检测PP2Acα在纤维化肾脏巨噬细胞中的表达
探究PP2Acα是否在纤维化肾脏巨噬细胞中上调。
对小鼠UUO/IRI模型和人肾活检样本进行Western blot、qRT-PCR、免疫荧光染色,检测PP2Acα在巨噬细胞中的表达,并用CD115微珠分选肾巨噬细胞验证。
PP2Acα promotes macrophage accumulation and activation to exacerbate tubular cell death and kidney fibrosis through activating Rap1 and TNFα production.
包含体外细胞实验(BMDMs迁移、共培养)、体内动物模型(UUO/IRI、诱导性敲除、药理抑制)、人类肾活检样本分析及多层面机制验证(Rap1活性、Stat6磷酸化、TNFα)。
BMDM 小鼠UUO模型 小鼠IRI模型 人肾活检样本
巨噬细胞PP2Acα诱导性敲除(Csf1r-Cre; PP2Acαfl/fl小鼠,他莫昔芬诱导) UUO和IRI手术模型及时间点(UUO后10天,IRI后21天) BMDMs中PP2Acα缺失抑制迁移及机制(Rap1活性、Itgb2),过表达Rap1bV12恢复迁移 共培养体系:LPS刺激巨噬细胞的条件培养基处理原代肾小管细胞,PI染色检测细胞死亡 TNFα信号阻断(TNFα siRNA、R-7050)和Stat6抑制(AS1517499)实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究PP2Acα是否在纤维化肾脏巨噬细胞中上调。
对小鼠UUO/IRI模型和人肾活检样本进行Western blot、qRT-PCR、免疫荧光染色,检测PP2Acα在巨噬细胞中的表达,并用CD115微珠分选肾巨噬细胞验证。
研究巨噬细胞PP2Acα缺失对肾纤维化的影响。
将Csf1r-Cre/Esr1*小鼠与PP2Acαfl/fl小鼠杂交,通过他莫昔芬诱导巨噬细胞特异性敲除PP2Acα,并进行UUO或IRI手术,分析纤维化指标。
探究PP2Acα缺失是否减少纤维化肾组织中巨噬细胞和T淋巴细胞积聚。
通过免疫荧光染色检测F4/80和CD3阳性细胞数量。
确定PP2Acα是否通过Rap1调控巨噬细胞迁移。
分离BMDMs,进行划痕实验、细胞铺展实验,检测Rap1活性、磷酸化及与Itgb2的结合,并通过Rap1bV12过表达和Itgb2 siRNA验证。
探究PP2Acα缺失是否通过下调TNFα保护肾小管细胞。
在UUO/IRI模型中进行TUNEL/层粘连蛋白共染,检测肾小管细胞死亡;在共培养体系中,LPS刺激BMDMs的条件培养基处理原代肾小管细胞,PI染色检测死亡,并用TNFα siRNA和R-7050验证。
探讨PP2Acα是否通过Stat6磷酸化调控TNFα产生。
检测PP2Acα缺失或过表达后BMDMs中p-Stat6水平,并用AS1517499或Stat6 siRNA处理,检测TNFα表达和肾小管细胞死亡。
探究phendione抑制PP2Acα是否减轻肾纤维化。
对UUO或IRI小鼠腹腔注射phendione,评估纤维化程度;体外检测phendione对BMDMs迁移和TNFα产生的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型诱导 | 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | T5648 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Invitrogen | -- | |
| 小鼠巨噬细胞集落刺激因子 | R&D Systems | 416-ML-050 | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 基因敲除 | 4-羟基他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | H6278 |
| 细胞刺激 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| 信号通路抑制 | AS1517499 | MCE | HY-100614 |
| TNFα信号抑制 | R-7050 | MCE | HY-110203 |
| 药物处理 | 菲啶酮 | Sigma-Aldrich | 496383 |
| siRNA转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce Thermo-Scientific | -- |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 免疫沉淀 | 裂解缓冲液 | Beyotime | -- |
| 蛋白A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz | -- | |
| Rap1活性检测 | ATP生物发光检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | FL-AA |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | 15596018 |
| 逆转录 | ReverTra Ace逆转录酶 | Vazyme | R111-02 |
| 实时定量PCR | SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q141-02 |
| 7300实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 组织学染色 | Masson三色染色 | -- | -- |
| 天狼星红染色 | -- | -- | |
| 巨噬细胞分选 | 胶原酶 | Gibco | 17018-029 |
| 脱氧核糖核酸酶 | Roche | 10104159001 | |
