评估Tim-AIII对NSCLC细胞增殖、迁移和周期的影响
确定Tim-AIII对NSCLC细胞的毒性作用和抗增殖作用。
使用CCK-8和LDH法检测细胞活力,划痕实验和Transwell实验检测迁移,流式细胞术检测细胞周期,RT-PCR和WB检测EMT相关标志物。
Timosaponin AIII promotes non-small-cell lung cancer ferroptosis through targeting and facilitating HSP90 mediated GPX4 ubiquitination and degradation.
包含体外细胞实验(增殖、迁移、周期、铁死亡指标)、SPR结合实验、Co-IP和泛素化分析、HSP90敲低验证及两种小鼠皮下和肺转移模型,功能与机制验证充分。
NSCLC细胞系H1299、A549、SPC-A1、LLC 人支气管上皮HBE细胞 C57BL/6J小鼠皮下LLC移植瘤模型 BALB/c-nu/nu裸鼠皮下H1299移植瘤模型
Tim-AIII处理浓度4 μM,作用48小时诱导铁死亡 HSP90-shRNA敲低HSP90后验证Tim-AIII效应是否消失 HSP90抑制剂tanespimycin对Tim-AIII效应的阻断 体内模型中Tim-AIII剂量为12.5 mg/kg和50 mg/kg,隔天腹腔注射 GPX4降解实验中CHX浓度25 mg/mL
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Tim-AIII对NSCLC细胞的毒性作用和抗增殖作用。
使用CCK-8和LDH法检测细胞活力,划痕实验和Transwell实验检测迁移,流式细胞术检测细胞周期,RT-PCR和WB检测EMT相关标志物。
证明Tim-AIII诱导的细胞死亡主要由铁死亡介导。
使用各类细胞死亡抑制剂(Z-VAD-FMK、CQ、Nec-1、Fer-1)共处理,检测脂质ROS、铁、MDA、GSH水平,透射电镜观察线粒体形态,流式检测线粒体膜电位。
确定HSP90为Tim-AIII的直接结合靶点并验证关键氨基酸位点。
通过SwissTargetPrediction预测,SPR实验测定结合动力学,对突变HSP90进行SPR分析。
阐明Tim-AIII-HSP90复合物对GPX4的调控机制。
检测Tim-AIII处理下GPX4蛋白水平,免疫共沉淀评估HSP90-GPX4相互作用,泛素化实验检测GPX4泛素化水平,体外降解实验观察GPX4降解,CHX追踪实验评估GPX4稳定性。
通过基因敲低验证Tim-AIII效应的HSP90依赖性。
用慢病毒转染HSP90-shRNA敲低HSP90,检测Tim-AIII诱导的细胞活力、LDH释放、铁积累、MDA和GSH变化,以及GPX4泛素化水平。
评估Tim-AIII在体内对肿瘤生长的抑制作用并初步评估安全性。
建立皮下异种移植模型和肺转移模型,给予不同剂量Tim-AIII,监测肿瘤体积、体重、组织学毒性、肝脏和肾脏生化指标,以及肿瘤免疫微环境中Treg细胞比例。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 知母皂苷AIII | Chengdu Herbpurify Co., LTD | Z-019 |
| 溶剂 | 二甲基亚砜 | MP Biomedicals | 196055 |
| Western blot | 抗GPX4抗体(小鼠) | Proteintech | 67763-1-Ig |
| 抗HSP90抗体(兔) | Proteintech | 13171-1-AP | |
| E-钙粘蛋白抗体 | Proteintech | 20874-1-AP | |
| 波形蛋白抗体 | Proteintech | 10366-1-AP | |
| Snail-1抗体 | Proteintech | 13099-1-AP | |
| Snail-2抗体 | Proteintech | 12129-1-AP | |
| N-钙粘蛋白抗体 | Proteintech | 22018-1-AP | |
| HRP标记的抗兔IgG重链抗体 | Proteintech | SA00001-7H | |
| 抗GPX4抗体(兔) | ABclonal | A1933 | |
| 铁蛋白轻链抗体 | ABclonal | A11241 | |
| 血红素加氧酶1抗体 | ABclonal | A1346 | |
| SLC40A1抗体 | ABclonal | A14885 | |
| SLC7A11抗体 | ABclonal | A13685 | |
| 泛素抗体 | ABclonal | A19686 | |
| β-肌动蛋白抗体 | ABclonal | AC004 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Beyotime | -- | |
| HRP标记的山羊抗小鼠二抗 | Beyotime | -- | |
| 细胞死亡抑制剂 | 氯喹 | Med Chem Express | HY-17589A |
| Z-VAD-FMK | Med Chem Express | HY-16658B | |
| 坏死他汀-1 | Med Chem Express | HY-15760 | |
| 铁死亡抑制剂 | Ferrostatin-1 | Med Chem Express | HY-100579 |
| ROS抑制剂 | N-乙酰半胱氨酸 | Med Chem Express | HY-B0215 |
| HSP90抑制剂 | 坦螺旋霉素 | Med Chem Express | HY-10211 |
