建立饮食诱导的HCC小鼠模型
通过对照饮食或胆碱缺乏饮食喂食小鼠,诱导NAFLD和HCC。
从2月龄开始,雄性和雌性WT、Ripk3−/−和Mlkl−/−小鼠分别喂食NC、CD-LFD或CD-HFD,持续6个月。
Absence of Either Ripk3 or Mlkl Reduces Incidence of Hepatocellular Carcinoma Independent of Liver Fibrosis.
包含动物模型(Ripk3−/−、Mlkl−/−小鼠)、多种检测方法(Western blot、qRT-PCR、流式、IHC、RNA-seq)及功能验证(肿瘤结节计数)和机制验证(信号通路分析)。
野生型(WT)小鼠 Ripk3−/−小鼠 Mlkl−/−小鼠
小鼠性别:雄性 vs 雌性 饮食类型:对照饮食(NC)、胆碱缺乏低脂饮食(CD-LFD)、胆碱缺乏高脂饮食(CD-HFD) 喂食周期:6个月 基因型:WT、Ripk3−/−、Mlkl−/− 肿瘤评估:肝脏结节数目和大小
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
通过对照饮食或胆碱缺乏饮食喂食小鼠,诱导NAFLD和HCC。
从2月龄开始,雄性和雌性WT、Ripk3−/−和Mlkl−/−小鼠分别喂食NC、CD-LFD或CD-HFD,持续6个月。
验证CD-HFD是否诱导肝脏坏死性凋亡。
通过Western blot检测MLKL寡聚体、MLKL、RIPK3、p-MLKL、p-RIPK3,通过IHC检测p-MLKL,ELISA检测血浆HMGB1。
判断敲除Ripk3或Mlkl是否影响HCC的发生。
观察肝脏结节数目和大小,IHC检测Glypican-3和Ki-67,ELISA检测血清AFP。
检测坏死性凋亡对肝脏炎症的影响。
通过qRT-PCR检测促炎细胞因子(IL6、TNFα、IL1β、CCL2),ELISA检测血浆IL6、TNFα、CCL2,流式分析F4/80+巨噬细胞和CCR2+单核细胞。
检测坏死性凋亡是否影响肝纤维化。
通过PSR染色、羟脯氨酸(OHP)含量、qRT-PCR检测Col3α1、Acta2、Col1α1、TGFβ,Western blot检测desmin和α-SMA。
探索坏死性凋亡影响HCC的机制。
通过Western blot检测JNK、β-catenin、cyclin D1、PD-L1的磷酸化或表达水平,qRT-PCR检测c-Myc、EpCAM、PD-L1、PD-1。
揭示坏死性凋亡对肝脏转录组的影响。
对雄性小鼠肝脏进行RNA-seq,分析差异表达基因和通路,并通过qRT-PCR验证部分基因表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物饮食 | 胆碱缺乏高脂饮食(A06071302i) | Research Diets | A06071302i |
| 胆碱缺乏低脂饮食(A06071324i) | Research Diets | A06071324i | |
| 正常对照饮食(5053 Pico Lab) | Purina Mills | -- | |
| Western blot | MLKL抗体(#MABC604) | Millipore Sigma | MABC604 |
| α-SMA抗体(#A5228) | Millipore Sigma | A5228 | |
| RIPK3抗体(#NBP1-77299) | Novus Biologicals | NBP1-77299 | |
| β-微管蛋白抗体(#T5201) | Sigma-Aldrich | T5201 | |
| Desmin抗体(#PA5-16705) | Invitrogen | PA5-16705 | |
| p-SAPK/JNK抗体(#4668P) | Cell Signaling Technology | 4668P | |
| SAPK/JNK抗体(#9252) | Cell Signaling Technology | 9252 | |
| p-p38 MAPK抗体(#9211S) | Cell Signaling Technology | 9211S | |
| p38 MAPK抗体(#9212) | Cell Signaling Technology | 9212 | |
| p-p44/42 MAPK抗体(#9101S) | Cell Signaling Technology | 9101S | |
| p44/42 MAPK抗体(#4695S) | Cell Signaling Technology | 4695S | |
| β-连环蛋白抗体(#8480) | Cell Signaling Technology | 8480 | |
| 细胞周期蛋白D1抗体(#2978) | Cell Signaling Technology | 2978 | |
| p-AKT抗体(#4056) | Cell Signaling Technology | 4056 | |
| AKT2抗体(#3063S) | Cell Signaling Technology | 3063S | |
| p-S6核糖体蛋白抗体(#4857) | Cell Signaling Technology | 4857 | |
| S6核糖体蛋白抗体(#2217) | Cell Signaling Technology | 2217 | |
| Cleaved caspase-3抗体(#9664) | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| Caspase-3抗体(#9662) | Cell Signaling Technology | 9662 | |
| p62抗体(#MAB8028-SP) | R&D Systems | MAB8028-SP | |
| PD-L1抗体(#AF1019) | R&D Systems | AF1019 | |
