-02 | |
| 免疫荧光 | IFKine绿色驴抗山羊IgG (H+L) | Abbkine | A24231 |
| IFKine红色驴抗兔IgG (H+L) | Abbkine | A24421 | |
| DAPI Fluoromount-G封片剂 | Southern Biotech | 0100-20 | |
| 共聚焦显微镜(Leica TCS SP8 X) | Leica | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 9.3.0 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 基因敲低 | siRNA序列、转染试剂、转染时间 阅读提示:见Materials and Methods中的siRNA transfection部分 |
| 药物处理 | 抑制剂浓度和作用时间 阅读提示:见图注和Materials and Methods中的Cell culture and chemicals部分 |
| 蛋白检测 | 抗体稀释比例、封闭条件、曝光时间 阅读提示:见Materials and Methods中的Western blotting和Antibodies部分 |
| RNA测序 | RNA提取方法、文库构建试剂盒、测序平台、差异表达基因筛选标准 阅读提示:见Materials and Methods中的RNA-seq assay部分 |
| 细胞活力检测 | 细胞接种密度、siRNA处理时间、CCK-8孵育时间 阅读提示:见Materials and Methods中的Cell viability assay部分 |