提取和成分鉴定
制备GF和GFC提取物,并鉴定加工前后的差异化合物。
采用CO₂超临界流体萃取制备GF和GFC提取物,利用UPLC-Q-TOF-MS/MS进行化合物鉴定,通过PCA和OPLS-DA分析筛选差异代谢物。
Processing-induced changes in neuroprotective components and mechanisms of gardeniae fructus: integrating UPLC-Q-TOF-MS/MS, network pharmacology, and in vitro analysis.
研究包含化合物鉴定、定量分析、网络药理学预测、分子对接以及细胞水平(BV2和HT22)功能验证和机制验证,涉及多层级证据(化学分析、网络药理学和体外实验)。
BV2小胶质细胞系 HT22海马神经元细胞系
栀子苷浓度(20 µM)处理BV2细胞3小时,再与1 µg/mL LPS共孵育24小时 栀子苷和藏红花酸浓度(10 µM)处理HT22细胞3小时,再与10 µM Erastin共孵育24小时 Erastin诱导HT22细胞铁死亡模型的浓度(10 µM)及细胞活力下降至49.3% GFC制备条件:240 °C炒制至外黑内褐
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
制备GF和GFC提取物,并鉴定加工前后的差异化合物。
采用CO₂超临界流体萃取制备GF和GFC提取物,利用UPLC-Q-TOF-MS/MS进行化合物鉴定,通过PCA和OPLS-DA分析筛选差异代谢物。
定量GF和GFC中10种关键生物活性差异成分的含量变化。
使用UPLC-UV-DAD在多个波长(238, 254, 370, 440 nm)下对标准品和样品进行定量分析。
预测GF和GFC中活性化合物的潜在靶点及参与的信号通路。
通过数据库筛选活性化合物,预测靶点,进行PPI网络构建和GO/KEGG富集分析,并利用分子对接评估关键化合物与核心靶点的结合。
验证栀子苷和藏红花酸对LPS诱导的BV2小胶质细胞炎症反应的影响。
用栀子苷和藏红花酸预处理BV2细胞,然后用LPS刺激,检测细胞活力、NO、细胞因子(TNF-α、IL-1β、IL-6、IL-22、IL-4、IL-10)水平。
验证栀子苷和藏红花酸对Erastin诱导的HT22细胞铁死亡的保护作用。
用栀子苷和藏红花酸预处理HT22细胞,然后用Erastin诱导铁死亡,检测细胞活力、ROS、MDA、GSH水平。
验证栀子苷和藏红花酸对TLR4/NF-κB和Nrf2通路的调节作用。
提取HT22细胞RNA和蛋白质,通过qRT-PCR和Western blot检测相关基因和蛋白表达水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 提取 | CO₂超临界流体萃取 | Waters | -- |
| 化合物鉴定 | 超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱 | Waters | -- |
| 色谱分离 | BEH C18色谱柱 | Waters | -- |
| 定量分析 | 高效液相色谱-紫外-二极管阵列检测系统 | Thermo Fisher | -- |
| Agilent Eclipse Plus C18色谱柱 | Agilent | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Nanjing Biotunnel Biotechnology | -- |
| 胎牛血清 | Procell Life Science & Technology | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 细胞处理 | 脂多糖 | Beijing Dingguo Changsheng Biotechnology | DH183-1 |
| Erastin | Fisher Scientific | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | APExBIO | -- |
| NO检测 | Griess试剂 | Beyotime Biotechnology | S0021 |
| 细胞因子检测 | ELISA试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| MDA检测 | 丙二醛检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A003-4-1 |
| GSH检测 | 谷胱甘肽检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| RNA提取 | TransZol Up试剂 | TransGen Biotech | -- |
| cDNA合成 | TransScript一步法gDNA去除和cDNA合成试剂盒 | TransGen Biotech | -- |
| qRT-PCR | PerfectStart® Green qPCR SuperMix | TransGen Biotech | -- |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | CWBIO | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| GPX4抗体 | Abcam | ab252833 | |
| HO-1抗体 | Abcam | ab189491 | |
| NQO1抗体 | Abcam | ab80588 | |
