scRNA-seq分析UD子宫内膜组织
探究UD的细胞组成和潜在发病机制,特别是子宫内膜侵袭和DAFs的作用。
对正常和UD子宫内膜组织进行单细胞RNA测序,鉴定细胞类型,分析DAFs亚群、分化轨迹及细胞间相互作用。
Development of polypeptide scaffold for anti-endometrial invasion and ordered myometrial recovery in uterine diverticulum.
包含临床样本scRNA-seq分析、体外细胞实验、支架表征及大鼠UD模型体内验证,涵盖多层级证据和功能与机制验证。
人子宫内膜组织(正常与UD) 子宫平滑肌细胞(uSMCs) 人脐静脉内皮细胞(HUVECs) Sprague-Dawley大鼠子宫损伤模型
BSBs制备中使用的琼脂糖浓度(2%)及定向冷冻时间(3分钟) BSBs@exo@poly制备中多肽浓度(0.1 mg/mL)和孵育时间(4-6小时) 大鼠模型中子宫损伤深度(50-70%壁厚)和直径(1-2毫米) 治疗评估时间点(14天) 外泌体最佳浓度(60 μg/mL)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究UD的细胞组成和潜在发病机制,特别是子宫内膜侵袭和DAFs的作用。
对正常和UD子宫内膜组织进行单细胞RNA测序,鉴定细胞类型,分析DAFs亚群、分化轨迹及细胞间相互作用。
开发具有各向异性多通道结构的丝素蛋白支架,模拟子宫肌层结构。
通过定向冷冻技术制备BSBs,使用含2%琼脂糖的SF溶液,表征其结构、力学性能、降解性和细胞相容性。
验证BSBs是否支持uSMCs和HUVECs的有序生长和浸润。
将uSMCs和HUVECs共培养于BSBs中,通过荧光标记、共聚焦显微镜和CCK-8评估细胞粘附、增殖和浸润深度。
验证scRNA-seq鉴定的FBLIM1在uSMCs功能分化中的作用。
通过敲低和过表达FBLIM1,检测平滑肌相关蛋白(SMA、CALD1、SMTN、CNN1)的表达变化。
分离和表征来自经血干细胞的外泌体,评估其促进细胞增殖的能力。
通过超速离心提取外泌体,使用TEM、DLS、Western blot进行表征,并通过CCK-8评估其对DAFs和HUVECs增殖的影响。
评估BSBs@exo@poly在体内预防和治疗UD的效果。
建立大鼠子宫损伤模型,分为六组,分别进行不同处理,14天后通过组织学、免疫组化和qRT-PCR评估子宫形态、炎症和再生情况。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| BSBs制备材料 | 琼脂糖 | Sigma | 16500500 |
| 电镜观察 | 超薄碳膜铜网 | Zhongjing Scientific Instrument | BZ11032a |
| 细胞标记 | CMFDA细胞示踪剂 | Yeasen Company | 40721 |
| CM-DiI细胞示踪剂 | Yeasen Company | 40718 | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | MCE | HY-K0301 |
| 多肽合成 | FBLIM1衍生多肽 | Nanjing TGpolypeptide Biotechnology Co. Ltd. | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Solarbio | P11995 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099141C | |
| DNA含量检测 | DNA含量检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | Q32854 |
| RNA定量 | RNA定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | R11490 |
| 组织染色 | H&E染色试剂 | Solarbio | G1120 |
| Masson三色染色试剂 | Solarbio | G1340 | |
| 胶原纤维染色试剂 | Solarbio | G1597 | |
| 番红O染色试剂 | Solarbio | G2540 | |
| 细胞培养 | Percoll分离液 | -- | -- |
| 内皮细胞生长培养基 | Lonza | -- | |
| 细胞转染 | 聚凝胺 | -- | -- |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| 增强化学发光液 | -- | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | -- | -- |
| SYBR Green PCR预混液 | -- | -- | |
| 免疫组织化学 | DAB底物试剂盒 | Vector Laboratories | -- |
| 支架制备 | 溴化锂 | -- | -- |
| 1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 | -- | 2 | |
| N-羟基琥珀酰亚胺 | -- | 5 | |
| MES缓冲液 | -- | 0.1 | |
| 动物实验 | 青霉素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| scRNA-seq分析 | 样本收集:正常和UD子宫内膜组织;测序平台:10X Genomics;质量控制标准:nFeature_RNA 200-2500,线粒体含量<5%。 阅读提示:Methods部分:'The scRNA processing'和'Bioinformatics analysis of scRNA-seq data' |
| BSBs制备 | 琼脂糖浓度:2%;定向冷冻时间:3分钟;冻干时间:24小时;SF溶液浓度:15 w/v%。 阅读提示:Methods部分:'Preparation for Aqueous SF Solution'和'Fabrication of BSBs' |
| 细胞培养与共培养 | uSMCs和HUVECs接种密度:1×10^7 cells/mL;培养时间:6小时;培养基:DMEM/F12、EGM-2。 阅读提示:Methods部分:'Cell culture'和'Preparation for Different Cell-Laden BSBs' |
| FBLIM1功能验证 | 转染条件:MOI=100,polybrene 5 μg/mL;检测时间:转染后72小时;检测蛋白:SMA、CALD1、SMTN、CNN1。 阅读提示:Methods部分:'Cell Differentiation Tests'和'Western blot assay' |
| 外泌体提取与表征 | 超速离心条件:100,000×g,90分钟,4°C;表征方法:NTA、TEM、Western blot标记物CD63和TSG101;最佳浓度:60 μg/mL。 阅读提示:Methods部分:'Exosomes extraction'和'Preparation of BSBs@exo@poly' |
| 大鼠UD模型建立与治疗 | 动物品系:雌性SD大鼠,体重220-250 g;损伤深度:50-70%壁厚;直径:1-2毫米;治疗时间:14天;分组:六组。 阅读提示:Methods部分:'UD Model Construction and Treatment' |