建立长光照(LP)大鼠模型
模拟人类长期光照暴露,研究其对卵巢功能的影响。
6-8周龄雌性SD大鼠随机分为Ctrl组(12小时光照/12小时黑暗)和LP组(18小时光照/6小时黑暗),持续12周,然后进行相关检测。
Circadian rhythm disruption impairs ovarian follicular development via NAD+ metabolic reprogramming.
研究包含大鼠长光照模型、体外颗粒细胞实验、COCs代谢组学、RNA-seq、CUT&Tag、ChIP-qPCR、透射电镜、流式、Western blot等多层级证据,并进行了功能验证(NMN补充)和机制验证(BMAL1-NAMPT-SIRT3-SOD2)。
SD大鼠长光照(18小时光照/6小时黑暗)模型 原代卵巢颗粒细胞 KGN细胞系 COCs
LP条件:18小时光照/6小时黑暗,持续12周 NMN补充剂量:体外1000 μM处理48小时,体内100 mg/kg饮水12周 动物分组:Ctrl和LP组,每组样本数N≥3 关键检测:窦状卵泡计数、回收卵母细胞数、NAD+水平、SOD2乙酰化水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟人类长期光照暴露,研究其对卵巢功能的影响。
6-8周龄雌性SD大鼠随机分为Ctrl组(12小时光照/12小时黑暗)和LP组(18小时光照/6小时黑暗),持续12周,然后进行相关检测。
验证长光照暴露对卵巢形态、卵泡发育和排卵的影响。
通过HE染色观察卵巢形态和计数各阶段卵泡;BrdU染色评估颗粒细胞增殖;超排处理后计数回收卵母细胞;交配实验评估产仔数。
探讨长光照暴露是否导致线粒体功能障碍。
通过透射电镜观察线粒体超微结构,JC-1染色检测线粒体膜电位,ATP试剂盒和Seahorse检测ATP水平和耗氧率。
验证长光照暴露是否通过SIRT3/SOD2轴导致氧化应激。
用DCFH-DA探针检测ROS水平,Western blot检测SOD2和乙酰化SOD2蛋白水平,ELISA检测SOD活性,Co-IP验证SIRT3-SOD2相互作用。
寻找长光照暴露后COCs中的代谢变化,特别是NAD+相关通路。
收集COCs进行靶向代谢组学分析,鉴定差异代谢物,并进行KEGG和SMPDB通路富集。
阐明长光照暴露如何破坏NAMPT的昼夜节律。
在不同ZT时间点收集卵巢,通过Western blot检测BMAL1和NAMPT蛋白水平,CUT&Tag和ChIP-qPCR检测BMAL1在Nampt启动子上的结合。
评估NMN补充是否能缓解LP暴露引起的卵巢功能障碍。
在体外培养的原代颗粒细胞和体内大鼠模型中给予NMN处理,评估NAD+水平、线粒体功能、ROS水平、卵泡计数和排卵率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 激素检测 | 放射免疫分析试剂盒 | Beijing North Institute of Biotechnology | -- |
| 褪黑素ELISA试剂盒 | MEIMIAN | MM-0657R2 | |
| 液相色谱-质谱联用仪 | AB Sciex | AB 6500+ | |
| 超排处理 | 孕马血清促性腺激素 | CEN’S | -- |
| 人绒毛膜促性腺激素 | CEN’S | -- | |
| COC分离 | 透明质酸酶 | Biosharp | BS171 |
| 细胞培养 | 磷酸盐缓冲溶液 | Gibco | -- |
| DMEM/F12培养基 | VivaCell | C3130-0500 | |
| 胎牛血清 | Serana | -- | |
| 青霉素和链霉素 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 烟酰胺单核苷酸 | Solarbio | -- |
| 细胞培养 | KGN细胞 | Procell | CL-0603 |
| 免疫荧光 | 活性氧检测试剂盒 | Beyotime | S0033S |
| JC-1线粒体膜电位探针 | Yeasen | 40705ES03 | |
| A2荧光显微镜 | Nikon | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | Biosharp | BS350C |
| 酶标仪 | LabServ | K3 TOUCH | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | TaKaRa | T9108 |
| NanoDrop 2000分光光度计 | Thermo Scientific | -- | |
| RT-qPCR | 逆转录试剂 | Vazyme | R223 |
| SYBR预混液 | Vazyme | Q311 | |
| 罗氏实时荧光定量PCR仪 | Roche | LightCycler@480Ⅱ | |
| RNA-seq | Illumina NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- |
| ChIP | 染色质免疫沉淀试剂盒 | Beyotime | -- |
| 抗BMAL1抗体 | Cell Signalling | 14020 | |
| IgG抗体 | Abcam | 171870 | |
| 线粒体提取 | 线粒体提取试剂盒 | Solarbio | SM0020 |
| 组织学 | 梯度酒精 | Sinopharm | 10009259 |
| 二甲苯 | Sinopharm | 10023418 | |
| 树脂 | Sigma–Aldrich | 8007-47-4 | |
| BrdU染色 | 溴脱氧尿苷 | Sigma | B5002 |
| 抗BrdU抗体 | Abcam | ab6326 | |
| 山羊抗大鼠IgG二抗(HRP标记) | Abcam | ab97057 | |
| 透射电镜 | 冷冻透射电子显微镜 | Thermo FEI | Tecnai G2 spirit |