| qRT-PCR | RNeasy试剂盒(#74106) | Qiagen | 74106 |
| High capacity cDNA逆转录试剂盒(#4368813) | Thermo Fisher Scientific | 4368813 | |
| Power SYBR Green PCR Master Mix(#4368708) | Thermo Fisher Scientific | 4368708 | |
| 流式细胞术 | Liberase(#05401127001) | Sigma-Aldrich | 05401127001 |
| OptiPrep密度梯度介质(#AXS-1114542) | Cosmo Bio USA | AXS-1114542 | |
| Live/Dead可固定紫色死细胞染料(#L34955) | Thermo Fisher Scientific | L34955 | |
| CD16/32抗体(#101302) | BioLegend | 101302 | |
| CD45-APC/Cy7抗体(#103116) | BioLegend | 103116 | |
| CD11b-PE/Cy7抗体(#101216) | BioLegend | 101216 | |
| Ly6C-APC抗体(#128016) | BioLegend | 128016 | |
| F4/80-PE抗体(#157304) | BioLegend | 157304 | |
| CCR2-BV605抗体(#150615) | BioLegend | 150615 | |
| 免疫组织化学 | Glypican 3抗体(#MA5-17083) | Thermo Fisher Scientific | MA5-17083 |
| Ki-67抗体(#ab15580) | Abcam | ab15580 | |
| Cleaved Caspase-3抗体(Cell Signaling Technology) | Cell Signaling Technology | -- | |
| 磷酸化MLKL抗体(#ab196436) | Abcam | ab196436 | |
| 磷酸化RIPK3抗体(#ab205421) | Abcam | ab205421 | |
| TUNEL染色 | DeadEnd比色TUNEL系统(#G7130) | Promega | G7130 |
| ELISA | TNFα小鼠高灵敏度ELISA试剂盒(#BMS607-3) | Thermo Fisher Scientific | BMS607-3 |
| IL6小鼠高灵敏度ELISA试剂盒(#BMS603HS) | Thermo Fisher Scientific | BMS603HS | |
| 小鼠CCL2/JE/MCP-1定量ELISA试剂盒(#MJE00B) | R&D Systems | MJE00B | |
| 小鼠甲胎蛋白(AFP)定量ELISA试剂盒(#MAFP00) | R&D Systems | MAFP00 | |
| 小鼠HMGB1 ELISA试剂盒(#E-EL-M0676) | Elabscience | E-EL-M0676 | |
| 生化检测 | ALT比色活性测定试剂盒(#700260) | Cayman Chemical Company | 700260 |
| RNA测序 | NEBNext Ultra II定向RNA文库制备试剂盒(Illumina) | New England Biolabs | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、基因型(WT、Ripk3−/−、Mlkl−/−)和性别 阅读提示:Materials and Methods: Animals and diet feeding |
| 饮食诱导 | 饮食类型(NC、CD-LFD、CD-HFD)、脂肪比例、喂养周期(6个月) 阅读提示:Materials and Methods: Animals and diet feeding |
| 肿瘤评估 | 肝脏结节计数、分类标准(小于1mm、2-4mm、大于5mm)、肿瘤标志物(Glypican-3、Ki-67、AFP) 阅读提示:Results: Deleting either Ripk3 or Mlkl significantly reduced HCC development; Figure 5 |
| 炎症检测 | 炎症细胞因子(IL6、TNFα、IL1β、CCL2)的转录水平和循环水平、巨噬细胞(F4/80)和单核细胞(CCR2)的比例 阅读提示:Results: Deleting Ripk3 or Mlkl reduced CD-HFD–induced inflammation in male mice; Figures 2 and 3 |
| 纤维化评估 | PSR染色、羟脯氨酸含量、胶原相关基因(Col3α1、Acta2、Col1α1)、TGFβ水平 阅读提示:Results: Blocking necroptosis did not alter CD-HFD–induced liver fibrosis; Figure 4 |
| 信号通路分析 | JNK、β-catenin、PD-L1/PD-1、c-Myc、EpCAM等蛋白表达或磷酸化水平 阅读提示:Results: Oncogenic pathways induced by CD-HFD is attenuated when necroptosis is blocked; Figure 7 |
| 转录组分析 | RNA-seq数据(GSE200923)、差异表达基因、通路分析 阅读提示:Materials and Methods: RNA sequencing and data processing; Results: Gene expression modulation in response to CD-LFD or CD-HFD |