| TLR4抗体 | Cell Signaling Technology | 14358 | |
| NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 磷酸化NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| Keap1抗体 | Cell Signaling Technology | 8047 | |
| Nrf2抗体 | Cell Signaling Technology | 20733 | |
| 辣根过氧化物酶标记的二抗 | CWBIO | -- | |
| 荧光检测 | DCFH-DA荧光探针 | -- | -- |
| 显微成像 | 倒置显微镜 | Mshot | MF52-N |
| 分光光度计 | NanoDrop ND-1000分光光度计 | Implen | -- |
| qRT-PCR | CFX96 Touch PCR仪 | Bio-Rad | -- |
| 蛋白检测 | ECL化学发光试剂盒 | -- | -- |
| 标准品 | 栀子苷 | Chengdu Aifa Biotechnology | AFDG1956 |
| 藏红花酸 | Chengdu Aifa Biotechnology | AFCD1712 | |
| 3-甲基山柰酚 | Chengdu Aifa Biotechnology | AFCE2202 | |
| 栀子黄素B | Chengdu Aifa Biotechnology | AFCL2654 | |
| GBGB | Chengdu Aifa Biotechnology | AFBG0602 | |
| 栀子苷酸 | Chengdu Aifa Biotechnology | AF21041103 | |
| 京尼平 | Chengdu Aifa Biotechnology | AFDA0253 | |
| 西红花苷I | Chengdu Aifa Biotechnology | AFDF1851 | |
| 西红花苷II | Chengdu Aifa Biotechnology | AFBG1331 | |
| 西红花苷III | Chengdu Aifa Biotechnology | AFCE2203 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| GFC制备 | 炒制温度240 °C,炒制时间直至外黑内褐(具体时间未明确说明) 阅读提示:Materials and methods, Reagents and chemical materials |
| 提取条件 | SFE参数:温度40 °C,压力200 bar,CO₂流速0.25 mL/min,时间100 min 阅读提示:Materials and methods, Sample and standard solution preparation |
| 化合物鉴定 | UPLC-Q-TOF-MS/MS条件:BEH C18柱,梯度洗脱,流速0.3 mL/min,柱温30 °C,进样2 µL;筛选标准VIP > 1且p < 0.05 阅读提示:Materials and methods, UPLC-QTOF-MS/MS analysis |
| 定量分析 | UPLC-UV-DAD条件:Agilent Eclipse Plus C18柱,流速0.3 mL/min,柱温30 °C,进样2 µL,检测波长238、254、370、440 nm;线性范围0.20–60 ng/mL,R² > 0.9995 阅读提示:Materials and methods, Quantification of differential metabolites |
| 细胞培养 | HT22和BV2细胞系来源;培养条件:DMEM + 10% FBS + 1%青霉素/链霉素,37 °C,5% CO₂ 阅读提示:Materials and methods, Cell culture |
| 炎症实验 | BV2细胞密度5 × 10³/well;处理浓度:栀子苷/藏红花酸20 µM,LPS 1 µg/mL;预处理3小时,刺激24小时;检测NO、TNF-α、IL-1β、IL-6、IL-22、IL-4、IL-10 阅读提示:Materials and methods, Cell viability assay, Griess assay, ELISA analysis; Figure 4 legend |
| 铁死亡实验 | HT22细胞密度2.5 × 10⁴/well;处理浓度:栀子苷/藏红花酸10 µM,Erastin 10 µM;预处理3小时,刺激24小时;检测细胞活力、ROS、MDA、GSH 阅读提示:Materials and methods, Cell viability assay, Measurement of MDA and GSH levels, Assessing cellular ROS levels; Figure 5 legend |
| 机制验证 | qRT-PCR和Western blot检测基因和蛋白:TLR4、NF-κB p65、p-NF-κB p65、Keap1、Nrf2、GPX4、HO-1、NQO1;蛋白上样量20 µg;抗体稀释度:GPX4 1:5000, HO-1 1:2000, NQO1 1:5000, TLR4 1:1000, NF-κB p65 1:1000, p-NF-κB p65 1:1000, Keap1 1:1000, Nrf2 1:1000;二抗1:5000 阅读提示:Materials and methods, Quantitative real-time PCR, Western blot analysis; Figure 6 legend |