HOXB2通过上调长链非编码RNA DANCR促进卵巢癌顺铂耐药

HOXB2 promotes cisplatin resistance by upregulating lncRNA DANCR in ovarian cancer.

作者信息Xiao Li, Zhen Zheng, Wanzhen Zhou, Huixian Huang, Yang Zhou, Qinyang Xu, Xiaolu Zhu, Yincheng Teng
PMID38851728
发布时间2024-06-08
DOI10.1186/s13048-024-01424-1

实验完整度

包含临床样本分析、体外细胞实验、体内动物模型及机制验证,功能验证与机制研究均具备。

主要模型

A2780/DDP细胞(顺铂耐药卵巢癌细胞系) OVCAR8(OV8)细胞系 皮下异种移植瘤模型(BALB/c裸鼠) 卵巢癌患者组织样本

重点核对

HOXB2在TCGA和GTEx数据库中的表达差异 细胞系A2780/DDP和OV8的HOXB2表达水平 shRNA敲低HOXB2的序列和转染方法 顺铂处理浓度和时间(IC50测定、凋亡测定) 小鼠模型中顺铂给药剂量(5 mg/kg)和频率

摘要

卵巢癌是一种高度致命的恶性疾病,通常在晚期才表现出来。药物耐药,尤其是铂类耐药,是治疗失败的主要原因,因为一线全身化疗主要依赖于铂类方案。通过分析癌症基因组图谱数据库、基因型-组织表达数据库和基因表达综合数据集中的基因表达水平,我们发现HOXB2在卵巢癌中高表达,并与不良预后和顺铂耐药相关。进行了免疫组织化学和HOXB2的功能缺失实验,以探讨其在卵巢癌中的作用。我们观察到抑制HOXB2可以在体内和体外损害卵巢癌的生长和顺铂耐药。基于RNA-Seq的机制研究和实验验证显示,HOXB2调节ATP结合盒转运蛋白成员和ERK信号通路。我们进一步证明,HOXB2调节长链非编码RNA DANCR(一种分化拮抗非蛋白编码RNA)的表达,从而影响其下游效应因子ABCA1、ABCG1和ERK信号传导,以增强药物耐药和癌症增殖。这些结果证实,HOXB2的高表达与卵巢癌的铂类耐药和不良预后相关。因此,靶向HOXB2可能是卵巢癌治疗的一个有前景的策略。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
HOXB2在卵巢癌中的表达及其对顺铂耐药和细胞增殖的影响和机制是什么?
核心机制
HOXB2通过上调lncRNA DANCR,进而调节下游效应因子ABCA1、ABCG1和ERK信号通路,增强卵巢癌细胞的顺铂耐药和增殖。
主要证据
临床样本和数据库分析显示HOXB2高表达与不良预后和顺铂耐药相关;体外实验表明敲低HOXB2降低细胞增殖和IC50,增加凋亡;体内异种移植实验证实敲低HOXB2抑制肿瘤生长并增加顺铂敏感性;RNA-Seq和Western blot验证了ABC转运蛋白和ERK通路的变化,以及DANCR的调控作用。
研究意义
研究首次证明HOXB2在卵巢癌中上调并与铂类耐药相关,提示HOXB2可能作为卵巢癌治疗的潜在靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

临床样本和数据库分析

评估HOXB2在卵巢癌组织中的表达及其与预后和顺铂耐药的相关性。

分析TCGA、GTEx和GEO数据集,进行差异表达和生存分析;使用组织微阵列和临床样本进行IHC验证。

2

体外细胞功能实验

验证HOXB2对卵巢癌细胞增殖和顺铂耐药的影响。

在A2780/DDP和OV8细胞中敲低HOXB2,通过CCK-8、克隆形成、EdU、流式凋亡和DNA损伤检测评估细胞增殖和耐药性。

3

体内动物实验

评估敲低HOXB2对体内肿瘤生长和顺铂敏感性的影响。

将shNC或shHOXB2 A2780/DDP细胞皮下植入裸鼠,然后分为PBS和CDDP组,测量肿瘤体积和重量,并进行组织学分析。

4

机制探索

探究HOXB2调控顺铂耐药和增殖的分子机制。

通过RNA-Seq和GSEA分析差异表达基因,验证ABC转运蛋白和ERK通路,并检测DANCR的表达和功能。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
杜氏改良Eagle培养基----
胎牛血清----
青霉素/链霉素----
顺铂MCEHY-17,394
jetPRIME转染试剂Polyplus--
CCK-8试剂盒BimakeB34304
15 µ 8孔培养板Ibidi80,826
抗γH2A.X抗体ServicebioGB111841
DAPI----
EdU掺入检测试剂盒AbbkineKTA2030
Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒ElabscienceE-CK-A211
RIPA裂解液ServicebioG2033
BCA蛋白定量试剂盒Thermo Fisher23,227
抗HOXB2抗体AbwaysAY2582
抗β-肌动蛋白抗体AbwaysAB0035
抗β-微管蛋白抗体Proteintech10086-1-AP
抗Chk2抗体AbwaysCY5633
抗磷酸化Chk2 (Thr68)抗体Abways--
抗Chk1抗体Cell Signaling Technology2360
抗磷酸化Chk1 (Ser345)抗体Cell Signaling Technology2348
抗ABCA1抗体Abcamab66217
抗ABCG1抗体Proteintech13578-1-AP
抗磷酸化Erk1/2 (Thr202/Tyr204)抗体Cell Signaling Technology4370
抗Erk1/2抗体Cell Signaling Technology4695
HRP底物MerckWBKLS0500
Bio-Rad成像系统Bio-Rad--
RNA TRIzol试剂Takara9108
PrimeScript逆转录试剂盒TakaraRR037A
SYBR Master MixBimakeB21703
7500实时荧光定量PCR仪Applied Biosystems--
抗Ki67抗体ServicebioGB111141
TUNEL试剂盒ServicebioGB1507-50T

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
临床样本分析
组织微阵列样本数(117例)、患者化疗史、批次和抗体
阅读提示:Materials and methods 中的 Clinical samples 和 Figure 1D-E 图注
细胞培养和转染
细胞系、培养基、血清浓度、敲低序列、转染试剂、嘌呤霉素筛选剂量和时间
阅读提示:Materials and methods 中的 Cell culture 和 Cell transfection
药物处理
顺铂浓度、处理时间
阅读提示:Materials and methods 中的 Cell culture 和具体实验部分
体外功能实验
细胞接种密度、处理时间、试剂盒型号
阅读提示:Materials and methods 中的 CCK-8、克隆形成、EdU、凋亡实验
体内动物实验
细胞种植数量、小鼠周龄和性别、顺铂给药剂量和周期、肿瘤测量方法
阅读提示:Materials and methods 中的 Mouse xenograft models 和 Figure 4