构建放射抵抗细胞模型
获得放射抵抗的前列腺癌细胞系以研究放疗抵抗机制。
对PC-3细胞进行分次照射,累计36 Gy,建立PC-3R细胞系,并通过克隆形成实验验证其放射抵抗性。
A feedback mechanism from prostate cancer cells to macrophages, reinforced by STAT1, regulates tumor progression and resistance to radiotherapy.
包括体外细胞系、PDO、BMDMs、患者样本及小鼠体内模型,并包含功能验证和机制验证。
DU145和PC-3人前列腺癌细胞系 THP-1来源的M0巨噬细胞 患者来源类器官(PDO) BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型和C57BL/6J小鼠RM-1移植瘤模型
STAT1敲低和过表达的效率验证 乳酸和MCT1抑制剂AZD3965的浓度及处理时间 放疗剂量和照射方案 CCR2拮抗剂INCB8761和JAK抑制剂ruxolitinib的浓度及处理方式
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得放射抵抗的前列腺癌细胞系以研究放疗抵抗机制。
对PC-3细胞进行分次照射,累计36 Gy,建立PC-3R细胞系,并通过克隆形成实验验证其放射抵抗性。
评估STAT1在前列腺癌中的表达及其与患者预后的关系。
通过qRT-PCR、western blot、免疫组化检测STAT1在细胞系和组织中的表达,并进行生存分析。
确定STAT1是否增强前列腺癌细胞的有氧糖酵解。
在DU145和PC-3细胞中敲低或过表达STAT1,检测葡萄糖摄取、乳酸产生、ECAR和OCR。
确认STAT1是否直接结合并激活糖酵解酶基因启动子。
通过双荧光素酶报告基因和CUT&Tag-qPCR检测STAT1与HK2、PFKM、PKM2启动子的结合。
评估STAT1在体外和体内对肿瘤生长及放疗抵抗的影响。
通过增殖、迁移、侵袭实验及体内移植瘤模型,并检测DNA损伤修复情况。
确定前列腺癌细胞分泌的乳酸是否促进M2巨噬细胞极化。
将M0巨噬细胞与不同条件培养基共培养,检测M1和M2标志物表达。
探究乳酸是否通过MCT1进入巨噬细胞并激活NFκB1通路。
用乳酸和MCT1抑制剂处理巨噬细胞,检测NFκB1核转位和通路激活。
鉴定NFκB1调控的巨噬细胞分泌因子。
对NFκB1敲低的巨噬细胞进行蛋白芯片筛选,并通过qRT-PCR、western blot、ELISA验证MCP-1表达。
确定MCP-1是否激活JAK/STAT1通路并影响肿瘤进展。
用重组MCP-1处理前列腺癌细胞,检测JAK/STAT1激活、糖酵解水平及功能变化。
评估CCR2拮抗剂和JAK抑制剂在体内对肿瘤生长和放疗敏感性的影响。
在RM-1移植瘤模型中,给予CCR2拮抗剂和JAK抑制剂,并联合放疗,观察肿瘤生长。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| MEM培养基 | -- | -- | |
| F-12K培养基 | -- | -- | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯 | -- | -- | |
| 放射抵抗细胞构建 | RS2000-Pro X射线照射仪 | Radsource Technologies, Inc. | -- |
| 放疗克隆形成实验 | 结晶紫染色液 | -- | -- |
| RNA干扰和慢病毒转染 | Lipofectamine™ 2000 试剂 | Invitrogen | -- |
| 原代BMDM培养 | 重组巨噬细胞集落刺激因子 | -- | -- |
| qRT-PCR | FastPure 细胞/组织总RNA提取试剂盒 | Vazyme | -- |
| HiScript III 一步法RT SuperMix(qPCR专用) | Vazyme | -- | |
| Taq Pro 通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | -- | |
| QuantStudio™ 5 实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA蛋白定量试剂盒 | KeyGen BioTECH | KGB2101-100 | |
| ELISA | MCP-1 ELISA试剂盒 | Cloud-Clone Corp | SEA087Hu |
| 葡萄糖摄取实验 | 葡萄糖荧光检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-F037 |
| 乳酸产生实验 | D-乳酸比色检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K002-M |
| 细胞外酸化率和耗氧率检测 | Seahorse XF24 细胞外流量分析仪 | Seahorse | -- |
| 免疫组化 | STAT1抗体 | Proteintech | 10144-2-AP |
| CD163抗体 | Proteintech | 83285-4-RR | |
| 链霉菌抗生物素蛋白-过氧化物酶 | MaiXin.BIO | KIT-9720 | |
| 双荧光素酶报告基因实验 | Dual-Lumi™ 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| CUT&Tag实验 | NovoNGS® CUT&Tag® 4.0 高灵敏度试剂盒 | NovoProtein | N259-YH01 |
| p-STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 7649 | |
| NFκB1抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 免疫荧光 | DAPI | -- | -- |
| 细胞增殖实验 | 细胞计数试剂盒-8 | -- | -- |
| Transwell实验 | Matrigel基质胶 | Corning | 354234 |
| 彗星实验 | 彗星实验试剂盒 | Cell Biolabs | STA-351 |
| 体内实验 | 无胸腺BALB/c裸鼠 | -- | -- |
| C57BL/6J小鼠 | -- | -- | |
| 药物处理 | 2-脱氧葡萄糖 | -- | -- |
| GSK2837808A (LDHA抑制剂) | -- | -- | |
| MCT1抑制剂AZD3965 | -- | -- | |
| NFκB1抑制剂JSH-23 | -- | -- | |
| 重组MCP-1 | -- | -- | |
| CCR2拮抗剂INCB8761 | -- | -- | |
| JAK抑制剂ruxolitinib | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基类型、FBS浓度、CO2浓度、温度 阅读提示:方法部分'Cell culture' |
| 放射抵抗细胞构建 | 照射剂量、分次次数、累积剂量、恢复时间、重新接种比例 阅读提示:方法部分'Generation of radioresistant cells' |
| qRT-PCR | RNA提取试剂盒、逆转录试剂、SYBR mix、内参基因 阅读提示:方法部分'Quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR)' |
| Western blot | 裂解液、蛋白定量试剂盒、抗体信息、显影方法 阅读提示:方法部分'Western blot' |
| 巨噬细胞极化实验 | THP-1细胞分化浓度和时间、条件培养基处理时间、M1/M2标志物 阅读提示:方法部分'Cell culture'和结果部分'Lactate derived from prostate cancer cells promoted M2 macrophages polarization' |
| 体内实验 | 小鼠品系、细胞数量、给药方式、给药频率、肿瘤测量和计算方法 阅读提示:方法部分'In vivo tumorigenesis assay' |