| PE标记的抗CD115抗体 | Biolegend | 135505 | |
| PE微珠 | Stemcell | 17666 | |
| TUNEL染色 | 凋亡检测系统 | Promega | -- |
| PI染色 | 碘化丙啶染色试剂盒 | Elabscience | E-CK-A161 |
| ELISA | 小鼠TNFα ELISA试剂盒 | Bioworld Technology | CEK1783 |
| 流式细胞术 | PE标记的抗Ly6g抗体 | BioGems | 83122-60-25 |
| FITC标记的抗Ly6c抗体 | BD Biosciences | 553104 | |
| PerCP标记的抗CD11b抗体 | Biolegend | 101230 | |
| BD Canto II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 显微镜观察 | 奥林巴斯DP74显微镜 | OLYMPUS | -- |
| BX53荧光显微镜 | OLYMPUS | -- | |
| 组织消化 | Octo组织解离器 | Miltenyi Biotec | -- |
| 细胞过滤 | 40微米滤网 | BD Biosciences | -- |
| 免疫染色 | DAPI染色液 | -- | -- |
| Western blot | 抗PP2Ac抗体 | Cell Signaling Technology | 2038 |
| 抗PP2Acα抗体 | Abcam | ab106262 | |
| 抗PP2Acβ抗体 | Abcam | ab168371 | |
| 抗甲基化PP2Ac (L309)抗体 | Abcam | ab66597 | |
| 抗Itgb2抗体 | Abcam | ab119830 | |
| 抗Epac1抗体 | Abcam | ab124162 | |
| 抗纤连蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | F3648 | |
| 抗Stat6抗体 | Abcam | ab32520 | |
| 抗磷酸化Stat6 (T645)抗体 | Bioworld Technology | BS4186 | |
| 抗Rap1a/b抗体 | Cell Signaling Technology | 4938 | |
| 抗微管蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc53646 | |
| 抗GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | FL-335 | |
| 免疫沉淀 | 抗磷酸化丝氨酸/苏氨酸抗体 | Abcam | ab17464 |
| 免疫荧光 | 抗F4/80抗体 | eBioscience | 14-4801 |
| 抗TNFα抗体 | Bioworld Technology | BS1857 | |
| 抗层粘连蛋白抗体 | Abcam | ab44941 | |
| 免疫组化 | 抗CD68抗体 | Dako | MO876 |
| 流式封闭 | 抗CD16/32抗体 | Biolegend | 101330 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型构建 | UUO和IRI模型的实施细节,包括手术操作、缺血时间(IRI为30分钟)、取材时间点(UUO后10天?IRI后21天?),以及他莫昔芬注射剂量和时间(如UUO后第3天50mg/kg,第4、5天25mg/kg;IRI后第7天起连续7天25mg/kg) 阅读提示:Materials and methods: Mice and animal models; Figure 2e, f |
| 巨噬细胞PP2Acα敲除的验证 | Csf1r-Cre+/−, PP2Acαfl/fl小鼠的基因型确认(PCR),以及敲除效率(Western blot、免疫荧光) 阅读提示:Figure 2b–d; Materials and methods: Mice and animal models |
| BMDM培养和处理 | BMDM分离和培养条件(DMEM+10%FBS+10ng/ml M-CSF,培养9天),4-OHT使用浓度(1mM)和处理时间,LPS刺激浓度(100ng/µl?应为100ng/ml)和持续时间(6小时),以及其他抑制剂(AS1517499、R-7050)的处理浓度和时间 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment; Figure 6, 7 |
| 巨噬细胞迁移实验 | 划痕实验的具体设置(细胞密度、划痕宽度、观察时间点)、细胞铺展实验的基质(纤连蛋白包被)及时间 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment; Figure 4a–d |
| 共培养实验 | 巨噬细胞条件培养基的制备(LPS刺激6小时后换液,继续培养12小时),原代肾小管细胞分离和培养条件,共培养比例或处理时间,PI染色时间点(6小时和24小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment; Figure 6f–h |
| TNFα检测 | ELISA实验步骤(肾组织裂解液制备、上清收集、试剂盒使用),qRT-PCR引物序列和内参基因 阅读提示:Materials and methods: TNFα ELISA assay; Real-time qRT-PCR assay |
| 统计方法 | 统计软件(SigmaStat)、组间比较方法(one-way ANOVA + Student-Newman-Keuls)、p值阈值为0.05 阅读提示:Materials and methods: Statistical analyses |