动物感染模型建立
观察多杀性巴氏杆菌感染对肺和全身的影响
通过鼻内感染小鼠和兔,观察肺损伤、细菌载量、生存率和肺通透性。
Pasteurella multocida activates apoptosis via the FAK-AKT-FOXO1 axis to cause pulmonary integrity loss, bacteremia, and eventually a cytokine storm.
包含体外细胞实验(TC-1)、体内小鼠和兔模型、RNA-seq、功能验证(凋亡抑制剂、shRNA敲低)及机制验证(FAK-AKT-FOXO1通路)等多层级证据。
TC-1小鼠肺上皮细胞 CD-1(ICR)小鼠模型 新西兰兔模型
感染剂量:小鼠104 CFU PmCQ2,兔108 CFU PmCQ2 凋亡抑制剂Ac-DEVD-CHO给药剂量:3 mg/kg IL-6中和抗体给药剂量:10 μg/只 Evans blue注射剂量:30 mg/kg
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
观察多杀性巴氏杆菌感染对肺和全身的影响
通过鼻内感染小鼠和兔,观察肺损伤、细菌载量、生存率和肺通透性。
验证菌血症在发病机制中的作用及是否导致细胞因子风暴
检测血液和器官细菌载量,评估肝肾功能、组织损伤和细胞因子水平,并使用IL-6中和抗体干预。
确定凋亡是否导致肺上皮完整性丧失
通过RNA-seq、Western blot、TUNEL染色和Transwell实验验证凋亡与肺通透性的关系。
验证抑制凋亡是否能减轻感染
给予小鼠凋亡抑制剂Ac-DEVD-CHO,观察肺损伤、细菌载量、细胞因子水平和生存率。
阐明多杀性巴氏杆菌诱导凋亡的分子机制
通过RNA-seq、qPCR、Western blot、免疫组化和shRNA敲低验证FAK-AKT-FOXO1通路的作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | 马丁肉汤琼脂 | -- | -- |
| 动物实验 | 伊文思蓝 | Solarbio | IE0280 |
| 抗小鼠IL-6体内抗体 | Selleck | A2118 | |
| 大鼠IgG1同型对照体内抗体 | Selleck | A2119 | |
| Ac-DEVD-CHO | CSNpharm | CSN23216 | |
| 组织学检查 | 马森三色染色试剂盒 | Baso | -- |
| 免疫组织化学 | 抗p-AKT抗体 | Proteintech | 66444-1-Ig |
| 抗ITGAV抗体 | HUABIO | ET1610-15 | |
| HRP标记二抗 | Zsbio | PV-6000 | |
| DAB显色试剂盒 | Zsbio | ZLI-9018 | |
| 免疫荧光 | 抗SPC抗体 | Proteintech | 10774-1-AP |
| 抗NGAL抗体 | ABclonal | A2092 | |
| Cy3标记二抗 | ABclonal | AS007 | |
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | HyClone | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡试剂盒 | Elabscience | E-CK-A211 |
| 细胞功能实验 | Transwell小室 | Corning | 3422 |
| 凋亡检测 | 一步法TUNEL原位凋亡试剂盒 | Elabscience | E-CK-A320 |
| RNA提取与反转录 | AFTSpin动物组织/细胞快速RNA提取试剂盒 | ABclonal | RK30120 |
| ABScript III RT预混液(含gDNA去除剂) | ABclonal | RK20429 | |
| RT-qPCR | Bio-Rad CFX96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | -- | -- |
| Ribo-Zero rRNA去除试剂盒 | Illumina | MRZH116 | |
| 安捷伦2100生物分析仪 | Agilent | -- | |
| Illumina HiSeq 4000测序平台 | Illumina | -- | |
| 细胞转染 | Lipo3000转染试剂 | Thermo Fisher | L3000008 |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | -- | -- | |
| 二硫苏糖醇 | -- | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 抗Cleaved Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | #9664 | |
| 抗Caspase 7抗体 | Proteintech | 27155-1-AP | |
| 抗p-mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | #5536 | |
| 抗mTOR抗体 | Abways | CY5306 | |
| 抗p-AKT抗体 | Cell Signaling Technology | #4060 | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | #9272 | |
| 抗p-FAK抗体 | Cell Signaling Technology | #3283 | |
| 抗FAK抗体 | HUABIO | ET1602-25 | |
| 抗FOXO1抗体 | Cell Signaling Technology | #2880 | |
| 抗p-FOXO1抗体 | Cell Signaling Technology | #2599 | |
| 抗BAX抗体 | Cell Signaling Technology | #2772 | |
| 抗ACTIN抗体 | Proteintech | 81115-1-RR | |
| 抗GAPDH抗体 | ABclonal | AC033 | |
| HRP标记二抗 | Boster Bio | BA1054, BA1050, BA1060 | |
| 增强化学发光试剂盒 | Bio-Rad | #170-5060 | |
| ELISA | 小鼠ELISA试剂盒(含板) | Invitrogen | 88-7064-86 (IL-6), 88-7013-22 (IL-1β), 88-7346-88 (TNF-α) |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细菌培养 | PmCQ2和PmCQ6菌株、培养条件(Martin’s broth agar, 5% horse serum, 37°C) 阅读提示:Materials and methods - Bacterial strains and culture conditions |
| 动物感染 | 小鼠品系、周龄、体重、感染剂量、给药途径、麻醉方法 阅读提示:Materials and methods - Animal experiment; Figure 1 legends |
| 肺通透性检测 | Evans blue剂量、注射途径、检测时间、OD620测量 阅读提示:Materials and methods - Animal experiment; Figure 1F-H |
| 凋亡相关实验 | Ac-DEVD-CHO浓度、处理时间、TUNEL和Annexin V-PI实验条件 阅读提示:Materials and methods - Cell treatment, In situ apoptosis staining; Figure 3F, 4A-D |
| 机制验证 | shRNA序列、转染方法、Western blot抗体及稀释度 阅读提示:Materials and methods - Cell transfection, Western blotting; Figure 5H-I |
| 细胞因子检测 | ELISA试剂盒型号、样本处理、检测时间点 阅读提示:Materials and methods - Enzyme-linked immunosorbent assay; Figure 2H-I |