开发新型PANoptosis相关基因签名以预测胃腺癌患者预后

背景：PANoptosis作为一种炎症性程序性细胞死亡，参与肿瘤发展。本研究旨在发现胃腺癌（STAD）中新的PANoptosis相关预后签名，STAD是一种常见的消化系统恶性肿瘤。方法：STAD样本来源于公共数据库，PANoptosis相关基因（PRGs）从已有报告中获取。通过单因素Cox回归分析筛选预后相关PRGs。使用“ConsensusClusterPlus”包识别STAD的分子亚型。使用“Limma”包筛选不同亚型间的差异表达基因（DEGs）。鉴定STAD中PANoptosis相关的预后签名以建立RiskScore模型。整合RiskScore和部分临床特征建立列线图。比较不同风险组中的免疫细胞浸润和TIDE评分。采用Spearman方法分析免疫检查点基因、药物敏感性与RiskScore之间的相关性。通过体外细胞实验初步探索PANoptosis相关签名基因在STAD中的生物学功能。结果：基于18个预后相关PRGs，识别出STAD的两个分子亚型，C1亚型的总生存期（OS）低于C2亚型。进一步确定了三个PANoptosis相关签名基因（APOD、GPC3和SERPINE1）以建立RiskScore模型，该模型能准确评估STAD患者的预后结局。然后，通过整合RiskScore与临床特征，建立了一个列线图。高风险组具有更高的免疫细胞浸润和TIDE评分，以及更低的OS率。RiskScore与九个免疫检查点基因正相关。此外，我们筛选了23种与RiskScore显著相关的药物。体外细胞实验显示，APOD、GPC3和SERPINE1在STAD细胞系中的mRNA和蛋白水平上调，且敲除APOD显著降低癌细胞增殖、迁移和侵袭水平，并增加STAD细胞系的凋亡能力。结论：本研究建立了一个基于PANoptosis的RiskScore模型来评估STAD患者的预后，这可能有助于STAD的个体化治疗。