SULF1表达与临床相关性分析
检测SULF1在结肠癌组织和细胞系中的表达水平及其与预后的关系。
使用RT-qPCR、Western blot和IHC检测临床样本中SULF1表达,分析TCGA数据生存曲线。
MARCHF1-mediated SULF1 degradation blocks THBS2/TGF-β/SMAD2/3 signaling to reverse colon cancer metastasis and 5-FU resistance.
包含临床样本、细胞功能实验、机制验证(Co-IP、泛素化)及动物模型等多个独立证据层级,并包含功能验证与机制验证。
Caco-2细胞 LoVo细胞 LoVo/5-FU耐药株 裸鼠皮下异种移植模型 裸鼠尾静脉转移模型 人结肠癌组织样本
SULF1敲低效率(si-SULF1-1)及过表达验证 MARCHF1过表达对SULF1蛋白水平的影响 5-FU处理浓度及IC50值(Caco-2: 10.28 μM vs 2.37 μM; LoVo: 12.97 μM vs 4.75 μM; LoVo/5-FU: 21.11 μM vs 13.68 μM) 动物模型分组(sh-NC vs sh-SULF1,以及sh-NC+5-FU、sh-SULF1+5-FU) 统计方法(t检验、单因素方差分析)及样本量(n=3或5)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测SULF1在结肠癌组织和细胞系中的表达水平及其与预后的关系。
使用RT-qPCR、Western blot和IHC检测临床样本中SULF1表达,分析TCGA数据生存曲线。
验证SULF1对结肠癌细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响。
在Caco-2和LoVo细胞中敲低或过表达SULF1,进行MTT、克隆形成、流式凋亡、划痕愈合和Transwell侵袭实验。
探究SULF1是否通过THBS2调控TGF-β1/SMAD2/3信号通路。
Western blot检测THBS2和p-SMAD2/3表达,Co-IP验证SULF1-THBS2和THBS2-TGF-β1结合,并用TGF-β1处理进行功能回复实验。
验证MARCHF1是否为SULF1的E3泛素连接酶并介导其降解。
过表达MARCHF1,检测SULF1蛋白和mRNA水平;使用CHX和MG132处理,检测SULF1稳定性;Co-IP结合Western blot检测SULF1泛素化水平。
评估SULF1敲低是否增强结肠癌细胞对5-FU的敏感性。
使用si-SULF1敲低SULF1,在Caco-2、LoVo和LoVo/5-FU细胞中检测5-FU处理后的细胞活力、克隆形成和凋亡。
验证SULF1敲低在体内是否抑制结肠癌生长和肝转移,并增强5-FU疗效。
使用sh-SULF1慢病毒转染LoVo细胞,建立尾静脉转移模型和皮下异种移植模型,分别评估转移和肿瘤生长,并联合5-FU治疗。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Servicebio | G4510-500ML |
| MEM培养基 | Servicebio | G4551-500ML | |
| F12K培养基 | Solarbio | LA1320 | |
| RPMI-1640培养基 | Solarbio | 31800 | |
| 胎牛血清 | Gibco™ | 10099141C | |
| 药物处理 | 5-氟尿嘧啶 | MCE | HY-90006 |
| MG132 | MCE | HY-13259 | |
| TGF-β1 | MCE | HY-P7118 | |
| 转染 | Lipo8000™转染试剂 | Beyotime | C0533 |
| 克隆形成实验 | 结晶紫 | Servicebio | G1014-50ML |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Sigma | 93443 |
| 组织染色 | 伊红 | Servicebio | G1001 |
| Transwell侵袭实验 | 基质胶 | ABW | 0827045 |
| 免疫荧光 | DAPI | Servicebio | G1012-100L |
| 药物处理 | 二甲亚砜 | Beyotime | ST038 |
| Western blot | 十二烷基硫酸钠 | BioFROXX | 3250 |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| MTT检测 | MTT检测试剂盒 | Solarbio | M1020 |
| RT-qPCR | PrimeScript™逆转录试剂盒 | Takara | RR037Q |
| TB Green® Premix Ex Taq™ II 试剂盒 | Takara | RR820Q | |
| 免疫组织化学 | PV-6000通用免疫组化试剂盒 | Zhongshan Golden Bridge | PV-6000 |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | Beyotime | C1062L |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Bio sharp | BL521A |
| 免疫组织化学 | DAB显色试剂盒 | Servicebio | G1212-200T |
| Western blot | 抗SULF1抗体 | Proteintech | 27438-1-AP |
| 抗THBS2抗体 | Abclonal | Ab8561 | |
| 抗SMAD2/3抗体 | Cellsignal | 5678S | |
| 抗p-SMAD2/3抗体 | Cellsignal | 8828S | |
| 抗TGF-β1抗体 | Proteintech | 21898-1-AP | |
| 抗MARCHF1抗体 | Proteintech | 24771-1-AP | |
| 泛素化检测 | 抗泛素抗体 | Cellsignal | 3936 |
| Western blot | GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP |
| 免疫组织化学 | 抗Ki67抗体 | Abcam | ab16667 |
| 抗Caspase 3抗体 | Biosharp | PB9188 | |
| 免疫荧光 | 抗THBS2抗体 | Affinity Biosciences | DF14754 |
| 抗THBS2抗体 | Genetex | GTX11699 | |
| 抗SULF1抗体 | Abcam | ab168616 | |
| 抗SULF1抗体 | Thermo Fisher | PA5-115984 | |
| 免疫组织化学 | 抗SULF1抗体 | CUSABIO | CSB-PA260604 |
| 免疫荧光 | 抗p-SMAD2抗体 | Genetex | GTX133614 |
| 抗p-SMAD3抗体 | Genetex | GTX32214 | |
| 流式细胞术 | FACSVerse流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 免疫荧光 | 倒置荧光显微镜 | Keyence | BZ-X800 |
| 蛋白质提取 | 高速冷冻离心机 | Thermo Scientific | 75002425 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| SULF1表达检测 | 临床样本数量(n=49)、分组(T vs N)、检测方法(RT-qPCR, Western blot, IHC)及重复数(n=3或4) 阅读提示:Results 第一小节,Figure 1 和图注 |
| 细胞培养 | 细胞系来源(Procell)及培养基类型(DMEM, MEM, F12K, RPMI-1640) 阅读提示:STAR Methods, Cell culture and treatments |
| SULF1敲低与过表达 | siRNA序列(si-SULF1-1和si-SULF1-2)及转染效率验证(RT-qPCR和Western blot) 阅读提示:STAR Methods, Cell transfection |
| 5-FU敏感性实验 | 5-FU浓度梯度、IC50值、细胞系(Caco-2, LoVo, LoVo/5-FU)及检测方法(MTT, 克隆形成, 凋亡) 阅读提示:Results 第五小节,Figure 5 和图注 |
| 体内实验 | 动物品系(雄性裸鼠)、细胞注射数量、分组及样本量(n=5)、5-FU给药方案(剂量、途径、时间:文中未明确说明) 阅读提示:Results 第六小节,Figure 6 和图注;STAR Methods, In vivo tumor models |