建立胆汁淤积性肝损伤小鼠模型
模拟胆汁淤积性肝损伤,研究AHR和色氨酸代谢的变化。
使用0.1% DDC饮食喂养C57BL/6J小鼠3周或进行胆管结扎(BDL)手术2周建立模型。
Activation of aryl hydrocarbon receptor alleviates cholestatic liver injury by inhibiting inflammation.
包含DDC和BDL两种体内模型、细胞实验、转录组、代谢组、16S rDNA测序等多层次验证,并有功能获得和缺失实验。
C57BL/6J小鼠DDC饮食诱导的胆汁淤积性肝损伤模型 C57BL/6J小鼠胆管结扎(BDL)诱导的胆汁淤积性肝损伤模型 AML12小鼠肝细胞系
小鼠品系、性别、年龄和体重(C57BL/6J雄性,6-8周龄,约20g) DDC饮食浓度(0.1% w/w)和喂养时间(3周) ITE给药剂量(5 mg/kg体重)和给药途径(腹腔注射,每周三次,持续3周) AAV6-Ahr和AAV8载体的剂量(2×10^11 vg/鼠)和给药途径(尾静脉注射) LPS刺激浓度(500 nM)和ITE处理浓度(10或100 nM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟胆汁淤积性肝损伤,研究AHR和色氨酸代谢的变化。
使用0.1% DDC饮食喂养C57BL/6J小鼠3周或进行胆管结扎(BDL)手术2周建立模型。
评估胆汁淤积时AHR表达和色氨酸代谢是否改变。
通过Western blot检测肝脏AHR蛋白水平;通过非靶向血清代谢组学分析色氨酸代谢途径的变化。
验证AHR激活是否能减轻胆汁淤积性肝损伤。
给予DDC饮食的小鼠腹腔注射ITE(5 mg/kg,每周三次,共3周),评估体重、血清肝功能指标、肝组织学等。
通过基因过表达进一步验证AHR的保护作用。
BDL小鼠尾静脉注射AAV6-Ahr或对照,评估肝损伤程度。
探索ITE减轻肝损伤的分子机制。
对肝脏组织进行RNA-seq,比较CON、DDC和DDC-ITE组的基因表达,进行GO和KEGG富集分析。
确认AHR直接抑制CCL2转录。
在AML12细胞中,用LPS和/或ITE处理,检测Ccl2表达;用CH223191抑制AHR;进行ChIP实验验证AHR与Ccl2启动子结合。
探究胆汁淤积时肠道菌群改变与色氨酸代谢和炎症的关系。
对盲肠内容物进行16S rDNA测序,分析菌群组成,并与代谢物和肝功能指标进行相关性分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型诱导 | 3,5-二乙氧基羰基-1,4-二氢可力丁 | Sigma-Aldrich | #137030 |
| 药物处理 | 2-(1'H-吲哚-3'-羰基)-噻唑-4-羧酸甲酯 | MedChemExpress | #HY-19317 |
| 细胞培养 | AML12细胞系 | Procell | # CL-0602 |
| AML12细胞专用培养基 | -- | # CM-0602 | |
| DMEM/F12培养基 | -- | PM150312 | |
| 胎牛血清 | -- | 164210-50 | |
| ITS-G添加剂 | -- | PB180429 | |
| 地塞米松 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | PB180120 | |
| 细胞处理 | 脂多糖 | MedChemExpress | # HY-D1056 |
| CH223191 | MedChemExpress | # HY-12684 | |
| 细胞转染 | AHR过表达质粒 | Sino Biological | # MG50786-CM |
| LipoMax DNA转染试剂 | SUDGEN | # 32012 | |
| Opti-MEM培养基 | -- | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | # P0013B |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | # P0012 | |
| 5× SDS上样缓冲液 | Solarbio | # P1040 | |
| Immobilon-NC硝酸纤维素膜 | Millipore | #HATF00010 | |
| AHR一抗 | Cell Signaling Technology | # 4685 | |
| C-MYC抗体 | Boao Rui Jing | # AB1007T | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab59164 | |
| 血清生化分析 | Olympus Beckman Coulter AU480全自动生化分析仪 | InTec PRODUCTS | -- |
| 肝组织LPS检测 | 小鼠脂多糖ELISA试剂盒 | Jonln | # JL20691 |
| RNA提取和qRT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | # 15596026 |
| PrimeScript RT Master Mix | TaKaRa | # RRO36A | |
| SYBR Green PCR预混液 | Roche | # 4710436001 | |
| 免疫组化 | CD68抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-16654 |
| LY6G抗体 | Cell Signaling Technology | # 87048 | |
| Alexa Fluor 488标记二抗 | Abcam | # ab150077 | |
| DAPI | Abcam | # ab104139 | |
| 图像采集 | Olympus FluoView 1000显微镜 | Olympus | -- |
| ChIP | SimpleChIP酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | # 9002 |
| 统计分析 | GraphPad Prism软件9.00 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、性别、年龄、体重、饮食和手术细节 阅读提示:Materials and methods: Cholestatic liver disease model induction and treatment |
| 药物处理 | ITE剂量、给药途径、频率和时间 阅读提示:Materials and methods: Cholestatic liver disease model induction and treatment |
| 细胞实验 | AML12细胞培养条件、LPS浓度、ITE浓度、CH223191浓度、处理时间 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and transient transfection |
| 转录组分析 | 样本量、差异表达基因筛选标准、富集分析方法 阅读提示:Materials and methods: Transcriptome analysis |
| ChIP实验 | ITE浓度、处理时间、ChIP试剂盒型号、引物序列 阅读提示:Materials and methods: Chip assay |
| 肠道菌群分析 | 样本类型(盲肠内容物)、测序平台、分析方法(如LDA阈值) 阅读提示:Materials and methods: 16S rDNA amplicon sequencing, data processing, and analysis |