| 抗氧化剂 | Trolox | Med Chem Express | HY-101445 |
| 蛋白酶体抑制剂 | MG-132 | Med Chem Express | HY-13259 |
| SPR分析 | 重组人HSP90 α蛋白 | Abcam | ab48801 |
| 体外降解实验 | 重组人GPX4蛋白 | Fine Biotech | P0633 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| DME/F-12培养基 | Hyclone | -- | |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | GlpBio | GK10001 |
| 细胞毒性检测 | LDH细胞毒性检测试剂盒 | Beyotime | C0017 |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | Servicrbio | G1014 |
| 细胞周期分析 | PI细胞周期染色试剂盒 | Multi Sciences | 70-CCS012 |
| 迁移实验 | 24孔细胞培养小室(8μm孔径) | Corning | -- |
| 脂质ROS检测 | BODIPY™ 581/591 C11 | Invitrogen | D3861 |
| 铁检测 | 铁比色检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K880-M |
| MDA检测 | MDA检测试剂盒(TBA法) | Jiancheng | A003-1-2 |
| GSH检测 | GSH检测试剂盒 | Jiancheng | A006-2-1 |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1荧光探针 | Beyotime | C2005 |
| 蛋白纯化 | BeyoGold™ His标签纯化树脂 | Beyotime Biotechnology | P2233 |
| 蛋白表达 | 异丙基β-D-硫代半乳糖苷 | -- | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Servicebio | G2002 |
| RNA提取 | RNAiso plus | TaKaRa | 9109 |
| RT-qPCR | HiScript III RT SuperMix | Vazyme | R323-01 |
| AceQ qPCR SYBR Green MasterMix | Vazyme | Q111-02/03 | |
| 免疫共沉淀 | IP裂解液 | Beyotime | P0013J |
| Protein A/G Sepharose 琼脂糖珠 | Beyotime | P2179 | |
| 慢病毒转染 | pLenti-GV112嘌呤霉素慢病毒载体 | GeneChem | -- |
| 血生化检测 | ALT检测试剂盒 | Jiancheng | C009-2-1 |
| AST检测试剂盒 | Jiancheng | C010-2-1 | |
| 尿素检测试剂盒 | Jiancheng | C013-2-1 | |
| 肌酐检测试剂盒 | Jiancheng | C011-2-1 | |
| 流式细胞术 | 佛波酯 | Santa Cruz Biotechnology | sc-3576 |
| 离子霉素 | ALEXIS Biochemicals | ALX-450-007 | |
| 布雷菲德菌素A | BioLegend | 423303 | |
| 细胞内染色试剂盒 | BD Biosciences | 554714 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活力与细胞毒性检测 | 细胞系(H1299、A549、SPC-A1、LLC),Tim-AIII浓度和处理时间(4 μM、48小时导致90%死亡),HBE细胞毒性 阅读提示:Methods中'Analysis of Cell Proliferation and cytotoxicity'以及Figure 1 |
| 细胞周期分析 | PI染色试剂盒,流式细胞仪型号,染色步骤,Tim-AIII浓度处理时间 阅读提示:Methods中'Analysis of the cell cycle' |
| 铁死亡相关指标检测 | 脂质ROS检测(BODIPY 581/591 C11浓度、孵育时间),铁检测试剂盒,MDA和GSH检测试剂盒,处理时间 阅读提示:Methods中'Measurement of lipid ROS'、'Measurement of irons'、'MDA assay'、'GSH assay' |
| SPR结合实验 | SPR仪器(Open SPRTM),芯片类型(COOH),Tim-AIII浓度,HSP90蛋白浓度,结合和解离时间,Kd值计算 阅读提示:Methods中'Surface Plasmonic Resonance (SPR) Assay'以及Figure 4 |
| HSP90敲低实验 | shRNA序列,慢病毒转染步骤,转染效率验证,Tim-AIII处理浓度和时间 阅读提示:Methods中'Generation of stable cell lines'及Figure 6 |
| 体内动物实验 | 动物品系、性别、周龄,细胞注射数量和部位,Tim-AIII给药剂量(12.5 mg/kg和50 mg/kg)和频率,治疗时长,伦理批准号 阅读提示:Methods中'In vivo tumor model'及Figure 7 |