AjCTP1/2和受体的克隆与系统发育分析
鉴定并确认海参中CT型神经肽前体及其候选受体的序列与进化关系。
通过RACE克隆获得AjCTP1、AjCTP2、AjCTR、AjPDFR1、AjPDFR2的cDNA序列,并进行序列比对、结构域预测、磷酸化位点预测和系统发育树构建,以及基因共线性分析。
Functional characterization of neuropeptides that act as ligands for both calcitonin-type and pigment-dispersing factor-type receptors in a deuterostome.
包括受体药理学实验(CRE/SRE/luciferase、cAMP检测、受体内化、Western blot)、体外肌肉/肠道松弛实验、体内药理注射与RNAi敲低实验,以及qRT-PCR和免疫组化等多层级验证。
HEK293T细胞(异源表达受体) 仿刺参纵肌制备物 仿刺参肠道制备物 仿刺参(成体与幼体)
AjCT1和AjCT2(10^-6 M)在HEK293T细胞中激活AjCTR、AjPDFR1、AjPDFR2的CRE和SRE报告基因活性,且AjCT2对SRE活性的激活在AjPDFR2中仅AjCT2有效。 cAMP积累实验证实AjCT1和AjCT2(10^-9–10^-5 M)以剂量依赖方式激活三种受体,且AjCTR介导的cAMP最大值高于AjPDFR1和AjPDFR2。 在体药理实验中,AjCT1/AjCT2注射浓度分别为5×10^-3 mg/mL(低剂量)和5×10^-1 mg/mL(高剂量),注射体积为1 μL/g湿重,实验持续24天。 肌条实验中,AjCT1和AjCT2引起纵肌剂量依赖性松弛(10^-10–10^-6 M),AjCT2引起肠道松弛(10^-9–10^-5 M),而AjCT1对肠道无作用。 RNAi敲低:siAjCTP1/2-1和siAjPDFR2-1显著降低WGR和SGR,并影响生长因子基因表达(如AjGDF-8上调、AjMegf6下调)。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定并确认海参中CT型神经肽前体及其候选受体的序列与进化关系。
通过RACE克隆获得AjCTP1、AjCTP2、AjCTR、AjPDFR1、AjPDFR2的cDNA序列,并进行序列比对、结构域预测、磷酸化位点预测和系统发育树构建,以及基因共线性分析。
验证AjCT1和AjCT2是否能激活三种候选受体并检测下游信号通路。
在HEK293T细胞中分别转染AjCTR、AjPDFR1、AjPDFR2,使用CRE-Luc和SRE-Luc报告基因检测cAMP和Ca2+信号,ELISA检测cAMP积累,观察受体内化,并用Western blot检测ERK1/2磷酸化。
检测AjCTP1/2和受体基因在不同组织中的表达水平,并通过免疫组化定位神经肽。
利用qRT-PCR检测五种组织中的转录本表达,利用ArCT抗血清进行免疫组化染色。
检测AjCT1和AjCT2对纵肌和肠道制备物的松弛作用。
分离纵肌和肠道制备物,以乙酰胆碱(ACh)诱导收缩后,累积添加AjCT1或AjCT2并记录松弛反应。
评估长期注射AjCT1和AjCT2对海参摄食和生长的影响。
将150只海参随机分为五组(CT1L、CT1H、CT2L、CT2H、CO),隔日注射肽或无菌海水,持续24天,记录体重、残饵和粪便量,并检测肠道生长因子基因表达。
通过敲低AjCTP1/2或AjPDFR2验证其在摄食和生长调控中的作用。
设计siRNA并注射海参,检测干扰效率,然后进行长期敲低实验,测量体重、残饵、粪便及生长因子基因表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 受体克隆与质粒构建 | SMARTer RACE 5'/3'试剂盒 | Takara | 634858 |
| 细胞培养 | HEK293T细胞 | Procell | CL-0005 |
| 质粒构建 | pcDNA 3.1(+)载体 | YouBio | VT1001 |
| pEGFP-N1载体 | YouBio | VT1110 | |
| Western blot | 抗磷酸化ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 |
| 抗ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG抗体 | Absin | abs20040 | |
| 免疫组化 | ArCT抗血清 | -- | RRID:AB_2721239 |
| 过氧化物酶标记的亲和纯化山羊抗兔IgG | Jackson ImmunoResearch | 111-035-003 | |
| 配体合成 | AjCT1神经肽 | Sangon biotech | -- |
| AjCT2神经肽 | Sangon biotech | -- | |
| 信号通路抑制 | FR900359 | Cayman Chemical | 107530-18-7 |
| Gö 6983 | Cayman Chemical | 133053-19-7 | |
| H89 | Absin | 130964-39-5 | |
| cDNA合成 | Hifair III第一链cDNA合成预混液 | YEASEN | 11141ES60 |
| qRT-PCR | Hieff UNICON通用蓝qPCR SYBR Green预混液 | YEASEN | 11184ES08 |
| 报告基因检测 | 萤火虫荧光素酶报告基因检测试剂盒 | MK | MF4001 |
| cAMP检测 | cAMP检测试剂盒 | R&D systems | KGE002B |
| RNA提取 | Trizol RNA提取试剂 | Vazyme | -- |
| RNAi | Lipo6000转染试剂 | Beyotime | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 受体激活与信号通路检测 | HEK293T细胞系、转染质粒(pcDNA3.1+或pEGFP-N1)、肽浓度(10^-6 M)、抑制剂浓度(H89 10 μM、FR900359 1 μM、Gö 6983 1 μM)、cAMP检测浓度范围(10^-9–10^-5 M)、孵育时间(报告基因4小时,cAMP 15分钟,ERK 5分钟) 阅读提示:Materials and methods - 'Testing AjCT1 and AjCT2 as ligands for candidate receptors...' |
| 体外肌肉松弛实验 | 纵肌和肠道制备物长度(20 mm)、浴槽体积(20 mL)、静息张力(1.0 g)、ACh浓度(纵肌10^-6 M,肠道10^-5 M)、AjCT1/AjCT2浓度梯度、实验重复次数 阅读提示:Materials and methods - 'Analysis of the in vitro activity of AjCT1 and AjCT2...' |
| 体内药理实验 | 动物数量(每组30只)、分组(CT1L/CT1H/CT2L/CT2H/CO)、注射剂量(5×10^-3或5×10^-1 mg/mL,1 μL/g湿重)、注射频率(隔日)、实验时长(24天)、WGR和SGR计算公式 阅读提示:Materials and methods - 'Investigation of the in vivo pharmacological effects...' |
| RNAi敲低实验 | siRNA序列、siRNA浓度(20 μM)、转染试剂体积(20 μL Lipo6000)、注射剂量(1 μL/g湿重)、注射频率(每日)、敲低效率验证方法、实验时长(24天) 阅读提示:Materials and methods - 'Loss-of-function experiments by RNA interference (RNAi)' |
| 基因表达分析 | qRT-PCR内参基因(β-actin和β-tubulin)、分析方法(2^-ΔΔCT)、样本量(n=5或6)、免疫组化抗血清稀释度(1:2000-1:4000)、染色条件 阅读提示:Materials and methods - 'Total RNA extraction and quantitative real-time PCR (qRT-PCR) detection'和'Localization of CT-type neuropeptide expression...' |