| NAD+检测 | NAD(H)含量检测试剂盒 | Sangon Biotech | D799201 |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Beyotime | S0026 |
| 酶标仪 | Thermo Scientific | Varioskan Flash | |
| SOD检测 | 总SOD活性检测试剂盒(WST-8法) | Beyotime | S0101S |
| MDA检测 | 脂质过氧化MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131 |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Biosharp | BL507A |
| 化学发光检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| 抗BMAL1抗体 | Cell Signalling | 14020 | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | Proteintech | 66240-1-Ig | |
| 抗NAMPT抗体 | Proteintech | 11776-1-AP | |
| 抗细胞角蛋白18抗体 | Proteintech | 10830-1-AP | |
| 抗FSH受体抗体 | Proteintech | 22665-1-AP | |
| 抗波形蛋白抗体 | Proteintech | 10366-1-AP | |
| 抗VDAC1/孔蛋白抗体 | Proteintech | 55259-1-AP | |
| 抗SIRT3抗体 | Proteintech | 10099-1-AP | |
| 抗SOD2/MnSOD抗体 | Abcam | ab68155 | |
| 抗SOD2(乙酰化K68)抗体 | Abcam | ab137037 | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A琼脂糖珠 | BBI | C600688 |
| siRNA转染 | jetPRIME转染试剂 | Polyplus | 101000001 |
| 流式细胞术 | DCFH-DA活性氧探针 | Beyotime | S0033M |
| JC-1线粒体膜电位探针 | Yeasen | 40705ES03 | |
| CUT&Tag | 伴刀豆球蛋白A包被磁珠 | -- | -- |
| 洋地黄皂苷 | -- | -- | |
| 抗BMAL1抗体 | Cell Signalling Technology | 14020 | |
| 正常IgG | ABclonal | AS070 | |
| 二抗(抗兔IgG) | Millipore | AP132 | |
| CUT&Tag_Novogene试剂盒 | Novogene | -- | |
| AMPure磁珠 | -- | -- | |
| 安捷伦2100生物分析仪 | Agilent | -- | |
| 乙酰辅酶A检测 | 乙酰辅酶A ELISA试剂盒 | JINGMEI | JM-10486R2 |
| 体外受精 | G-IVF培养基 | Vitrolife | 10134 |
| 细胞氧耗率 | Seahorse XF微孔板 | Agilent Technologies | -- |
| Seahorse XF细胞线粒体压力测试试剂盒 | Agilent Technologies | 103015-100 | |
| 寡霉素 | -- | -- | |
| 单细胞转录组 | Illumina NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 大鼠品系、周龄、光照周期、暴露时长、随机分组方法 阅读提示:Methods - Animal model |
| 激素检测 | 检测时间点(ZT)、样本量、检测方法(RIA, ELISA, LC/MS) 阅读提示:Methods - Sample collection and serum hormone measurement |
| 卵泡计数和排卵评估 | 超排方案(PMSG/hCG剂量和时间)、卵泡计数标准、样本量 阅读提示:Methods - Isolation of cumulus–oocyte complexes and primary granulosa cells; Results - Fig. 1 legend |
| 线粒体功能检测 | 检测方法(JC-1、ATP、OCR)、细胞或组织来源、样本量、仪器设置 阅读提示:Methods - Transmission electron microscopy; ATP content measurement; Oxygen consumption rate (OCR) analysis |
| 氧化应激检测 | ROS探针浓度和孵育时间、SOD/MDA试剂盒货号、样品处理方法 阅读提示:Methods - Flow cytometry; Total SOD2 activity measurement; MDA content measurement |
| 分子机制验证 | 抗体货号、Western blot条件、ChIP/CUT&Tag实验参数、siRNA序列 阅读提示:Methods - Western blotting; Chromatin immunoprecipitation assay; CUT&Tag; Transfection of small interfering RNA |
| NMN处理 | NMN浓度、处理时间、给药途径、动物分组 阅读提示:Methods - Cell culture and treatment; Rat treatments (Results - NMN supplementation alleviates long photoperiod induced ovulation disorder) |